| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
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cTGGT‑CGAGGAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAg > 1:150211/1‑150 (MQ=255) ggT‑CGAGGAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGAATGCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTAAGcc > 1:1870562/1‑150 (MQ=255) ggT‑CGAGGAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCACAAGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGcc > 1:564388/1‑150 (MQ=255) gT‑CGAGGAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCg > 1:1519693/1‑150 (MQ=255) t‑CGAGGAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCTGCTGGTTGGTCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGAGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCgg > 1:1492144/1‑150 (MQ=255) gAGGAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTg < 1:2762621/58‑1 (MQ=255) gAGGAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAgg < 2:1458338/64‑1 (MQ=255) gAGGAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAgg > 1:1458338/1‑64 (MQ=255) aGGAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCGGGCg > 1:1095388/1‑150 (MQ=255) aGGAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCGGGCg > 2:577037/1‑150 (MQ=255) aGGAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAACCGCTTGAGGCTGCAGCTGAAGAT‑CGGCGCGGTGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGGTTGAACCGGGCg > 1:1134590/1‑150 (MQ=255) gAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGACTGTATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCGGGCGaa < 1:806679/150‑1 (MQ=255) aGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCa > 2:1811830/1‑130 (MQ=255) aGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCa < 1:1811830/130‑1 (MQ=255) gTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGGCTCCa > 1:1510546/1‑98 (MQ=255) ttGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCGGGCGAAGCaa > 2:1526577/1‑150 (MQ=255) | GCGCTCGGCACCGGTAATGAAGTCGTCCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAACTGGT‑CGAGGAAGTTGGCCAG‑‑‑CTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGC‑CAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCGGGCGAAGCAA > NC_002947/2453893‑2454187 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |