Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,632,137 | T→A | 5.2% | P283P (CCT→CCA) ‡ | lepA → | elongation factor 4 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,632,137 | 0 | T | A | 5.2% | 400.1 / 7.8 | 129 | P283P (CCT→CCA) ‡ | lepA | elongation factor 4 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (59/63); new base A (4/3); total (63/66) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.14e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GGTCGACAGCGTCGGTGTCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGACTCCTCGCTGCAGTACATGCCGGAAAG > NC_002947/1631996‑1632286 | ggTCGACAGCGTCGGTGTCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGa < 1:1929571/150‑1 (MQ=255) gTCGACAGCGTCGGTGTCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAg > 1:2316994/1‑150 (MQ=255) ctCGACAGCGTCGGTGTCTTCGCACGGCGGCGCACACACGCCGCTGGTCGTAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAg < 2:1109504/149‑1 (MQ=255) tCGACAGCGTCGGTGTCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAgg > 2:343502/1‑150 (MQ=255) gACAGCGTCGGTGTCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGgtg > 2:2010445/1‑150 (MQ=255) aCAGCGTCGGTGTCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCTCAGGGGTCGAggaca < 1:2810645/150‑4 (MQ=255) aCAGCGTCGGTGTCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATACCCGGAGCCCCTGGTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGgtgt > 2:2387039/1‑150 (MQ=255) cAGCGTCGGTGTCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGtt < 2:617822/150‑1 (MQ=255) gCGTCGGTGTCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGc < 1:1730694/150‑1 (MQ=255) ggTGTCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGtt < 1:2781469/143‑1 (MQ=255) gtgtCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAgg < 2:3006206/132‑1 (MQ=255) gtgtCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAgg > 1:3006206/1‑132 (MQ=255) gtgtCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCa > 1:1171193/1‑146 (MQ=255) gtgtCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCa < 2:1171193/146‑1 (MQ=255) cTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCaa < 2:2483094/150‑1 (MQ=255) cTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCaa < 1:1005999/150‑1 (MQ=255) ttCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCaag > 2:2157310/1‑150 (MQ=255) ttCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCaag > 2:2768659/1‑150 (MQ=255) cACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTCGTGACACCCTGACCCGGTGCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCaagaa < 1:2223730/150‑1 (MQ=255) cccGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAg > 2:42212/1‑127 (MQ=255) cccGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGAt > 1:2414270/1‑150 (MQ=255) cccGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGAt > 1:385550/1‑150 (MQ=255) ccGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGAtt < 1:2768659/150‑1 (MQ=255) ccGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGAtt > 2:4501/1‑150 (MQ=255) gAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCCGGTGGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCa < 1:2387039/150‑1 (MQ=255) acCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAg > 1:2721744/1‑150 (MQ=255) acCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAg < 1:4501/150‑1 (MQ=255) cccAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAgg > 1:1266988/1‑150 (MQ=255) ccAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGt > 1:955775/1‑150 (MQ=255) aCCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTAc < 2:2414270/150‑1 (MQ=255) cGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGc < 1:2607213/150‑1 (MQ=255) cGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGCGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGc > 2:864779/1‑150 (MQ=255) tGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCgg > 1:2167005/1‑150 (MQ=255) gATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGc < 2:2316994/150‑1 (MQ=255) cTGAAAGCCGGCGGTGTATTCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTg > 1:1642479/1‑150 (MQ=255) gAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCaa < 2:1284418/117‑1 (MQ=255) gAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGtt > 1:3036866/1‑150 (MQ=255) aaaGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGc < 2:1919111/144‑1 (MQ=255) aaaGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGc > 1:1919111/1‑144 (MQ=255) aaaGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTc < 2:252971/150‑1 (MQ=255) aGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCt > 2:368286/1‑88 (MQ=255) aGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCt < 1:368286/88‑1 (MQ=255) aGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTccc < 1:2145877/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAAGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGTATACG‑CCTCGCACTTCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCg < 2:1642479/150‑1 (MQ=255) gCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCg < 2:2721744/150‑1 (MQ=255) ccGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCgg < 1:1090331/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTc < 1:212734/150‑1 (MQ=255) gCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCa > 1:736548/1‑150 (MQ=255) gAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAg > 1:620392/1‑90 (MQ=255) gAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAg < 2:620392/90‑1 (MQ=255) tAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCcg > 2:1253103/1‑150 (MQ=255) ggCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGAAATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCcgac > 1:2687490/1‑150 (MQ=255) atcGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCGGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAg < 1:223660/150‑1 (MQ=255) atcGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAg < 1:1405352/150‑1 (MQ=255) atcGCCAGCAGCAAGGCCATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACGCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAg < 2:2805284/150‑1 (MQ=255) tcGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAgg > 1:2847184/1‑150 (MQ=255) ccAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAg < 1:346910/104‑1 (MQ=255) ccAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAg > 2:346910/1‑104 (MQ=255) cAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGAttt > 2:92790/1‑150 (MQ=255) aGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTc < 2:2167005/150‑1 (MQ=255) aaGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCt > 2:2813084/1‑110 (MQ=255) aaGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCt < 1:2813084/110‑1 (MQ=255) aGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACg > 2:856843/1‑150 (MQ=255) aCATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCg < 2:1476502/113‑1 (MQ=255) aTCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTg > 1:2376239/1‑150 (MQ=255) cACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGtt > 1:592007/1‑59 (MQ=255) cACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGtt < 2:592007/59‑1 (MQ=255) cACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAg < 1:92790/150‑1 (MQ=255) tGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCa < 2:2137652/63‑1 (MQ=255) tGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCa > 1:2137652/1‑63 (MQ=255) tGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCcgac < 1:1527742/103‑1 (MQ=255) tGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGa > 1:1532711/1‑150 (MQ=255) acacCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGAct > 1:910652/1‑150 (MQ=255) accctgaccctgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGActcc < 2:910652/150‑1 (MQ=255) accctgaccctgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGActcc > 1:2320462/1‑150 (MQ=255) accctgaccctgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGActcc < 2:2847184/150‑1 (MQ=255) ccctgaccctgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGActcct < 1:864779/150‑1 (MQ=255) cctgaccctgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCaag < 1:1231245/49‑1 (MQ=255) cctgaccctgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGActcctc > 1:2442690/1‑150 (MQ=255) cctgaccatgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGActcctc > 2:128641/1‑150 (MQ=255) ctgaccctgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCCGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCAAGGATTTCCGCGACGCTCCGCAGAAGCTGACCCTGAACGACTCCTCg < 2:1266988/150‑1 (MQ=255) ccgatctcTCG‑GCCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAATATTCGGCCGCACGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGCTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGACTCCTCGCTGc < 2:139494/143‑1 (MQ=255) cctgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGACTCCTCGCTGCa > 1:326066/1‑150 (MQ=255) ctgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGaa > 2:2793545/1‑134 (MQ=255) ctgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGaa < 1:2793545/134‑1 (MQ=255) ctgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGACTCCTCGCTGCAg < 1:2010445/150‑1 (MQ=255) tgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGa > 1:201767/1‑136 (MQ=255) tgTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGa < 2:201767/136‑1 (MQ=255) acaccTCG‑ACCTCATGGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGACTCCTCGCTGCAGt > 2:42108/4‑150 (MQ=255) acaccTCG‑ACCTCAGGGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCCGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAg < 1:1070543/95‑1 (MQ=255) acaccTCG‑ACCTCAGGGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCCGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAg > 2:1070543/4‑98 (MQ=255) caccTCG‑ACCTCAGGGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCcg > 1:2093935/3‑105 (MQ=255) caccTCG‑ACCTCAGGGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCcg < 2:2093935/103‑1 (MQ=255) tCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAAc < 2:867997/129‑1 (MQ=255) tCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGACTCCTCGCTGCaagatcgg > 1:139494/1‑143 (MQ=255) tCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGACTCCTCGCTGCAGTACATg > 2:2327871/1‑150 (MQ=255) cG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGACTCCTCGCTGCAGTACATGc < 2:2376239/150‑1 (MQ=255) g‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGACTCCTCGCTGCAGTACATGcc > 2:286620/1‑150 (MQ=255) ccTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGACTCCTCGCTGCAGTACATGCCGGaa < 2:1532711/150‑1 (MQ=255) tGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGActcc < 1:1284969/127‑1 (MQ=255) | GGTCGACAGCGTCGGTGTCTTCACCCCGAAGCACACCCAGACCGCTGATCTGAAAGCCGGCGAAGTAGGCTTCATCATCGCCAGCATCAAGGACATCCACGGTGCCCCGGTTGGTGACACCCTGACCCTGTCCTCG‑ACCCCTGAGGTCGAGGTGTTGCCAGGCTTCAAGAAGATTCAGCCGCAGGTCTACGCCGGCCTGTTCCCGGTCAGCTCCGACGACTTCGAGGATTTCCGCGACGCTCTGCAGAAGCTGACCCTGAACGACTCCTCGCTGCAGTACATGCCGGAAAG > NC_002947/1631996‑1632286 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |