| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,132,598 | A→G | 9.0% | D437D (GAT→GAC) | copA‑II ← | copper resistance protein A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,132,598 | 0 | A | G | 9.0% | 259.8 / 2.7 | 112 | D437D (GAT→GAC) | copA‑II | copper resistance protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/47); new base G (3/8); total (56/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCAT > NC_002947/6132450‑6132747 | tgtgGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGAt < 2:2993063/150‑1 (MQ=255) tgGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATcc < 1:857152/150‑1 (MQ=255) gTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGCTGCGAGACAGCCAAGCTGCCGGGAGCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCGTGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCAt > 1:835516/1‑150 (MQ=14) gTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGTTc > 2:2858553/1‑147 (MQ=255) gTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATc < 1:2858553/147‑1 (MQ=255) gTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCAt < 1:2122842/150‑1 (MQ=255) ccATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCACGCCATCTGGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGc < 2:2546009/150‑1 (MQ=255) cATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCTCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGcc > 1:3019360/1‑150 (MQ=255) cATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCAGCGGGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCAGGcc > 1:2941564/1‑150 (MQ=255) tatCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATTCCgg > 1:409578/1‑150 (MQ=255) tatCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCAAAATATACCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCgg > 1:79141/1‑150 (MQ=18) gCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCAtg > 2:1163274/1‑150 (MQ=255) ccATGCCGCCTTGGTCCATCCCATCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTATGATCCATGCCGGCCAtgc > 1:184889/1‑150 (MQ=255) cATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGa > 1:2440394/1‑133 (MQ=255) cgccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGa > 2:2382902/1‑128 (MQ=255) cgccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGa < 1:2382902/128‑1 (MQ=255) cgccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCAt > 2:713216/1‑150 (MQ=255) gTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCAt > 1:2193301/1‑150 (MQ=255) tCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGCCAATCACAACCAGTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATc > 1:1454881/1‑150 (MQ=21) ccATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATcc > 1:1288513/1‑150 (MQ=255) aTCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCa < 2:2797095/150‑1 (MQ=255) tCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCGATGCTGCCATGGTCCCTCCCAg > 2:2442412/1‑150 (MQ=255) cccAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGc < 1:2962439/150‑1 (MQ=255) cAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCa < 1:339608/150‑1 (MQ=255) cAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCAGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCa > 1:2011710/1‑150 (MQ=255) cATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCAtttt < 1:1292269/150‑1 (MQ=255) aTCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGTTCCATCCCAGCCATTTTg > 1:1011940/1‑150 (MQ=255) tCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATTCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCGTCCAAGCCATTTTGc > 1:2606939/1‑150 (MQ=255) tCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGc < 2:1288513/150‑1 (MQ=255) gCTATTGTCCATATCTGCCATGTCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTACTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTTCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCtgtg < 1:547940/150‑1 (MQ=18) aTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGTCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTc < 2:1819736/150‑1 (MQ=11) tGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGTTcc > 2:3017679/1‑150 (MQ=255) ggTCCATTTCGGCCATGCCTTCTTTTTCCATTCCTGCCTTGTTGCTGGGGTCCATCCCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCCGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCa < 2:3019360/150‑1 (MQ=14) gTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATgg > 1:2083822/1‑121 (MQ=255) gTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATgg < 2:2083822/121‑1 (MQ=255) ccATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGCCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCtg > 2:1049301/1‑140 (MQ=255) ccATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGCCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCtg < 1:1049301/140‑1 (MQ=255) cATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGcc < 1:2862240/150‑1 (MQ=255) atatCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTCTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCg < 2:534850/150‑1 (MQ=255) atatCAGCCATGTCGCCTTGGTCCATCCCTGCCATCTTGCGATGCTCCAAGACGGCCATGCCGCGGTGGTCCGTCTCAGCCATGTTGGGGTGGTCCATGTCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCg < 1:421958/150‑1 (MQ=17) tatCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATACCGGCCATGTTGCCATGGTCCATCCCAGCCATGTTGCTGTGGTCCAtacaga > 1:769699/1‑145 (MQ=14) tatCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCCGTGCACGGTGATGGGCATGCCGCCGTGGTCCATCGCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCgg > 1:534850/1‑150 (MQ=17) tCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCa > 2:1403566/1‑127 (MQ=255) tCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCa < 1:1403566/127‑1 (MQ=255) tCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTc > 1:457554/1‑150 (MQ=255) gCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCAt > 1:1866974/1‑125 (MQ=255) gCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCAt < 2:1866974/125‑1 (MQ=255) tGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGc > 1:841109/1‑150 (MQ=255) gccgccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGcc < 2:2511201/150‑1 (MQ=255) ccgccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCg > 1:1351340/1‑150 (MQ=11) cgccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATccc > 1:2076487/1‑112 (MQ=255) cgccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATccc < 2:2076487/112‑1 (MQ=255) cgccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGATGTCGTACATGCCGCCCATGCCGCAATGGTCCGAGTCAGCGAATTTGGTATTATTCGGGTCAGTCGGTGTGCCATGGTCCTTCCCAACCATTTGGCTGTCGTCCCTTCCGGCCATGGTGCCgg > 2:2651956/1‑149 (MQ=255) ccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTgg < 1:713216/150‑1 (MQ=255) cTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGt < 1:1558657/150‑1 (MQ=255) ttGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTAGATCTGAGGCACGTTGCTGTGGGCCATGCTGGCCATGCTGCCGTGGACCATCGCGGCCCCTGTGTGGTTGAAAATGACGGTCATGTTGCCGTGGTc > 2:244887/1‑150 (MQ=9) ggTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCa < 2:286837/150‑1 (MQ=255) gTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCAt > 1:2251830/1‑150 (MQ=255) tCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCAtt > 1:321992/1‑149 (MQ=255) tCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATAACGGCAATGCTGTCAACGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATc > 1:363226/1‑150 (MQ=17) tCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATTCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATACCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAg > 1:2776222/1‑150 (MQ=255) ccAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCAtt < 1:2998043/105‑1 (MQ=255) ccAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCAtt > 2:2998043/1‑105 (MQ=255) cAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCGATgccagcca > 2:1715149/1‑150 (MQ=255) caccTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCAtttt > 1:3058394/4‑150 (MQ=255) cATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGt < 2:2948876/134‑1 (MQ=255) cATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGt < 2:2949197/134‑1 (MQ=255) cATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGt > 1:2948876/1‑134 (MQ=255) cATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGt > 1:2949197/1‑134 (MQ=255) aTCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTg > 1:2075882/1‑150 (MQ=255) aTCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTg > 1:1798326/1‑150 (MQ=255) tGCTTTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCtgt < 2:794575/150‑1 (MQ=255) gCTGTGGTCCTTCCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCtgtg < 1:707945/150‑1 (MQ=11) gCTGTGCTCTATATCTGCCATGCCGCTGTCGCCCATCTCAGCCATTTTCCTTTCGTCCATTTCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCtgtg < 2:1366167/150‑1 (MQ=14) tgGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATACCGGTCATGTTGCCGTGGTCGATCCCAGCCATGTTGCTGTGGTcc > 2:113416/1‑150 (MQ=255) aTGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCg < 2:864796/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGTTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTTTGGTCCATGCCgg > 2:1797997/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCgg > 1:767680/1‑150 (MQ=255) gCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGc < 2:2075882/150‑1 (MQ=255) ggCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGc > 2:2399218/1‑131 (MQ=255) ggCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGc < 1:2399218/131‑1 (MQ=255) ccATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGt < 1:2848411/150‑1 (MQ=255) gccgccTTGGTCCATCTCAGTCATTTTGCGGTGATCCACGCGGGCCATGCAGCCCTGGTCCAACCGAGCCTTTTTGCTGTGGTCCATGTCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGcc < 2:184889/150‑1 (MQ=14) gccgTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCGGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTg > 2:1777367/1‑150 (MQ=255) ccgTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCCGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTgg < 1:244887/150‑1 (MQ=255) cgTGGTCCATCGCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCGTTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGt < 2:1071483/150‑1 (MQ=11) cgTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGt < 1:2442412/150‑1 (MQ=255) gTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCAt > 2:2413950/1‑150 (MQ=255) tCCATCTCAGCCATTTTTTTTTGTTACATGCCCGGCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCCGTGCCCCATGCGGGGCATGTCGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATc < 2:363226/150‑1 (MQ=14) ctcAGCCATTTTGCTGTGAGCCCTGCCCGGCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGc < 1:2651956/150‑1 (MQ=255) tcAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTgg < 2:8859/66‑1 (MQ=255) tcAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTgg > 1:8859/1‑66 (MQ=255) gCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCAtt > 1:559330/1‑150 (MQ=255) tttGCTGCGATCCATGCCGGCCATGCTGCCTTGGTCTTTCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCt < 2:767680/150‑1 (MQ=255) gCTGTGGTCCGTGCCGGCCATCCTGCCCGGGTCCAGCCCAGCCATTTTGGTGTGATCCATGGCGGTCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGTCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCtgtg < 2:1357316/150‑1 (MQ=11) tgtgATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCCAATTTCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCtgttat > 2:2546364/1‑147 (MQ=17) gtgATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTc < 1:2950471/150‑1 (MQ=255) tgATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGt < 1:2950946/121‑1 (MQ=255) tgATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGt > 2:2950946/1‑121 (MQ=255) aTCCCTGCCGGCCATGCTGCCCTGGTCCATCCCAGCCCTTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTCGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTTCATGCCGGCCATGTCCACGCAGCGCATACCAGCCATTTTGCCGTCGTccgt > 1:2172264/1‑148 (MQ=14) | TGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCAT > NC_002947/6132450‑6132747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |