New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3339160 = | 91 (0.790) | 7 (0.070) | 6/200 | NT | 9.7% | intergenic (‑119/+124) | PP_2935/ybiT | membrane protein/ABC‑F family ATPase |
? | NC_002947 | 3339248 = | 56 (0.600) | intergenic (‑207/+36) | PP_2935/ybiT | membrane protein/ABC‑F family ATPase |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
GACTGGCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGCCAGGCCGTCCCATCAATCAGACCAGCACACCCTGGCTA > NC_002947/3339011‑3339305 | gcgagttcgtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcc < 2:2138072‑M1/1‑1 (MQ=255) gagttcgtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcctc < 1:1688936‑M1/3‑1 (MQ=255) agttcgtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcctct > 2:2821669‑M1/147‑150 (MQ=255) gttcgtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCtt > 2:2156793‑M1/146‑150 (MQ=255) ggCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCtt < 1:716848/150‑1 (MQ=255) gggggCTGGTTTTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGGCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCTTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTcgc < 2:1505468/150‑1 (MQ=255) ggggCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGGCGTTCCGGGGGGTGGGTTGGGGAGGTACTCTTcgcg > 2:160355/1‑150 (MQ=255) tgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCgg > 2:2978052‑M1/141‑150 (MQ=255) gggCTGGTTGTTGCGGCTTGGTGGGTTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGAGTGTTGCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGATTTATTCGTCTGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATTTACTCTTCGCgg < 2:253261/150‑1 (MQ=255) gggCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCgg < 2:1173688/150‑1 (MQ=255) gggCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGCCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGCCAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCgg < 1:50943/150‑1 (MQ=255) gtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCggg > 2:1001244‑M1/140‑150 (MQ=255) ggCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCggg > 2:1288028/1‑150 (MQ=255) tcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactcaatgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGc > 1:692093‑M1/139‑150 (MQ=255) tcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgaataactgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGc > 1:692384‑M1/139‑150 (MQ=255) tcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgacgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGc < 1:2142826‑M1/12‑1 (MQ=255) cTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCt > 2:1279154/1‑150 (MQ=255) tGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCtt < 1:1895379/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCCCAAGCGTCCCATCCCTGTCCAGTGCCACTGTGAGAGATCGAACGCGCGAAGAGGCGCGGCCACCCgag > 2:1872135/1‑150 (MQ=255) aCGAATTATTCGTCGGGCCGTGCAGGTCGGTGGGATAGAGATGTACTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCCGGCCATCCGAGAt > 2:350948/1‑150 (MQ=39) cGAATTATTCGTCGGGCCGTGTCGGTCGGTGGGATGGGGATCTGATCTTTGGGGGCGTGTTCTCTCTCCCAAGGCCCCAGAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATg < 1:2218542/150‑1 (MQ=37) cGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATg < 2:1202018/150‑1 (MQ=255) gAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATgg > 1:2963438/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGCCAGGc > 1:520528/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGCCAGGc < 2:2124402/150‑1 (MQ=255) gtcgGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGCCAGGCCGt > 1:1274878/1‑150 (MQ=255) gCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGCCAGGCCGTccc > 1:580013/1‑148 (MQ=255) gCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGCCAGGCCGTccc < 2:580013/148‑1 (MQ=255) gCCGTGCAGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCAAAAGCGTCCAATAACTGTGCGGTCCCTGTGGGAGAGGGCAAGCCCACGAAAAGGCCCGGCCAACCGAGATGGCCAGGCCGTCCCat > 2:2164664/1‑150 (MQ=255) ctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGc < 1:1318679‑M1/70‑1 (MQ=255) ggtcggtGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAGGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCgg > 2:2451885/1‑93 (MQ=255) ggtcggtGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAGGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCgg < 1:2451885/93‑1 (MQ=255) gtcggtGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCtgt < 2:2262723/73‑1 (MQ=255) tcggtGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCgg < 1:2343358/91‑1 (MQ=255) tcggtGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCgg > 2:2343358/1‑91 (MQ=255) tcggtGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGCCAGGCCGTCCCATCAATCAGAcc < 2:2025316/150‑1 (MQ=255) tGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGCCAGGCCGTCCCATCAATCAGACCAGca < 2:520528/150‑1 (MQ=255) tgTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGCCAGGCCGTCCCATCAATCAGACCAGCACACCCTGGCTa > 2:147364/1‑150 (MQ=255) aCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGcc > 2:1290114/1‑110 (MQ=255) aCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGcc < 1:1290114/110‑1 (MQ=255) | GACTGGCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGCCAGGCCGTCCCATCAATCAGACCAGCACACCCTGGCTA > NC_002947/3339011‑3339305 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |