New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 4455254 | 124 (1.080) | coding (1775/2178 nt) | PP_3950 | methyl‑accepting chemotaxis transducer |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
CCTCCGCCAGGCGCAGGCTGTTGTCGACGTCCTGCACGCCCTGCTCCATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCT > NC_002947/4455105‑4455401 | cctccGCCAGGCGCAGGCTGTTGTCGACGTCCTGCACGCCCTGCTCCATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCtcgt > 2:2480861/1‑150 (MQ=255) tccGCCAGGCGCAGGCTGTTGTCGACGTCCTGCACGCCCTGCTCCATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTTCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCtcgtcg > 2:1237079/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGTTGTCGACGTCCTGCACGCCCTGCTCCATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACcg > 2:2104919/2‑150 (MQ=255) cTGTTGTCGACGTCCTGCACGCCCTGCTCCATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAg < 2:1763968/150‑1 (MQ=255) tgttgtCGACGTCCTGCACGCCCTGCTCCATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGc > 2:1204816/1‑150 (MQ=255) cTGCACGCCCTGCTCCATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTc > 2:2315088/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCTCCATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGaa > 1:659068/1‑129 (MQ=255) gCCCTGCTCCATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGaa < 2:659068/129‑1 (MQ=255) gCCCTGCTCCATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGc > 1:1850702/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCTCCATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGGTTCGCCCTACAGGCTCTCGACCATGTGGGGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGGGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGc > 1:261540/1‑150 (MQ=255) cATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGACCAGGCTGAGCACCACATCTGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGcgccgc > 1:1722972/1‑150 (MQ=255) aTGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGc > 1:1654421/1‑107 (MQ=255) aTGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGAACCTCGTCGGc < 2:1654421/107‑1 (MQ=255) aGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGa < 1:2250443/150‑1 (MQ=255) gCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑Tc > 2:2366817/1‑147 (MQ=255) gCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑Tc < 1:2366817/147‑1 (MQ=255) gCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGAACGCGCCGCC‑TCGAt < 1:1504989/150‑1 (MQ=255) aCCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATggcg < 2:2404942/150‑1 (MQ=255) gCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCa < 1:1204816/150‑1 (MQ=255) gCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCa > 2:309678/1‑150 (MQ=255) 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gAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCg < 2:857798/150‑1 (MQ=255) aGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGCgtgccgccgacgacattcgccacatggtcgagagcctgcagggcgaaacccggcaggcggtaagcttcatggagc > 2:469381‑M2/1‑30 (MQ=255) gtgcgtgcGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGAtc < 1:2432466/150‑1 (MQ=255) tgcgGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGAc < 2:1380158/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGCGCTCCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATg < 2:951215/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATg > 1:2652540/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGTGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCAt < 1:42387/148‑1 (MQ=255) ccAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGc < 1:1928743/150‑1 (MQ=255) aGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGt < 1:1394492/125‑1 (MQ=255) aGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCgg < 1:313657/150‑1 (MQ=255) tGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCtggttgg > 1:2433718/1‑99 (MQ=255) tGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGAc > 1:1262491/1‑139 (MQ=255) gcgcACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTc < 2:261540/150‑1 (MQ=255) gcgcACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTc < 1:2055407/150‑1 (MQ=255) gcACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTCCGCTCATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGa < 1:2076314/150‑1 (MQ=255) aCCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGc < 1:1194575/150‑1 (MQ=255) ccTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGcc < 2:1749480/150‑1 (MQ=255) cTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGa < 1:280104/131‑1 (MQ=255) cTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCg > 1:1878675/1‑150 (MQ=255) cTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCg > 2:780933/1‑150 (MQ=255) tcgtcgGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCcagc > 1:2327321/1‑75 (MQ=255) tcgtcgGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGa < 1:2357565/103‑1 (MQ=255) tcgtcgGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGa > 2:2357565/1‑103 (MQ=255) tcgtcgGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGc > 1:1835713/1‑150 (MQ=255) cgtcgGCCACCACCGCGCAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTCCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCCACCATGCGGCTGTCGAGCCGcg < 2:39698/150‑2 (MQ=255) cgtcgGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCt < 1:2568032/150‑1 (MQ=255) | CCTCCGCCAGGCGCAGGCTGTTGTCGACGTCCTGCACGCCCTGCTCCATGAAGCTTACCGCCTGCCGGGTTTCGCCCTGCAGGCTCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCC‑TCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCT > NC_002947/4455105‑4455401 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |