New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 2813357 = | 103 (0.900) | 5 (0.050) | 5/232 | NT | 5.1% | coding (499/1017 nt) | pheS | phenylalanine‑‑tRNA ligase subunit alpha |
? | NC_002947 | 2813386 = | 90 (0.830) | coding (528/1017 nt) | pheS | phenylalanine‑‑tRNA ligase subunit alpha |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TTGCCGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTGATCGATCGCGATATCAACTTCGCCGACCTCAAGGGC > NC_002947/2813238‑2813533 | ttGCCGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGa < 1:1264864/150‑1 (MQ=255) ccGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCa < 2:1179022/150‑1 (MQ=255) gAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATg < 2:302608/150‑1 (MQ=255) aaGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATgg > 2:936639/1‑150 (MQ=255) aGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGa < 1:695997/150‑1 (MQ=255) ccAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTcc < 1:818103/150‑1 (MQ=255) cAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCa < 2:556225/150‑1 (MQ=255) cAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCa > 1:556225/1‑150 (MQ=255) cAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCa > 2:1878374/1‑150 (MQ=255) cAGAAGTAGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTAGCCACCACCCCGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCa < 1:1980827/150‑1 (MQ=255) acgacTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCa < 2:1038781/150‑1 (MQ=255) gacTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATg > 2:2115214/1‑129 (MQ=255) gacTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATg < 1:2115214/129‑1 (MQ=255) ccACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAt > 2:339832/1‑150 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAtt > 1:2711692/1‑150 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAtt > 1:446560/1‑150 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAtt < 1:1951912/150‑1 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAtt > 2:1859662/1‑150 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAt < 1:2063137/149‑1 (MQ=255) 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aCTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATtgtgt < 1:1117521/150‑1 (MQ=255) cTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATtgtgtg > 1:2143025/1‑150 (MQ=255) cTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATtgtgtg > 1:814644/1‑150 (MQ=255) cTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATtgtgtg < 1:339832/150‑1 (MQ=255) ttCGACGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACCTGCTGCTGCGCACCCACACCCCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATAGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGc > 2:192502/1‑150 (MQ=255) 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cAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCACATTGTGTGCCCGGGCCGCGt > 1:238305/1‑150 (MQ=255) aaCATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGta > 1:823344/1‑150 (MQ=255) cATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGtata < 1:1769923/150‑1 (MQ=255) gagtcgcagcggtatacgcggcccgggcacacaatgcgaatgggcggctgggtggactccatggtcCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCAt > 2:2925815‑M1/67‑101 (MQ=255) gagtcgcagcggtatacgcggcccgggcacacaatgcgaacgggcggctgggtggactccatggtcCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGGCCAt < 1:2925815‑M1/35‑1 (MQ=255) cccTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCg < 1:2575663/150‑1 (MQ=255) 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gctgctgcGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTgat < 1:303527/150‑1 (MQ=255) atggtccgcacctgcaccggcgaggtgtgggtgcgGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTc > 2:2925815‑M2/36‑101 (MQ=255) atggcccgcacctgcaccggcgaggtgtgggtgcgGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCGTTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTc < 1:2925815‑M2/66‑1 (MQ=255) ctgcGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTgatcgat < 1:1859662/150‑1 (MQ=255) tgcGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTgatcgatc < 1:134408/150‑1 (MQ=255) gcacctgcaccggcgaggtgtgggtgcgGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTGATCGATcgcg > 1:1735022‑M2/29‑150 (MQ=255) GCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTGATCGATcgcg < 1:3029926‑M1/150‑1 (MQ=255) CACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGACTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTGATCGATCGCGa > 2:2207629‑M1/1‑150 (MQ=255) ACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTGATCGATCGCGat > 1:707432‑M1/1‑150 (MQ=255) ACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTGATCGATCGCGat < 1:1555595‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTGATCGATCGCGatat < 1:2154451‑M1/150‑1 (MQ=255) cTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCAc < 2:1033243/93‑1 (MQ=255) cTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCAc > 1:1033243/1‑93 (MQ=255) cTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTGATCGATCGCGATATCAACtt > 2:2641120/1‑150 (MQ=255) cGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTGATCGATCGCGATATCAACTTCg > 2:2988567/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGta > 1:2268157/1‑66 (MQ=255) ccGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGta < 2:2268157/66‑1 (MQ=255) gACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGc < 2:1741511/106‑1 (MQ=255) gACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGc > 1:1741511/1‑106 (MQ=255) gACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTgat < 2:379300/114‑1 (MQ=255) | TTGCCGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTGATCGATCGCGATATCAACTTCGCCGACCTCAAGGGC > NC_002947/2813238‑2813533 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |