New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 4575602 | 140 (1.330) | intergenic (+76/‑46) | glgX/ybhP‑II | glycogen debranching enzyme/phosphohydrolase |
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
GCCGGAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGA > NC_002947/4575427‑4575723 | cggAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGt < 2:2820764/150‑1 (MQ=255) cggAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGt > 2:2276346/1‑150 (MQ=255) cggAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGATGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGTTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGt < 2:149201/150‑1 (MQ=255) 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gcAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGgt > 2:2499280/1‑150 (MQ=255) gcAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGgt > 1:783647/1‑150 (MQ=255) ggggCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTAc > 1:400152/1‑150 (MQ=255) gcagcaCCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTgg > 2:979928/1‑136 (MQ=255) cagcaCCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGc > 1:1187025/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) gccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCgg < 2:838067/150‑1 (MQ=255) gccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCgg > 1:2138557/1‑150 (MQ=255) aaaCCGtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacc > 2:118201‑M1/1‑6 (MQ=255) aaaCCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgtactatcga > 2:2801586‑M1/1‑6 (MQ=255) aaaCCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgtactatcga > 2:23187‑M1/1‑6 (MQ=255) aaaCCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTa < 1:2276346/150‑1 (MQ=255) aaaCCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCC‑‑ACCgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgtactatcgaat > 2:2751825‑M2/1‑31 (MQ=255) aaCCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgtactatcgaa < 1:2828614‑M1/150‑146 (MQ=255) aCCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtac < 2:35798‑M1/96‑93 (MQ=255) aCCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtac > 1:35798‑M1/1‑4 (MQ=255) aCCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGt > 2:359615/1‑78 (MQ=255) ccGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGa > 1:1651283/1‑150 (MQ=255) | GCCGGAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGA > NC_002947/4575427‑4575723 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |