New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 2864039 | 106 (0.930) | 7 (0.070) | 5/224 | NT | 6.3% | coding (1056/1194 nt) | gllR | HTH‑type transcriptional regulator GalR |
? | NC_002947 | = 2864053 | 110 (1.050) | coding (1070/1194 nt) | gllR | HTH‑type transcriptional regulator GalR |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
CCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTAAAGTAGG > NC_002947/2863906‑2864202 | ggCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTgccgctggca > 1:1461591‑M2/1‑140 (MQ=255) cTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcactg > 2:3046163/1‑150 (MQ=255) cTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcactg > 2:330989/1‑150 (MQ=255) tGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcactgc < 1:2702180/150‑1 (MQ=255) tGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcactgc < 2:1667035/150‑1 (MQ=255) gACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcactgcc > 2:380064/1‑150 (MQ=255) gcCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcactgcccggcac > 2:445744/1‑150 (MQ=255) cGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcactgcccggcaggc < 1:330989/150‑4 (MQ=255) cGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCcgcg > 1:47491/1‑150 (MQ=255) gtggAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATc > 1:1974635/1‑150 (MQ=255) gtggAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATc > 2:2589895/1‑150 (MQ=255) aaaGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGcc < 1:1935663/150‑1 (MQ=255) aaaGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGcc < 1:20397/150‑1 (MQ=255) aaGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCt > 1:1526975/1‑150 (MQ=255) aaGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCCCGCTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCt > 1:967560/1‑150 (MQ=255) gcTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTgccgctgg > 2:2583850‑M2/1‑107 (MQ=255) gcTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGTCCGCGCCATCGGcc < 2:468521/145‑1 (MQ=255) gcTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGTCCGCGCCATCGGcc > 1:468521/1‑145 (MQ=255) gcTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGcc < 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tGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTATCGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCa < 1:371655/150‑1 (MQ=255) tGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGCGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCa > 1:2521342/1‑150 (MQ=255) gATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAg > 2:2248696/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCa > 2:2945814/1‑150 (MQ=255) gCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGt > 1:746738/1‑150 (MQ=255) 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ttCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGt < 1:883229/137‑1 (MQ=255) ggACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTcgc < 1:1626321/150‑1 (MQ=255) ggACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTcgc < 2:2292521/150‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTg > 2:1258497/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCGACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGa < 1:1923350/150‑1 (MQ=255) 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tACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTgccgctggcgatctcgtaagccaactggtgcgcagacaccgccgccagcatgtccgaacgcaccagtaggccacggataaccgccagatcagcgctttccaccac > 2:723956‑M2/1‑32 (MQ=255) tACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTgccgctggcgatctcgtaagccaactggtgcgcagacaccgccgccagcatgtccgaacgcaccagtaggccacggataaccgccagatcagcgctttccaccac < 1:723956‑M2/137‑106 (MQ=255) cGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGc < 2:852782/150‑1 (MQ=255) gagaTTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCCGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCg > 1:11600/1‑150 (MQ=255) gagaTTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAATCACCGGCGGCAGTCgcgc > 2:2855753/1‑112 (MQ=255) gagaTTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAATCACCGGCGGCAGTCgcgc < 1:2855753/112‑1 (MQ=255) gaTTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGcc < 1:128218/128‑1 (MQ=255) gaTTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGcc > 2:128218/1‑128 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACGCCTgccgctggcaatctcgtaagccaactggtgcgcagacaccgccgccagcatgtccgaacgcaccagtaggccacggataaccgccagatcagcgctttccaccaccggccacggcgctgtcaggcccgc < 2:1141046‑M2/150‑130 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACGCCTgccgctggcaatctcgtaagccaactggtgcgcagacaccgccgccagcatgtccgaacgcaccagtaggccacggataaccgccagatcagcgctttccaccaccggccacggcgctgtcaggcccgc < 2:2885834‑M2/150‑130 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCTCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGc > 2:940468/1‑147 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCa < 2:2376687/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCa > 1:583996/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGACCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGc < 1:940468/147‑1 (MQ=255) cggcgAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCagga > 1:398138/1‑150 (MQ=255) gcgAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCaggagg < 2:1098567/150‑1 (MQ=255) gcgAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCAGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCaggagt < 2:2102134/150‑2 (MQ=255) gAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGt > 2:618244/1‑150 (MQ=255) cAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCgcgc > 2:2045825/1‑38 (MQ=255) cAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCgcgc < 1:2045825/38‑1 (MQ=255) cAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCag > 1:1432606/1‑138 (MQ=255) aCGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTaaa < 1:445744/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTaaa > 1:183005/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGAAGGTGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTaaa < 1:1493806/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAACAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTaaa < 1:435659/150‑1 (MQ=255) gCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCt > 1:1552634/1‑96 (MQ=255) tGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTAAAGTAgg < 1:1258497/150‑1 (MQ=255) | CCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTAAAGTAGG > NC_002947/2863906‑2864202 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |