| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5159824 | 39 (0.340) | 18 (0.210) | 15/182 | NT | 33.6% | intergenic (+39/+67) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 5159839 | 42 (0.490) | intergenic (+54/+52) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
AAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCC > NC_002947/5159678‑5159972 | aaGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAg > 2:2595709/1‑150 (MQ=255) ggggCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgat > 2:1230416‑M1/1‑145 (MQ=255) ggCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTc > 1:108914/1‑150 (MQ=255) cGAATTGTCGAGAGTTGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTTTATGCCCGGTTGTTGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGc < 2:1012442/150‑1 (MQ=255) aaTTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTa < 2:341896/150‑1 (MQ=255) tCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt < 2:679861‑M2/150‑2 (MQ=255) cGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt < 2:433838‑M2/149‑2 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTACGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGCAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgt > 2:2219322‑M2/1‑147 (MQ=255) gagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGCCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGCGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtag > 1:417994‑M2/1‑145 (MQ=255) ggCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagc < 1:1230416‑M1/150‑25 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg < 1:1332753‑M1/150‑27 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:326428‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 2:1982272‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTAGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCTGGTAAACTCTCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:1751847‑M2/1‑139 (MQ=255) aGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg > 1:2856480‑M2/1‑138 (MQ=255) cacaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggttt > 1:679861‑M2/1‑135 (MQ=255) acaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGGGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggttta < 2:2892155‑M2/150‑17 (MQ=255) caGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttac > 2:1876386‑M2/1‑133 (MQ=255) aGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCg < 1:2411827/125‑1 (MQ=255) aGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttaccc < 1:671069‑M2/147‑20 (MQ=255) aGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttaccc > 2:671069‑M2/1‑128 (MQ=255) ttGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCg < 1:1550157/125‑1 (MQ=255) ttGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCg > 2:1550157/1‑125 (MQ=255) gAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCg > 2:1513004/1‑119 (MQ=255) gAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtt > 2:1895104‑M2/1‑120 (MQ=255) gcaAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcggg > 2:122298‑M1/1‑100 (MQ=255) caAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacct < 2:877288‑M1/113‑15 (MQ=255) ggCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtagga < 1:1487075‑M1/117‑23 (MQ=255) gCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg < 2:158574‑M2/121‑13 (MQ=255) gCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg > 1:158574‑M2/1‑109 (MQ=255) tGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 2:1155968‑M2/1‑107 (MQ=255) tGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg < 1:1155968‑M2/118‑12 (MQ=255) tGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttac < 2:2393491‑M2/120‑18 (MQ=255) ccGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg < 1:2830388‑M2/111‑12 (MQ=255) ccGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 2:2830388‑M2/1‑100 (MQ=255) gtgGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGC‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcggg < 2:1119804‑M1/105‑28 (MQ=255) ggCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg < 1:595752‑M1/103‑27 (MQ=255) ggCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg > 2:595752‑M1/1‑77 (MQ=255) gCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg > 2:706010‑M1/1‑76 (MQ=255) ccaGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGt > 2:2869681/1‑150 (MQ=255) caGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTTGCTATTGTTGTAGGAGAGGGTTTACA‑CGCGAAAAGGACGGCATAGGCAAGACAGATCTCTCAGTGCGGACGGTa > 1:1995497/1‑150 (MQ=37) acCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggt < 2:843420‑M1/66‑29 (MQ=255) acCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggt > 1:843420‑M1/1‑38 (MQ=255) cgGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaaactgtgtaggagcggg > 1:899139‑M1/1‑31 (MQ=255) cTTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAg < 1:1612085/109‑1 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCaa < 1:1043280/82‑1 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCaa > 2:1043280/1‑82 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCt > 2:1090541/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaact > 2:671069‑M1/1‑19 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcgg > 1:2997354/1‑94 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactg > 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aaCCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctc < 1:1895104‑M1/134‑121 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgc > 2:1017614/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg < 1:1532796‑M1/39‑27 (MQ=255) aCCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg > 2:1532796‑M1/1‑13 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggt > 1:843420‑M2/1‑28 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgca > 1:2261749/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggct > 1:2856480‑M1/1‑12 (MQ=255) 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ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcg > 1:2449397/1‑86 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagc > 2:318395/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagc > 2:892941/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGACTGGCTCAACCTCCCGTCATGG‑CGGTACAGGCAACATAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagc > 1:1302865/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGGTCCTgcagca > 1:787025/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAac < 2:285390/66‑1 (MQ=255) tCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcc > 2:1487075‑M2/1‑22 (MQ=255) tCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcc < 1:1487075‑M2/117‑96 (MQ=255) cTACAacgatagcgaacctgtgtagaagcgggtgtacccgcgaaaaggcagcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactc > 2:985493‑M1/1‑5 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggcggcacaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtct < 1:79567‑M2/88‑69 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtct > 2:79567‑M2/1‑20 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGaaaa > 2:887966/1‑150 (MQ=255) aCAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttgcccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcgtacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctc > 2:2219322‑M1/1‑3 (MQ=255) cacaGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgca > 2:1407960/1‑139 (MQ=255) cacaGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAtcc > 1:2641882/1‑150 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGtt > 1:1010806/1‑132 (MQ=255) aacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctcg > 1:433838‑M1/1‑1 (MQ=255) | AAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCC > NC_002947/5159678‑5159972 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |