New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4159113 = | 83 (0.730) | 9 (0.090) | 9/218 | NT | 11.2% | intergenic (+17/‑192) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4159201 = | 68 (0.660) | intergenic (+105/‑104) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCGTCAGCCCCAAAGGCA > NC_002947/4159052‑4159350 | ggggggCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcagg > 2:2665613/1‑150 (MQ=255) ggggggCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcagg < 2:1456938/150‑1 (MQ=255) ccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcagg > 1:1610594‑M1/62‑150 (MQ=255) gggggCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTCCCTCGCGACGCACTCGCCAGCTCAGGGGCCAGACGCTGGCCTAGAGGTGTGTGCTGCCCTTAAGACTGCAAGGCCCCTGTATGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcaggc < 2:2649299/150‑1 (MQ=255) gggggCCGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcaggc < 1:2184997/150‑1 (MQ=255) ttACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCa > 2:15799/1‑150 (MQ=255) tACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCaa < 1:865289/150‑1 (MQ=255) ccTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGt > 2:1663201/1‑150 (MQ=255) tGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCTGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGACGCCGGCAGGTCGGCCTCTAGGctt > 2:1428161/1‑150 (MQ=38) ggggTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGttttt < 2:287388/150‑1 (MQ=255) cAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGttt > 1:581260/1‑142 (MQ=255) cAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGttt < 2:581260/142‑1 (MQ=255) gAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGcc‑c > 2:3032842/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) aGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACg > 2:2725272/1‑150 (MQ=255) ggCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAtggtgg > 1:2769472/1‑98 (MQ=255) ggCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAtggtgg < 2:2769472/98‑1 (MQ=255) gCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAtggtgg < 1:1624134/97‑1 (MQ=255) gCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAtggtgg > 2:1624134/1‑97 (MQ=255) cccTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCAt > 1:1220903/1‑150 (MQ=255) gcgCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTC‑CAGCCAGTCCGCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCaa < 1:1724345/148‑1 (MQ=255) gagcgggtttacccgcgaagcagGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCaa < 2:1610594‑M2/127‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATg < 1:1801000/102‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATg > 2:1801000/1‑102 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATg > 1:2390564/1‑150 (MQ=255) tttacccgcgaagcagGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCACTGCATcc > 2:687782‑M2/17‑150 (MQ=255) cccgcgaagcagGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCGTCa < 1:1800949‑M2/138‑1 (MQ=255) ccgcgaagcagGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCGTCAg > 1:2673409‑M2/12‑150 (MQ=255) ccgcgaagcagGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCGTCAg > 1:46206‑M2/12‑150 (MQ=255) ccgcgaagcagGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCGTCAg < 2:342605‑M2/139‑1 (MQ=255) ccgcgaagcagGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCAACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCGTCAg > 1:1406398‑M2/12‑150 (MQ=255) ccgcgaagcagGCAGCTCGGTCTCAAGGATTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATTTGGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCACTGCATCCGTCAg > 1:993988‑M2/12‑150 (MQ=255) gcgaagcagGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCAACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCGTCAGcc < 2:1406398‑M2/141‑1 (MQ=255) gaagcagGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCGTCAGcccc < 2:788439‑M2/143‑1 (MQ=255) gcagGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCGTCAGCCCCaaa > 1:2976160‑M2/5‑150 (MQ=255) gcagCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCt < 2:2473209/110‑1 (MQ=255) gcagCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCt > 1:2473209/1‑110 (MQ=255) gcagCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCGTCAGCCCCAAAGGCa > 2:2984193/1‑150 (MQ=255) | GGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCC‑CCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCGTCAGCCCCAAAGGCA > NC_002947/4159052‑4159350 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |