New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 395240 | 133 (1.160) | 8 (0.070) | 8/232 | NT | 5.9% | coding (619/1200 nt) | fdhA | formaldehyde dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 395249 | 131 (1.200) | coding (628/1200 nt) | fdhA | formaldehyde dehydrogenase |
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
AAAGATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAGTGGACTGCG > NC_002947/395101‑395396 | aaaGATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGg < 1:1873198‑M2/150‑2 (MQ=255) gATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGgcgc > 2:2273414‑M2/1‑146 (MQ=255) gATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGgcgc < 2:137111‑M2/150‑5 (MQ=255) gTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCt < 1:322122/150‑1 (MQ=255) tgacctgaccTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGCGTGCTGGCGCCGCCCTCGGCAGCACTGCATACGCCGCGGGTGCTAGTTCGGTCGGCATGGCCGCCGCTTCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCtg < 1:2227131/150‑1 (MQ=255) gacctgacctGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCtgt < 1:133143/150‑1 (MQ=255) acctgacctgCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCtgtg > 1:849782/1‑150 (MQ=255) ctgacctgCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTa > 2:2502682/1‑150 (MQ=255) tgacctgCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTaa < 1:2320219/150‑1 (MQ=255) tgacctgCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTaa > 1:928332/1‑150 (MQ=255) acctgCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAAtc < 2:1766123/150‑1 (MQ=255) ctggctgTCTGACATCCTTCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAAtcgt > 2:1582480/1‑150 (MQ=255) gcctgTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAAtcgtcg > 2:1143134/1‑150 (MQ=255) cctgTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGTGACTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCgg > 1:1727260/1‑150 (MQ=255) cctgTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCgg < 2:2138914/150‑1 (MQ=255) gTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGa < 1:2896966/150‑1 (MQ=255) tCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGAc < 2:1025420/150‑1 (MQ=255) ccGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGAcc < 1:2502682/150‑1 (MQ=255) cGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCt > 2:2577502/1‑150 (MQ=255) cATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGaa < 1:1407129/150‑1 (MQ=255) tCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGt < 1:1856978/140‑1 (MQ=255) tCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGt > 2:1856978/1‑140 (MQ=255) tGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCgg > 2:511729/1‑150 (MQ=255) aCCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGcc < 1:1490370/147‑1 (MQ=255) aCCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGc > 1:1576081/1‑150 (MQ=255) ggCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCATGCTGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTg > 1:1781061/1‑150 (MQ=255) ggCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTATACCTTTCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTg < 1:675619/150‑1 (MQ=255) aTCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGACAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTCGGCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCTGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGccc > 2:464291/1‑150 (MQ=255) 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gccgccGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCg < 2:1452686/97‑1 (MQ=255) gccgccGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCg > 1:1452686/1‑97 (MQ=255) cTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACa > 2:1961827/1‑141 (MQ=255) cTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACa < 1:1961827/141‑1 (MQ=255) cTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCg > 2:2494296/1‑150 (MQ=255) tGCCTCGGCGCGCCTGCTGGgcgccgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacagtgctgcctggaccaacgccagcagtcacggcaccgtgatagccggtgggcaggatgtcggacaggcaggtcag > 1:1065765‑M2/1‑20 (MQ=255) tGCCTCGGCGCGCCTGCTGGgcgccgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacagtgctgcctggaccaacgccagcagtcacggcaccgtgatagccggtgggcaggatgtcggacaggcaggtcag < 2:1065765‑M2/150‑131 (MQ=255) ccTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGc < 1:1249791/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGCGCCTGCTGGgcgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacagtgctgcctggaccaacgcca > 2:1582171‑M2/1‑17 (MQ=255) cTCGGCGCGCCTGCTGGgcgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacagtgctgcctggaccaacgcca < 1:1582171‑M2/91‑75 (MQ=255) cTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGCNNAATCGTCGGNGACCNGAANCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTTCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGAGCTTCTGGGCGAGcc > 1:2873046/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCGCCTGCTGGgcgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacag < 1:1229948‑M2/70‑55 (MQ=255) tCGGCGCGCCTGCTGGgcgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacag > 2:1229948‑M2/1‑16 (MQ=255) tCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGTCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCg > 1:1981557/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCTACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCg > 1:1274771/1‑150 (MQ=255) cGGCGCGCCTGCTGGgcgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacagtgctgc > 1:454617‑M2/1‑15 (MQ=255) cgcgcCTGCTGGGCGCCCCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGCCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAg < 2:2873046/150‑1 (MQ=255) cgcCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGACGGAAGTg < 1:1216890/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAGTGGa < 2:1727260/150‑1 (MQ=255) atctctgGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGTCCTCGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAGTGGa < 2:2860620/146‑1 (MQ=255) tgctgGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAGTGGACt < 2:196528/150‑1 (MQ=255) tgctgGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAGTGGACt < 1:1272085/150‑1 (MQ=255) ctgGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAg < 2:2712751/93‑1 (MQ=255) ctgGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAg > 1:2712751/1‑93 (MQ=255) tgGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAGTGGACTgcg > 1:2424089/1‑150 (MQ=255) tgGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAACGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAGTGGACTgcg < 1:1143134/150‑1 (MQ=255) cgggCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAGTGGACTgcg < 2:2866884/149‑1 (MQ=255) | AAAGATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAGTGGACTGCG > NC_002947/395101‑395396 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |