| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6009165 = | 6 (0.050) | 17 (0.200) | 12/178 | NT | 76.6% | intergenic (+6/+76) | norM/PP_5263 | multidrug resistance protein NorM/GGDEF domain‑containing protein |
| ? | NC_002947 | 6009242 = | 6 (0.070) | coding (1667/1668 nt) | PP_5263 | GGDEF domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GGCGGTGGTGCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCGGG > NC_002947/6009016‑6009222 | ggtgttgagagtgaagagcagctgacgttgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttag > 1:2349261‑M1/150‑150 (MQ=255)ggCGGTGGTGCAGTAGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGTTGTTTCGGCCTGACTTGCG < 2:2361592‑M1/150‑1 (MQ=255) tgtggagagtgaagagcagctgacgttgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaggg < 1:1964517‑M1/3‑1 (MQ=255) cGGTGGTGCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGTGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGG < 1:2869414‑M1/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTGCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGG < 1:1574742‑M1/150‑1 (MQ=255) ggtggtGCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGCCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGC > 1:1709358‑M1/1‑150 (MQ=255) tggagagtgaagagcagctgacgttgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGcc < 2:423116‑M1/5‑1 (MQ=255) tggtgCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAATGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCT < 1:77917‑M1/150‑1 (MQ=255) tggtgCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCT > 1:2457879‑M1/1‑150 (MQ=255) ggtgCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTC < 1:782596‑M1/150‑1 (MQ=255) gtgCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCT > 1:2561157‑M1/1‑150 (MQ=255) gtgaagagcagctgacgttgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTcg < 1:1215554‑M1/11‑1 (MQ=255) tgaagagcagctgacgttgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTcgc < 2:1246816‑M1/12‑1 (MQ=255) aGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGC < 2:2561157‑M1/150‑1 (MQ=255) ggATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCA > 1:1711565‑M1/1‑150 (MQ=255) gATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGG < 2:2015053‑M1/146‑1 (MQ=255) gATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTAGCAGATGATGCGGTTGTTGGGTAAGGCGAGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCAC < 1:371298‑M1/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGC > 1:3010596‑M1/1‑150 (MQ=255) tggtggGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCC > 1:1222767‑M1/1‑150 (MQ=255) tggtggGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGC < 1:2598922‑M1/140‑1 (MQ=255) tggtggGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGC > 2:2598656‑M1/1‑140 (MQ=255) tggtggGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGC > 2:2598922‑M1/1‑140 (MQ=255) gtggGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGC < 2:1711565‑M1/150‑1 (MQ=255) gacgttgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGc < 2:876734‑M1/24‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG < 1:2018731‑M1/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG < 1:247388‑M1/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGG < 1:1455947‑M1/120‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGG > 2:1455947‑M1/1‑120 (MQ=255) tGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG > 2:2810749‑M1/1‑150 (MQ=255) ggggCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTgcg < 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(MQ=255) cATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaccgcgcaatcct > 1:2526596‑M1/1‑136 (MQ=255) gaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCCCtgt < 1:747275‑M1/49‑1 (MQ=255) gtgCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaccgcgcaatcctgtg < 2:3018993‑M1/150‑18 (MQ=255) gtgCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaccgcgcaatcctgtg < 2:2526596‑M1/150‑18 (MQ=255) gtgCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGAGGATTAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCcctgtg > 1:160655‑M2/1‑144 (MQ=255) 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ccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCCCTGTgg > 2:747275‑M1/100‑150 (MQ=255) ccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCCCTGTgg > 2:1675902‑M1/100‑150 (MQ=255) cggcggTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaccgcgcaatcctgtggga < 2:3010596‑M1/150‑21 (MQ=255) cggcggTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaccgcgcaatcctgtggga < 2:1382140‑M1/150‑21 (MQ=255) cggcggTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCcctgtggga > 1:329009‑M2/1‑141 (MQ=255) 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2:2823926‑M1/57‑73 (MQ=255) gaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCa < 1:2823926‑M1/17‑1 (MQ=255) ggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttagg < 1:3036234‑M1/2‑1 (MQ=255) ggTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaccgcgcaatcctgtggga > 1:2172568‑M1/1‑80 (MQ=255) ggTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaccgcgcaatcctgtggga < 2:2172568‑M1/100‑21 (MQ=255) tatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCCCTGTGGGa < 2:2988476‑M1/53‑1 (MQ=255) tatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCCCTGTGGGa > 1:2988476‑M1/45‑97 (MQ=255) gCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaccgcgcaatcctgtgggagcggg < 2:2237801‑M1/99‑26 (MQ=255) gCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaccgcgcaatcctgtgggagcggg > 1:2237801‑M1/1‑74 (MQ=255) ggTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGC < 1:1644715‑M1/48‑1 (MQ=255) ggTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGC > 2:1644715‑M1/1‑48 (MQ=255) tACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCcctgt < 2:2970‑M2/79‑6 (MQ=255) gccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 2:2697520‑M1/33‑1 (MQ=255) gccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 1:2697520‑M1/23‑55 (MQ=255) agttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCCCTGTgg > 2:2760633‑M1/20‑70 (MQ=255) agttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCCCTGTgg < 1:2760633‑M1/51‑1 (MQ=255) gagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCggg > 1:1624023‑M1/15‑72 (MQ=255) gagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCggg < 2:1624023‑M1/58‑1 (MQ=255) gCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCgg < 2:2000224/53‑1 (MQ=255) gCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCgg > 1:2000224/1‑53 (MQ=255) ttCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaccgcgcaatcctgtg < 1:1777027‑M1/54‑18 (MQ=255) ttCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaccgcgcaatcctgtg > 2:1777027‑M1/1‑37 (MQ=255) | GGCGGTGGTGCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑ATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCGGG > NC_002947/6009016‑6009222 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |