New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 1921438 = | 93 (0.850) | coding (834/963 nt) | PP_1720 | alcohol dehydrogenase |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GATGGGCGGACGCAAGTTCGAGCTGGACCTGGCCCAAGTGCTGGGCAAGCGTCTGGAAATTACCGGTTCCACCCTGCGCAACCGTGATGACGGCTTCAAGGCCGAGCTGTTGCGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCT > NC_002947/1921291‑1921582 | gATGGGCGGACGCAAGTTCGAGCTGGACATGGCCCAAGTGCTGGGCAAGCGTCTGGAAATTACCGGTTCCACCCTGCGCAACCGTGATGACGGCTTCAAGGCCGAGCTGTTGCGCGAACTTCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGa > 2:1290595/1‑150 (MQ=255) aTGGGCGGACGCAAGTTCGAGCTGGACCTGGCCCAAGTGCTGGGCAAGCGTCTGGAAATTACCGGTTCCACCCTGCGCAACCGTGATGACGGCTTCAAGGCCGAGCTGTTGCGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAg < 1:1338105/150‑1 (MQ=255) gCGGACGCAAGTTCGAGCTGGACCTGGCCCAAGTGCTGGGCAAGCGTCTGGAAATTACCGGTTCCACCCTGCGCAACCGTGATGACGGCTTCAAGGCCGAGCTGTTGCGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAggggt > 1:2166461/1‑149 (MQ=255) ggACGCAAGTTCGAGCTGGACCTGGCCCAAGTGCTGGGCAAGCGTCTGGAAATTACCGGTTCCACCCTGCGCAACCGTGATGACGGCTTCAAGGCCGAGCTGTTGCGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCgg > 1:2901170/1‑150 (MQ=255) ggACGCAAGTTCGAGCTGGACCGGGCCCAAGTGCTGGGCAAGCGTCTGGAAATTACCGGTTCCACCCTGCGCAACCGTGATGACGGCTTCAAGGCCGAGCTGTTGCGCGAACTTCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCgg < 1:1290595/150‑1 (MQ=255) catcaccagcttgcccgacacctggttggtctccagctcggcacacgccgcctgggcaaactccaccggataggtgtcgaccagctgcggcgacaaccgcccctcgGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCgg > 1:1805632‑M1/107‑150 (MQ=255) tcaccagcttgcccgacacctggttggtctccagctcggcatacgccgcctgggcaaactccaccggataggtgtcgaccagctgcggcgacaaccgcccctcgGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGtt < 1:1606583‑M1/46‑1 (MQ=255) gCAAGTTCGAGCTGGACCTGGCCCAAGTGCTGGGCAAGCGTCTGGAAATTACCGGTTCCACCCTGCGCAACCGTGATGACGGCTTCAAGGCCGAGCTGTTGCGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGt > 1:439204/1‑150 (MQ=255) ccagcttgcccgacacctggttggtctccagctcggcatacgccgcctgggcaaactccaccggataggtgtcgaccagctgcggcgacaaccgcccctcgGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTc > 2:1606583‑M1/102‑150 (MQ=255) cAAGTTCGAGCTGGACCTGGCCCAAGTGCTGGGCAAGCGTCTGGAAATTACCGGTTCCATCCTGCGCAACCGTGATGACGGCTTCAAGGCCGAGCTGTTGCGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTc < 1:1573080/150‑1 (MQ=255) cAAGTTCGAGCTGGACCTGGCCCAAGTGCTGGGCAAGCGTCTGGAAATTACCGGTTCCACCCTGCGCAACCGTGATGACGGCTTCAAGGCCGAGCTGTTGCGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTc < 2:1436487/150‑1 (MQ=255) aaGTTCGAGCTGGACCTGGCCCAAGTGCTGGGCAAGCGTCTGGAAATTACCGGTTCCACCCTGCGCAACCGTGATGACGGCTTCAAGGCCGAGCTGTTGCGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTcg > 1:1309856/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCTGGACCTGGCCCAAGTGCTGGGCAAGCGTCTGGAAATTACCGGTTCCACCCTGCGCAACCGTGATGACGGCTTCAAGGCCGAGCTGTTGCGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTcgccg > 1:2542855/1‑150 (MQ=255) 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tGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGcc > 1:1379556/1‑150 (MQ=255) cggccatacttgctgctgcagttcgcCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTg < 2:1805632‑M2/124‑1 (MQ=255) cggcagcaAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCtggtgatgg < 2:6452/131‑1 (MQ=255) cggcagcaAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCtggtgatgg > 1:6452/3‑133 (MQ=255) cagcagcaAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGt < 1:1486586/68‑1 (MQ=255) cagcagcaAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGt > 2:1486586/1‑68 (MQ=255) gcagcaAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAg < 1:950417/109‑1 (MQ=255) gcagcaAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGgt < 1:1868336/150‑1 (MQ=255) cagcaAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTa > 2:2106117/1‑142 (MQ=255) cagcaAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTa < 1:2106117/142‑1 (MQ=255) cagcaAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGgtg > 1:1602747/1‑150 (MQ=255) aaGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAg > 1:506753/1‑104 (MQ=255) aaGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAg < 2:506753/104‑1 (MQ=255) aGTATGGCCGGTCTTCGCCGAGGGGCGGTTGTAGCCGCCGCTGGTCGCTCACTATCCTGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGc < 2:728739/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGGCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGTTGTCGTGCAAGTTGATGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCgggg < 1:2770882/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCt < 2:2483161/150‑1 (MQ=255) ccGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTg < 2:1602747/150‑1 (MQ=255) cGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGcc < 2:2615120/62‑1 (MQ=255) cGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGcc > 1:2615120/1‑62 (MQ=255) gCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGc < 1:295856/150‑1 (MQ=255) ttcgcCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCt > 2:623122‑M2/6‑150 (MQ=255) gcCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGaccaacca > 1:700453‑M2/3‑86 (MQ=255) gcCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGaccaacca < 2:700453‑M2/84‑1 (MQ=255) | GATGGGCGGACGCAAGTTCGAGCTGGACCTGGCCCAAGTGCTGGGCAAGCGTCTGGAAATTACCGGTTCCACCCTGCGCAACCGTGATGACGGCTTCAAGGCCGAGCTGTTGCGCGAACTGCAGCAGCAAGTATGGCCGCTGTTCGCCGAGGGGCGGTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCT > NC_002947/1921291‑1921582 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |