New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 3045948 | 86 (0.760) | coding (482/894 nt) | pstA | phosphate ABC transporter permease |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CCTGGCAGCGGTGTTCCTGGCCGAACTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATC > NC_002947/3045766‑3046063 | ccTGGCAGCGGTGTTCCTGGCCGAACTCGGCCCCTACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTC < 1:1867355‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGGTGTTCCTGGCCGAACTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCg > 1:2084424/1‑150 (MQ=255) cAGCGGTGTTCCGGGCCGAACTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCTTGGTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGTCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCAc < 2:1469745/150‑1 (MQ=255) 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gatgaCCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAG‑GTGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGc > 2:3009136/1‑150 (MQ=255) caccGGTACCTACTCggcaccggcaggcggcgtggcgctggcggtgctgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggcaggccagtgagcatcttggcggcaaagcgcgcagc > 1:2502309‑M1/1‑15 (MQ=255) caccGGTACCTACTCggcaccggcaggcggcgtggcgctggcggtgctgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggcaggccagtgagcatcttggcggcaaagcgcgcagc < 2:2502309‑M1/146‑132 (MQ=255) accGGTACCTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTg > 2:2999743/1‑150 (MQ=255) ccGGTACCTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGa > 2:2288175/1‑150 (MQ=255) gTACCTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGaa < 1:2275038/74‑1 (MQ=255) gTACCTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGaa > 2:2275038/1‑74 (MQ=255) gTACCTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGCCGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCACAGGAGAttt < 2:2140826/150‑3 (MQ=255) ccTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGAt < 1:1626415/79‑1 (MQ=255) ccTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGAt > 2:1626415/1‑79 (MQ=255) cTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggcaggc < 2:656380‑M2/106‑68 (MQ=255) cTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggc < 1:1555076‑M2/102‑64 (MQ=255) cTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggc > 2:1555076‑M2/1‑39 (MQ=255) cTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGaa > 2:512109/1‑150 (MQ=255) cTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGaa < 2:2324000/150‑1 (MQ=255) tACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAg > 1:2531937/1‑150 (MQ=255) tCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGt < 2:1308869/83‑1 (MQ=255) tCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGt > 1:1308869/1‑83 (MQ=255) tCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGATGCTGACTGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATc > 2:417807/1‑150 (MQ=255) tCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCCgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggcaggccagtgagcatcttggcggcaaagcgcgcagcgttggccagtttgc < 1:2156112‑M2/147‑113 (MQ=255) tCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCCgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggcaggccagtgagcatcttggcggcaaagcgcgcagcgttggccagtttgc > 2:2156112‑M2/1‑35 (MQ=255) | CCTGGCAGCGGTGTTCCTGGCCGAACTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAG‑GCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATC > NC_002947/3045766‑3046063 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |