| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCG‑GGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGAT > NC_002947/5513142‑5513434 | gACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCG‑GGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGC > 1:1689673‑M1/1‑150 (MQ=255) gtcttgcccacgccgttgcggcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtgc < 1:125438‑M1/2‑1 (MQ=255) gtcttgcccacgccgttgcggcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtgc > 2:2524850‑M1/149‑150 (MQ=255) cttgcccacgccgttgcggcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtcgctgccgccgtagtgccctgtcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtgcct > 1:1149822‑M1/147‑150 (MQ=255) tGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCG‑GGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGT > 1:1628626‑M1/1‑150 (MQ=255) gCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCG‑GGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCC > 1:1734545‑M1/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCG‑GGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGG > 1:459034‑M1/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCG‑GGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGG > 2:1268823‑M1/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCG‑GGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGG > 2:483298‑M1/1‑150 (MQ=255) tcgtcgGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGAAGATGAGCG‑GGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGC < 1:203092‑M1/150‑1 (MQ=255) gtcgGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCG‑GGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCT < 2:2238923‑M1/150‑1 (MQ=255) gttgcggcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgcGCCTGTGCCGGCctct < 2:2756578‑M1/16‑1 (MQ=255) ggCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCG‑GGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT > 1:1733356‑M1/1‑150 (MQ=255) 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gtgtATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccgcgaagaggccggcacag > 2:2468262‑M2/1‑119 (MQ=255) gtgtATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGCGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCcg < 1:1405358/105‑1 (MQ=255) tcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTAcc < 2:1675997‑M1/87‑1 (MQ=255) tcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTAcc > 1:1675997‑M1/37‑123 (MQ=255) tCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTNCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTGATGCCATGGGGCGTTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTAGGCGCGTCGTGGCCGGGCCGGGCTCAGCATccc > 1:1576984/1‑150 (MQ=255) tGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccgcgaa < 1:1535030‑M2/123‑12 (MQ=255) cGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACa > 2:1106344/1‑64 (MQ=255) cGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACa < 1:1106344/64‑1 (MQ=255) gCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaa > 2:1806189‑M1/1‑50 (MQ=255) gCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaa < 1:1806189‑M1/117‑68 (MQ=255) cTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGaa < 1:2748621/150‑1 (MQ=255) cGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATACCATGGGGCGGTTTCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGCCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAATAActccc > 1:2437897/1‑148 (MQ=38) cGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACCGTGGGCGTAATGCCAt > 2:1953256/1‑73 (MQ=255) ggATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTca > 2:2468133/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGAt < 1:2314814/150‑1 (MQ=255) | GACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCG‑GGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGAT > NC_002947/5513142‑5513434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |