| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4537557 = | NA (NA) | 9 (0.080) | 6/238 | NT | 21.3% | coding (848/1533 nt) | PP_4025 | transposase |
| ? | NC_002947 | = 4626669 | 34 (0.300) | coding (881/1533 nt) | PP_4091 | transposase | |||||
CGGTCTTGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGTGGTGTAATCGAACAGCACGACTTGTCGATCAGGCGGGCCACTGGCCTGCACCCACATCCAGGATTGACTGGTCGGATCACGATCCGGCTCTTTGAGCACCTGCACGCGAGTTTCA > NC_002947/4626520‑4626818 | cGGTCTTGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCA > 2:1982265‑M2/1‑150 (MQ=255)cGGTCTTGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCA < 2:851120‑M2/150‑1 (MQ=255)cGGTCTTGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCA > 1:851120‑M2/1‑150 (MQ=255)cGGTCTTGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCA > 2:2881836‑M2/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCCTTAGGCTGTACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCcagca < 2:411133/149‑1 (MQ=17) ttGCTCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCTAACATCCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAgg > 2:285499/1‑150 (MQ=12) ttGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAgg > 2:2396609/1‑150 (MQ=32) ttGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAgg > 2:2604729/1‑150 (MQ=32) ttGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAgg > 2:277361/1‑150 (MQ=32) ttGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAgg > 1:1805681/1‑150 (MQ=32) gCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGgcg > 1:2786885/1‑150 (MQ=32) gCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGCCATCAAACGGCACCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGgcg > 2:1781697/1‑150 (MQ=11) cccTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGgcgc > 2:2667435/1‑150 (MQ=32) ccTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCa < 2:1805681/150‑1 (MQ=32) ccTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCa < 2:2427584/150‑1 (MQ=32) ttAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGc > 2:1193597/1‑150 (MQ=32) tAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCg < 1:277361/150‑1 (MQ=32) ggCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGc < 2:425072/150‑1 (MQ=32) gCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGTTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCAcct > 1:2740136/1‑150 (MQ=17) gCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCAcct > 1:1405865/1‑150 (MQ=32) cACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAgccgcgcgcaggaggtgcc < 2:158541‑M2/150‑20 (MQ=255) cACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCAcctc < 1:1419793/150‑1 (MQ=32) cACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCAcctc > 1:527044/1‑150 (MQ=32) cACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCAcctc > 1:2821404/1‑150 (MQ=32) aCCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCAcctcc > 2:231410/1‑150 (MQ=32) aCCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCAcctcc > 2:2834405/1‑150 (MQ=32) ttCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAGCGGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTga > 1:26928/1‑149 (MQ=17) ttCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTgc < 2:1791626/150‑1 (MQ=32) ttCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTgc > 1:45343/1‑150 (MQ=32) tCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAgg > 2:463164/1‑131 (MQ=33) tCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAgg < 1:463164/131‑1 (MQ=33) cgcTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGcgcgcg > 1:2005537/1‑150 (MQ=32) cTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGc < 2:2567657/150‑1 (MQ=32) ttCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCt > 2:1325344/1‑150 (MQ=32) gacgaATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAgccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctgga > 1:855335‑M2/1‑116 (MQ=255) gacgaATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgct > 2:1397313‑M2/1‑116 (MQ=255) ccgaATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCCCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGNGATAGCCCTNCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCtggtg < 1:1013813/149‑1 (MQ=17) acgcATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTCGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCAGCACCTCCTGCGCGCGGCtggtg < 1:2132267/150‑1 (MQ=12) acgaATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCtggtg < 1:2495548/150‑1 (MQ=32) cgaATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCtggtgg < 1:1772667/150‑1 (MQ=32) gaATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAgccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggaggg > 1:158541‑M2/1‑113 (MQ=255) gaATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTggtggt < 2:2122011/150‑1 (MQ=32) gaATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTggtggt < 2:924670/150‑1 (MQ=32) tttACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGTGGTGTa > 1:2375153/1‑150 (MQ=32) 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caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgt < 2:1367850‑M2/150‑149 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgt < 2:1751693‑M2/150‑149 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgt < 1:1610742‑M2/150‑149 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgt < 1:1667071‑M2/150‑149 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgt < 1:1877925‑M2/150‑149 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgt < 2:1799997‑M2/150‑149 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgt < 1:521048‑M2/150‑149 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgt < 1:2453425‑M2/150‑149 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgt > 2:2658450‑M2/1‑2 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgt < 1:2889330‑M2/150‑149 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccg > 2:339727‑M2/1‑2 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccg < 1:339727‑M2/103‑102 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggc < 1:872019‑M2/93‑92 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggc > 2:872019‑M2/1‑2 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccg > 1:2289590‑M2/1‑2 (MQ=255) caccagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccg < 2:2289590‑M2/77‑76 (MQ=255) accagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtc < 2:2031475‑M2/150‑150 (MQ=255) accagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtc > 1:2371093‑M2/1‑1 (MQ=255) accagccgcgcgcaggaggtgccgctgcgcctgctggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtc > 2:1736612‑M2/1‑1 (MQ=255) accagccgcgcgcaggaggtgccgctgcacctggtcgagggctatcgcggttacgtgatgaccgatcagcacggcggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtc > 1:533199‑M2/1‑1 (MQ=255) | CGGTCTTGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGTGGTGTAATCGAACAGCACGACTTGTCGATCAGGCGGGCCACTGGCCTGCACCCACATCCAGGATTGACTGGTCGGATCACGATCCGGCTCTTTGAGCACCTGCACGCGAGTTTCA > NC_002947/4626520‑4626818 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |