| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2262205 = | 82 (0.720) | 7 (0.070) | 6/228 | NT | 8.9% | intergenic (+14/‑124) | fimV/truA | motility protein FimV/tRNA pseudouridine (38‑40)synthase |
| ? | NC_002947 | 2262242 = | 66 (0.620) | intergenic (+51/‑87) | fimV/truA | motility protein FimV/tRNA pseudouridine (38‑40)synthase | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CAAGCTCGACCTGGCCCGTGCCTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACA > NC_002947/2262056‑2262350 | caAGCTCGACCTGGCCCGTGCCTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAg > 1:2324552/1‑150 (MQ=255) atgcgggagtagccttcggccgcggattcggcggtagcggtgtcgatgatgtccaagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgg > 1:2669619‑M1/150‑150 (MQ=255) aacTCGACCTGGCCCGTGCCTATATCGACATGGGTGACAGCCATGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGTCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGc < 1:2253876/148‑1 (MQ=255) aGCTCGACCTGGCCCGTGCCTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGc < 1:973150/150‑1 (MQ=255) cgggagtagccttcggccgcggattcggcggtagcggtgtcgatgatgtccaagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgGGcc < 2:2070633‑M1/4‑1 (MQ=255) cTCGACCTGGCCCGTGCCTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCct < 2:838579/150‑1 (MQ=255) tCGACCTGGCCCGTGCCTATATCGACATGTGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCctc > 2:2860703/1‑150 (MQ=255) gggagtagccttcggccgcggattcggcggtagcggtgtcgatgatgtccaagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgGGc > 1:60226‑M1/146‑148 (MQ=255) gggagtagccttcggccgcggattcggcggtagcggtgtcgatgatgtccaagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgGGc < 2:60226‑M1/3‑1 (MQ=255) aCCTGGCCCGTGCCTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTg < 2:706338/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCGTGCCTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGc > 1:2714068/1‑150 (MQ=255) gCCCGTGCCTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCggg < 2:2640795/150‑1 (MQ=255) gCCCGTGCCTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCggg < 2:254420/150‑1 (MQ=255) gCCTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGAcc < 2:1761323/150‑1 (MQ=255) gCCTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGAcc > 1:94506/1‑150 (MQ=255) cgcggattcggcggtagcggtgtcgatgatgtccaagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgGGCctct > 2:144953‑M1/130‑136 (MQ=255) cgcggattcggcggtagcggtgtcgatgatgtccaagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgGGCctct < 1:144953‑M1/7‑1 (MQ=255) cTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCct > 1:86844/1‑133 (MQ=255) cTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCct < 2:86844/133‑1 (MQ=255) atatCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCg‑c‑gc < 2:1881334/150‑1 (MQ=255) atatCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCg‑c‑gc > 2:438242/1‑150 (MQ=255) aCATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGTT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGa > 2:2553113/1‑150 (MQ=255) aCATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGa > 1:1002339/1‑150 (MQ=255) cATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGaa < 2:1002339/150‑1 (MQ=255) tGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAaga < 2:94506/150‑1 (MQ=255) tGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTAGTCATTGATGGCGACGACCGGACGCGTCAGGAAGCCGAGGCTTTGCTGCATCCGCCCGG‑CTAATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGAAAA‑A‑GCCCCCGAAGAGGcc > 1:2996125/1‑150 (MQ=255) cggtgtcgatgatgtccaagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAaga < 1:1534051‑M1/33‑1 (MQ=255) cggtgtcgatgatgtccaagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAaga > 2:1534051‑M1/113‑145 (MQ=255) ccAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCa > 1:1276608/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCAt > 2:1911396/1‑150 (MQ=255) gatgatgtccaagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgg > 1:872283‑M1/106‑106 (MQ=255) gatgatgtccaagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgg < 2:872283‑M1/1‑1 (MQ=255) gatgatgtccaagagcatgaaacctgcggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgGGc > 1:2580869‑M1/106‑108 (MQ=255) gatgatgtccaagagcatgaaacctgcggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgGGc < 2:2580869‑M1/3‑1 (MQ=255) cgcgcgACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTgc < 1:978441/150‑1 (MQ=255) gcgcgACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTgcg > 1:1074200/1‑150 (MQ=255) gcgcgACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTgcg > 1:2826269/1‑150 (MQ=255) caagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcaagcaggtcaGGCCTCTTGGCTGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTgc > 2:1814912‑M1/100‑150 (MQ=255) gccATACTCGACGCAGTGGTCACGCATTGCGTCGACAGCTAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCA‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCGCTTGGCGGGCTGACCT‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAAt < 2:662885/148‑1 (MQ=255) tCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAagag < 1:1956042/124‑1 (MQ=255) tCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAagag > 2:1956042/1‑124 (MQ=255) ccTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTgc > 1:66385/1‑140 (MQ=255) ccTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTgc < 2:66385/140‑1 (MQ=255) cTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCgg > 1:1183074/1‑150 (MQ=255) cTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCgg < 1:1627782/150‑1 (MQ=255) cgacgaAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGAAAGCAGGTCAGGCCTCCTTGCTGGCTGACGG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCa < 1:1911396/150‑1 (MQ=255) ggTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGa < 2:1074200/150‑1 (MQ=255) aaGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGa < 2:1610936/146‑1 (MQ=255) aaGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGa > 1:1610936/1‑146 (MQ=255) aaGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCt > 1:135569/1‑150 (MQ=255) ggATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGc > 1:1953116/1‑107 (MQ=255) ggATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGc > 2:412692/1‑131 (MQ=255) ggATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGc < 1:412692/131‑1 (MQ=255) ggATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAg < 1:2498881/145‑1 (MQ=255) ggATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAg > 2:2498881/1‑145 (MQ=255) ggATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCGGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGc < 2:1953116/107‑1 (MQ=255) ggCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGtt < 2:1276608/150‑1 (MQ=255) cgacAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGt < 2:2714068/150‑1 (MQ=255) gacAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGtt > 1:149196/1‑150 (MQ=255) agccagcGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTtata < 2:149196/150‑1 (MQ=255) ccagcGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAAt > 2:1907751/1‑150 (MQ=255) gcGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATccc < 2:2324552/150‑1 (MQ=255) gacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAaga < 1:1922117‑M1/33‑1 (MQ=255) gacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAaga > 2:1922117‑M1/50‑82 (MQ=255) gAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCAtt > 1:1689167/1‑150 (MQ=255) gCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCg < 1:154228/150‑1 (MQ=255) ccGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGt > 1:2342460/1‑150 (MQ=255) ccGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGt > 1:1417614/1‑150 (MQ=255) cGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGaa > 1:67554/1‑72 (MQ=255) cGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGaa < 2:67554/72‑1 (MQ=255) cGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTa < 2:1183074/150‑1 (MQ=255) aTGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGcc < 2:2431942/114‑1 (MQ=255) aTGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGcc > 1:2431942/1‑114 (MQ=255) aTGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCca > 2:1501599/1‑150 (MQ=255) aTGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCca > 2:1432491/1‑150 (MQ=255) t‑ctcCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTTCGTACACCCCACAgg > 2:373495/1‑150 (MQ=255) t‑ctcCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTa > 2:582757/1‑139 (MQ=255) t‑ctcCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTa < 1:582757/139‑1 (MQ=255) ctcCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGt < 1:2553113/150‑1 (MQ=255) ctcCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGt > 1:2277926/1‑150 (MQ=255) ccGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTc < 2:2826269/150‑1 (MQ=255) ccGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTc > 2:2849259/1‑150 (MQ=255) cGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GGCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCa < 1:504901/150‑1 (MQ=255) tGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACATGTTTCATGct > 2:1405947/1‑150 (MQ=255) gTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGctct > 1:2418067/1‑150 (MQ=255) tCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCtt < 2:1334331/150‑1 (MQ=255) tCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCtt > 2:792464/1‑150 (MQ=255) tCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCtt < 1:2849259/150‑1 (MQ=255) tGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTgg > 1:2790610/1‑150 (MQ=255) aTGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGAc > 2:2308614/1‑150 (MQ=255) tGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGt > 1:2038755/1‑62 (MQ=255) tgcatgcgcgGGCCTCTTCGCGGGC‑G‑CGGTCAGCCCGCCAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGAc < 2:2848127‑M1/136‑1 (MQ=255) tgcatgcgcgGGCCTCTTCGCGGGC‑G‑CGGTCAGCCCGCCAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGAc > 1:2848127‑M1/11‑146 (MQ=255) aaGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGAcatca > 2:598047/1‑150 (MQ=255) aaGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGAcatca > 2:2485481/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACatcatc < 2:2418067/150‑1 (MQ=255) gCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACatcatc < 2:2625893/150‑1 (MQ=255) gCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACatcatc > 1:2625893/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACatcatc > 1:944117/1‑150 (MQ=255) gTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGGTCTTGGACATGATCGaaa > 2:609053/1‑148 (MQ=255) | CAAGCTCGACCTGGCCCGTGCCTATATCGACATGGGTGACAGCCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCT‑CTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCGCGCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACA > NC_002947/2262056‑2262350 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |