Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,897,249 | T→A | 10.8% | intergenic (‑60/+84) | PP_mr24 ← / ← rdgC | mini‑ykkC regulatory region/recombination‑associated protein RdgC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,897,249 | 0 | T | A | 10.8% | 378.0 / 32.3 | 130 | intergenic (‑60/+84) | PP_mr24/rdgC | mini‑ykkC regulatory region/recombination‑associated protein RdgC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/60); new base A (7/7); total (63/67) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.22e-01 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
ATGATCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAATTCGGCAAA > NC_002947/1897102‑1897398 | atgatCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTAc < 1:520340/150‑1 (MQ=255) atCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCAc > 2:2372889/1‑150 (MQ=255) aGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTGc < 2:2194/150‑1 (MQ=255) ggACATGAGTTTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTGCa < 1:519666/150‑1 (MQ=255) gACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTg < 1:1432408/150‑1 (MQ=25) gtgtCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTGCa > 1:1326472/1‑140 (MQ=255) gtgtCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTGCa < 2:1326472/140‑1 (MQ=255) gtCTCCATCGTTTGAATGCTGGGCCTGTCCCAGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAATGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGGTTa > 2:2806892/1‑150 (MQ=255) tcCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCCAATGCAGGCGCGGGTTTAccc > 1:936155/1‑150 (MQ=255) ccATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCgg < 1:2310161/141‑1 (MQ=255) ccATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCgg > 2:2310161/1‑141 (MQ=255) ccATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCcg > 2:1378814/1‑150 (MQ=255) cATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCcgc > 1:289143/1‑150 (MQ=255) aTCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCcgcg > 1:1422945/1‑150 (MQ=255) cGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGaa < 1:786047/150‑1 (MQ=255) tGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAgg < 2:1910737/150‑1 (MQ=255) aaTGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTAc < 1:1550874/116‑1 (MQ=255) aaTGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTAc > 2:1550874/1‑116 (MQ=255) tgatgGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg > 2:2948937/1‑150 (MQ=255) atgGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTg > 1:322372/1‑150 (MQ=255) ggCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTgg > 2:2756870/1‑150 (MQ=255) gTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTGCAg < 2:252513/113‑1 (MQ=39) cccGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTgg > 2:719457/1‑143 (MQ=255) ccGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAAc > 2:1551782/1‑150 (MQ=255) ccGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAAc > 1:890841/1‑150 (MQ=255) gAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGAt > 2:1726511/1‑150 (MQ=255) aGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGAtt < 1:2756870/150‑1 (MQ=255) gTGGTCACGCGTTGTGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCGGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAACCGCttt < 2:766695/150‑2 (MQ=39) tGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 1:347598/129‑1 (MQ=255) ggTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAg < 1:2029887/150‑1 (MQ=255) gTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAgg > 2:2054463/1‑150 (MQ=255) gTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAgg < 1:1551782/150‑1 (MQ=255) cACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGcc < 1:467594/150‑1 (MQ=255) aCGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAaga > 1:1926849/1‑119 (MQ=255) aCGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCa < 1:2133065/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAg < 1:925010/150‑1 (MQ=255) ggTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAagag > 1:2666587/1‑116 (MQ=255) ggTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAagag < 2:2666587/116‑1 (MQ=255) gTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGtt < 1:2302097/102‑1 (MQ=255) gTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGtt > 2:2302097/1‑102 (MQ=255) gCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCAcc > 2:2315743/1‑148 (MQ=255) gCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCAcc < 1:2315743/148‑1 (MQ=255) aGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCAt > 1:1761854/1‑150 (MQ=255) ggTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATa < 1:2948937/150‑1 (MQ=255) tcgtcCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGgc < 1:1812082/82‑1 (MQ=255) tcgtcCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGgc > 2:1812082/1‑82 (MQ=255) gtcCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGAtt < 2:1580840/123‑1 (MQ=255) gtcCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCaa > 2:256053/1‑150 (MQ=255) tcCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAAt < 2:890841/150‑1 (MQ=255) ccTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGgc < 2:1845246/78‑1 (MQ=255) aCCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAAcccc > 1:1829142/1‑64 (MQ=38) aCCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCAc < 2:483233/128‑1 (MQ=255) aCCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCAc > 1:483233/1‑128 (MQ=255) gCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCgg > 1:3059170/1‑71 (MQ=255) gCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCgg < 2:3059170/71‑1 (MQ=255) cACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCg > 1:923266/1‑150 (MQ=255) aCCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCgg > 2:854388/1‑150 (MQ=255) cATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGAtt > 1:513907/1‑106 (MQ=255) tGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCa > 2:918175/1‑117 (MQ=255) tGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATctct < 1:235737/150‑1 (MQ=255) ccTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTc > 2:1963777/1‑150 (MQ=255) cTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTg > 2:411032/1‑50 (MQ=255) tGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAAt > 1:213081/1‑125 (MQ=255) tGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAAt < 2:213081/125‑1 (MQ=255) tGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCtt < 2:2399581/135‑1 (MQ=255) tGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCtt > 1:2399581/1‑135 (MQ=255) tGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTcac > 1:2081301/1‑150 (MQ=255) cTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTcaccac < 2:289143/150‑1 (MQ=255) tGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCaccacc < 2:322372/150‑1 (MQ=255) gC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAgc > 2:1968416/1‑150 (MQ=255) c‑‑cTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAgcg > 1:1705883/1‑150 (MQ=255) t‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCt < 1:854388/150‑1 (MQ=255) ggCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGaa < 1:1963777/150‑1 (MQ=255) gCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAAc < 1:2229877/150‑1 (MQ=255) aaGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCCATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAg < 2:936155/150‑1 (MQ=255) aaGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGa > 1:1221391/1‑110 (MQ=255) aaGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGa < 2:1221391/110‑1 (MQ=255) aCCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCggg > 1:2080948/1‑37 (MQ=255) aCCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCggg < 2:2080948/37‑1 (MQ=255) ccGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCa > 1:275285/1‑95 (MQ=255) ccGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCAcc < 1:2944238/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTg > 1:2083828/1‑59 (MQ=255) gcgcCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTg < 2:2083828/59‑1 (MQ=255) gcCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCa < 2:2081301/150‑1 (MQ=255) cTGCAAGTGGTAACCCCTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAgg > 2:2163534/1‑150 (MQ=255) tGCAAGTGGTAACCCCTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGa > 2:410039/1‑150 (MQ=255) tGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCACTCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTca < 2:1810744/119‑1 (MQ=255) tGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTca > 1:1810744/1‑119 (MQ=255) tGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGa > 2:1714780/1‑150 (MQ=255) gCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGaa > 1:480297/1‑150 (MQ=255) gCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCATGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGaa < 1:2372889/150‑1 (MQ=255) cAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAAt > 1:1796680/1‑150 (MQ=255) aaGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGAc < 1:1711407/97‑1 (MQ=255) aaGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGAc > 2:1711407/1‑97 (MQ=255) aaGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAAtt > 1:1519403/1‑150 (MQ=255) ggTAACCCCTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCtt > 2:2660847/1‑110 (MQ=255) gTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCGCCGGCAGGAATTCGGCa > 2:1855474/1‑150 (MQ=255) ttACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAATTCg > 1:1799299/1‑146 (MQ=255) ttACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAATTCg < 2:1799299/146‑1 (MQ=255) tACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAATTCGGCaaa < 1:1714780/150‑1 (MQ=255) | ATGATCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAATTCGGCAAA > NC_002947/1897102‑1897398 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |