| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 546,893 | G→T | 19.3% | G81C (GGC→TGC) | rpsG → | 30S ribosomal protein S7 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 546,893 | 0 | G | T | 19.3% | 260.2 / 43.2 | 108 | G81C (GGC→TGC) | rpsG | 30S ribosomal protein S7 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (46/41); new base T (9/12); total (55/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.10e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GGAAAGCGGCAAGAAGGCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGCGAACTGCTGGATGCTGCCGAAG > NC_002947/546745‑547040 | ggAAAGCGGCAAGAAGGCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTcgg < 2:2772284/150‑1 (MQ=255)ggAAAGCGGCAAGAAGGCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTcgg > 2:2880756/1‑150 (MQ=255) aaaGCGGCAAGAAGGCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTctgcg < 2:810966/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |