New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2159309 = | 132 (1.150) | 8 (0.080) | 7/226 | NT | 6.7% | coding (248/1245 nt) | fabF | beta‑ketoacyl‑ACP synthase II |
? | NC_002947 | 2159337 = | 99 (0.930) | coding (276/1245 nt) | fabF | beta‑ketoacyl‑ACP synthase II |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGCCGGGTTCGATCATCAACAT > NC_002947/2159191‑2159486 | cTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCa < 1:2709140/150‑1 (MQ=255) ccTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCa > 1:560908/1‑147 (MQ=255) ccTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCa < 2:560908/147‑1 (MQ=255) ccTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCg > 2:2712100/1‑150 (MQ=255) ccTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGCCACCg > 2:2176825/1‑150 (MQ=255) cTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGa > 2:2407299/1‑150 (MQ=255) cTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGCATAGGTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGc < 1:1611/150‑1 (MQ=255) gcggccctgaatcgtgcagggtgcggctggtttcttcgatgttggtcaaaccaccgatacccgagcccatggccacgccaatacgctcgcggttggcatcggtgaccTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAg < 1:1991744‑M1/29‑1 (MQ=255) aCCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAAc < 2:777998/150‑1 (MQ=255) aCCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAAc > 2:442024/1‑150 (MQ=255) ttttGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGa < 2:1127557/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGc < 1:2176825/150‑1 (MQ=255) ggcTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAg < 2:177134/123‑1 (MQ=255) ggTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGt < 1:2376612/150‑1 (MQ=255) ggTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGt > 2:2376612/1‑150 (MQ=255) ggTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGt > 2:2343772/1‑150 (MQ=255) ggTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGt > 1:450289/1‑150 (MQ=255) gTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTg < 2:874921/150‑1 (MQ=255) aaaGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCAcc > 1:2543681/1‑120 (MQ=255) aaaGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCAcc < 2:2543681/120‑1 (MQ=255) aaGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCa > 1:416740/1‑150 (MQ=255) ggCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGCAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATg > 2:2095330/1‑150 (MQ=255) gCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAGGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATgg < 1:1097889/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCTCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGc > 1:2397111/1‑150 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ttGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTa > 2:899247/1‑150 (MQ=255) atgttggtcaaaccaccgatacccgagcccatggccacgccaatacgctcgcggttggcatcggtgaccTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAg > 1:1131626‑M1/70‑98 (MQ=255) atgttggtcaaaccaccgatacccgagcccatggccacgccaatacgctcgcggttggcatcggtgaccTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAg < 2:1131626‑M1/29‑1 (MQ=255) aGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCggtg < 1:2712100/150‑1 (MQ=255) aGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCggtg < 1:150124/150‑1 (MQ=255) tACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCggtggt < 1:440016/150‑1 (MQ=255) tGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGcc < 2:473867/101‑1 (MQ=255) tGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGa > 2:104800/1‑150 (MQ=255) tGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGa < 2:450289/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGAc < 1:1800393/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGAc < 1:2430853/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCggtgg > 2:297753/1‑143 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caggccggcattacgcacggcctggaGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTg < 2:835279‑M2/34‑1 (MQ=255) caggccggcattacgcacggcctggaGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTg > 1:835279‑M2/27‑60 (MQ=255) CAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGttc < 2:2727715‑M1/150‑1 (MQ=255) CAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGttc < 1:1356049‑M1/150‑1 (MQ=255) GGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACAt > 2:2540567‑M1/1‑93 (MQ=255) GGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACAt < 1:2540567‑M1/93‑1 (MQ=255) CGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGt > 2:1356049‑M1/1‑150 (MQ=255) tGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGc < 1:1844642/150‑1 (MQ=255) gCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGcc > 2:2451467/1‑150 (MQ=255) gTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAATCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGCCgg > 2:2182795/1‑150 (MQ=255) tAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGCCggg > 1:523651/1‑150 (MQ=255) aaTGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACa < 1:922385/82‑1 (MQ=255) aaTGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGCCGGGt > 2:287866/1‑150 (MQ=255) aaTGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGACATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACa > 2:922385/1‑82 (MQ=255) ccGGCCTGGGGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCGGGACGGTGGGGGGGCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGCCGGGTTCGa < 1:287866/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCgg > 2:367904/1‑57 (MQ=255) ccGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCgg < 1:367904/57‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGCCGGGTTCGa < 1:2451467/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGAACAACGTCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGCCGGGTTCGa < 2:416740/150‑1 (MQ=255) cggcctggaGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGCCGGGTTCGat > 2:258124‑M2/10‑150 (MQ=255) ggaGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGCCGGGTTCGATCATCaa < 1:4385‑M2/147‑1 (MQ=255) gaGGTCACCGATGCCAATCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGCCGGGTTCGATCATCAAc < 1:2182795‑M2/148‑1 (MQ=255) ggTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGTTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGCCGGGTTCGATCATCAACAt < 1:1641489/150‑1 (MQ=255) | TCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCCGCATTTCGCCGTTCTTCGTGCCGGGTTCGATCATCAACAT > NC_002947/2159191‑2159486 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |