| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1126618 | 36 (0.310) | 11 (0.120) | 8/202 | NT | 25.1% | intergenic (‑67/+83) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 1126634 | 36 (0.380) | intergenic (‑83/+67) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCG > NC_002947/1126486‑1126783 | gCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATc > 1:985910‑M2/1‑149 (MQ=255)cgacgtgttcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatccggccgcctgatagccctctccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATc > 2:2397950‑M1/113‑150 (MQ=255) ccGACCGTGGGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGATCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcg > 1:438606‑M2/1‑148 (MQ=255) cgtgttcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCa > 2:1735128‑M1/110‑150 (MQ=255) tcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggcGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTcgc > 2:580923‑M1/105‑150 (MQ=255) gtgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcg > 1:1552998‑M2/1‑140 (MQ=255) cggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTcgcg > 1:1677756‑M1/104‑150 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 2:866010‑M2/1‑139 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 2:1013205‑M2/1‑139 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 1:1789481‑M2/1‑139 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTATTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 2:454218‑M2/1‑139 (MQ=255) ggggaGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcatttcgac > 1:2410412‑M2/2‑139 (MQ=255) ggAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggt > 2:1928315‑M2/1‑137 (MQ=255) cTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaac > 2:2416694‑M2/1‑133 (MQ=255) cTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaac > 2:1675199‑M2/1‑133 (MQ=255) tGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGGTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacc < 2:2403204‑M2/150‑19 (MQ=255) cgatgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 1:1047850/149‑1 (MQ=255) cgatgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 2:1047850/1‑149 (MQ=255) tgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGCGACATGAGAAAATCGCCCCGTGTGGTTGGGTGGACATTGGGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcaca < 1:2215196/150‑1 (MQ=25) gccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACag < 2:2352286/150‑1 (MQ=255) aaCAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAATCCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCAC < 1:2403204‑M1/150‑1 (MQ=255) ggTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg < 1:1825630‑M2/116‑12 (MQ=255) ggTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 2:1825630‑M2/1‑105 (MQ=255) gTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 2:643158‑M2/1‑104 (MQ=255) gTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg < 1:643158‑M2/115‑12 (MQ=255) gAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCa > 2:451715/1‑150 (MQ=255) aaGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAg > 2:1231139‑M2/1‑149 (MQ=255) aGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAgg > 1:2910771‑M2/1‑148 (MQ=255) gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAggt > 1:2100453‑M2/1‑147 (MQ=255) gCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcg < 2:2731450‑M2/105‑11 (MQ=255) gCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcg > 1:2731450‑M2/1‑95 (MQ=255) ttcAGTGAGAGTTGGACCTCCTAACAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCATGTAGGCGCGGGTTTACCCACGAATGGGGAAGTATAGCCACCATCGAATTCGCGGGTATACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAggtggcg > 2:476781‑M2/2‑143 (MQ=255) cTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAggtggcg > 1:783413‑M2/1‑143 (MQ=255) aCATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAggg < 1:295085/150‑1 (MQ=255) tgtgGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGa < 1:1703076/144‑1 (MQ=255) tgGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcggg > 2:566704‑M2/1‑82 (MQ=255) 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CGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCg < 1:342232‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggt > 2:3029365‑M2/1‑25 (MQ=255) GCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGa < 2:1721080‑M1/150‑1 (MQ=255) gAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggcccctccagctcccacacg < 2:169754‑M2/150‑128 (MQ=255) aaTGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgac < 2:1999266‑M2/110‑89 (MQ=255) tGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggcccctccagctcccacacggtc < 1:2904862‑M2/150‑131 (MQ=255) GGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCTCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTg < 1:2188656‑M1/150‑1 (MQ=255) gAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGc < 2:556265/99‑1 (MQ=255) gAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGc > 1:556265/1‑99 (MQ=255) gAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGt > 1:1690873/1‑150 (MQ=255) gTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACACAGCCCTCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGa > 1:2531314/1‑150 (MQ=255) gTATAGACACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGa > 1:778118/1‑150 (MQ=255) taGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACGCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGAccc > 2:1368288/1‑150 (MQ=255) taGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCtggcttgggtggcgg < 2:1808601‑M1/67‑16 (MQ=255) taGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCtggcttgggtggcgg > 1:1808601‑M1/1‑52 (MQ=255) taGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAg < 2:110211/92‑1 (MQ=255) taGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAg > 1:110211/1‑92 (MQ=255) aGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCg < 2:342232/150‑1 (MQ=255) gCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggcccctccagctcccacacggtcggcccgatgcgc > 1:778131‑M2/1‑8 (MQ=255) ccaccaTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCtcga < 2:2977339/96‑1 (MQ=255) ccaccaTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCtcga > 1:2977339/1‑96 (MQ=255) accaTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCg > 2:2731530/1‑150 (MQ=255) caTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTAGCGATTTACGGGCGGTAGCACAGCAGGTTGCGGTCGACGAACATGGTGTCGACCCGGCGGAc > 2:347067/1‑150 (MQ=255) tCGCATTCGCGGGTAAAGCAGCACCTACACAGAGCCAGCAACGCAAGCAAGGTGATGGGGATGACTAGCAAGCCGGCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGGACACAAGGTTGCGGTCGGAGAAAGCGTTGTCGACCGTGCCGACcg > 2:2796194/1‑150 (MQ=255) | GCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCG > NC_002947/1126486‑1126783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |