New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2033772 = | 14 (0.120) | 12 (0.110) | 10/234 | NT | 39.1% | coding (1210/1665 nt) | pgi‑I | glucose 6‑phosphate isomerase |
? | NC_002947 | 2033794 = | 24 (0.220) | coding (1232/1665 nt) | pgi‑I | glucose 6‑phosphate isomerase |
GGCAAGAGCGTGCTGCAAGACGGTACCCCGGTGAAGACCGACACCGGGCCGGTGATCTGGGGCGGCGTGGGCTGCAACGGCCAGCATGCCTACCACCAGTTGCTGCACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAGCAGACATCGAAAA > NC_002947/2033646‑2033941 | ggcctttagcgcgcaattcggcttcggcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCggtg > 2:2963625‑M1/127‑150 (MQ=255) ggcctttagcgcgcaattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccggtttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCggtg > 2:1496548‑M1/127‑150 (MQ=255) ggcctttagcgcgcaattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcactaccggcacgatgaaatcggccggtg < 1:110026‑M2/2‑1 (MQ=255) gcctttagcgcgcaattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatccgcgccttgctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCggtgg > 2:1950184‑M1/126‑150 (MQ=255) gcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCggt > 2:1941848‑M1/93‑115 (MQ=255) gcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCggt < 1:1941848‑M1/23‑1 (MQ=255) tctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCGgtggtg > 2:2679808‑M1/64‑90 (MQ=255) tctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCGgtggtg < 1:2679808‑M1/27‑1 (MQ=255) gcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAg < 1:1417831‑M1/29‑1 (MQ=255) gcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAg > 2:1417831‑M1/47‑75 (MQ=255) gctgcACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGa < 1:1590976/150‑1 (MQ=32) ctgaACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGaa < 2:1732264/150‑1 (MQ=17) tgcACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCTGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAg > 2:2214923/1‑150 (MQ=17) gcACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGc < 2:2647384/150‑1 (MQ=32) gcACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGc < 1:1998821/150‑1 (MQ=32) gcACCAGGGCACCCAGTTGAATCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGc < 2:2596988/150‑1 (MQ=17) gggCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAAtt < 1:311389/150‑1 (MQ=32) gggCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAAtt > 1:1064876/1‑150 (MQ=32) aCCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTgcgc > 1:112610/1‑150 (MQ=32) cccAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTgcgcg < 1:1263526/150‑1 (MQ=32) ccAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTgcgcgc > 1:23254/1‑150 (MQ=32) aGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTa > 2:2836747/1‑150 (MQ=32) ctcaccaccggcacgatgaaatcggccggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGc > 2:1417831‑M2/30‑75 (MQ=255) ctcaccaccggcacgatgaaatcggccggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGc < 1:1417831‑M2/46‑1 (MQ=255) ttGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTaaa > 2:1352790/1‑150 (MQ=32) ttGATTCCGGCCGATTTCACCGCCACGCTGGCAAGCTGCAACCCGGGTGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGGGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTaaa < 1:2980132/150‑1 (MQ=11) tGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAg < 1:343020/150‑1 (MQ=32) caccaccggcacgatgaaatcggccggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCaga < 1:2679808‑M2/63‑1 (MQ=255) caccaccggcacgatgaaatcggccggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCaga > 2:2679808‑M2/28‑90 (MQ=255) ccaccggcacgatgaaatcggccggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCAAGGCGCGGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGc > 2:1950184‑M2/26‑150 (MQ=255) ttCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGcc > 2:2760862/1‑150 (MQ=32) caccggcacgatgaaatcggccggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCCGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGcc > 2:2963625‑M2/25‑150 (MQ=255) caccggcacgatgaaatcggccggTGGTGAGCTTCAAACCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGcc > 2:1496548‑M2/25‑150 (MQ=255) caCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTAGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGcc < 1:110026‑M1/148‑1 (MQ=255) tCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCt < 1:423082/150‑1 (MQ=32) accggcacgatgaaatcggccggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCcgc > 2:1941848‑M2/24‑115 (MQ=255) accggcacgatgaaatcggccggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCcgc < 1:1941848‑M2/92‑1 (MQ=255) ccggcacgatgaaatcggccggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTgg > 1:1967304‑M2/23‑103 (MQ=255) ccggcacgatgaaatcggccggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTgg < 2:1967304‑M2/81‑1 (MQ=255) ccggcacgatgaaatcggccggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCCGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTc < 1:2963625‑M2/128‑1 (MQ=255) CGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCATCa < 1:2819692‑M1/150‑1 (MQ=255) GGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGAt < 2:2732985‑M1/96‑1 (MQ=255) GGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGAt > 1:2732985‑M1/1‑96 (MQ=255) GGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCaa < 2:532321‑M1/150‑1 (MQ=255) GGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCaa > 1:324222‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCaa < 1:266025‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGCAGCAGAACCCAAAATCCGCGTtaagggcaacaaa < 2:659228‑M1/150‑7 (MQ=255) aTTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAg > 2:332405/1‑150 (MQ=32) aTTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAg > 1:2556843/1‑150 (MQ=32) aTTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAg < 1:642524/150‑1 (MQ=32) tttCATCGTGCCGGTGGTGCGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGaa < 2:354256/148‑1 (MQ=17) tttCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGaa > 1:354256/1‑148 (MQ=32) tttCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAGc > 2:143746/1‑150 (MQ=32) ttCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAGCa < 2:1892044/150‑1 (MQ=32) aTCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAGCAGAc > 1:1728790/1‑150 (MQ=32) tCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAGCAGACa > 1:873966/1‑150 (MQ=32) cGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAGCAGACAt < 1:2760862/150‑1 (MQ=32) gTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAGCAGACATc < 2:1168716/150‑1 (MQ=32) ggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAGCa < 1:75224‑M2/137‑1 (MQ=255) ggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAGCa > 2:75224‑M2/3‑139 (MQ=255) ggTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCCCAAGTCCGCAACGAAGCAGACATCGaaaa < 1:1950184‑M2/148‑1 (MQ=255) gTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGgc < 1:1931447‑M2/70‑1 (MQ=255) gTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGgc > 2:1931447‑M2/2‑71 (MQ=255) gTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAAtt > 2:825091‑M2/2‑113 (MQ=255) gTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAAtt < 1:825091‑M2/112‑1 (MQ=255) | GGCAAGAGCGTGCTGCAAGACGGTACCCCGGTGAAGACCGACACCGGGCCGGTGATCTGGGGCGGCGTGGGCTGCAACGGCCAGCATGCCTACCACCAGTTGCTGCACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCTCAACGAAGCAGACATCGAAAA > NC_002947/2033646‑2033941 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |