Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 2,628,429 | A→C | 5.4% | A16A (GCA→GCC) | clpP → | ATP‑dependent Clp protease proteolytic subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,628,429 | 0 | A | C | 5.4% | 372.8 / 8.3 | 129 | A16A (GCA→GCC) | clpP | ATP‑dependent Clp protease proteolytic subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (56/65); new base C (5/2); total (61/68) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.57e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CTGCTGAGTAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCAACTGCTG > NC_002947/2628280‑2628576 | ctgctgAGTAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCTCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCa > 2:930333/1‑150 (MQ=255) ctgctgAGTAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCa < 2:2365837/150‑1 (MQ=255) tgctgAGTAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCGTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGAAATGCGTATTTGGGACTGAGGGGAGTACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAg < 1:376114/150‑1 (MQ=255) gTAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGcc > 1:1767505/1‑150 (MQ=255) tAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCt < 1:442478/150‑1 (MQ=255) tAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCt > 1:2605983/1‑150 (MQ=255) aaCGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTg < 1:2196041/150‑1 (MQ=255) aaCGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCCTAATTCTTATATTCAGCAGAGCCCTGACATCCAGGCCGCAGgccgccgc < 2:1652265/150‑3 (MQ=255) cGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCTAGCCGTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGATGTGTCAAGTAATTCTTCTATTCACCATAGCTCTGACATCCACGTCGCAGCCGGCTTGGt > 2:1391082/1‑150 (MQ=255) gTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTcc < 2:2057113/150‑1 (MQ=255) tcttctCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTTGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTccc < 1:796464/150‑1 (MQ=255) cttctCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAg > 2:393604/1‑136 (MQ=255) cttctCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAg < 1:393604/136‑1 (MQ=255) tctctcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCCCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGAt > 2:3058444/1‑150 (MQ=255) ctctcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATg > 1:1289762/1‑150 (MQ=255) ctctcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATg < 1:1888666/150‑1 (MQ=255) tctcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATgg > 2:2850733/1‑150 (MQ=255) tcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATg < 2:1105594/147‑1 (MQ=255) tcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATg > 1:1105594/1‑147 (MQ=255) tcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGtt > 1:2377069/1‑150 (MQ=255) tAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATc < 1:1573526/150‑1 (MQ=255) gAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAg < 1:1018406/150‑1 (MQ=255) aaCCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCa < 2:467954/150‑1 (MQ=255) 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ttCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAAcg > 2:2873680/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGCTTGTGCGTACTCAAGCCAGGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACgcgc < 2:2184053/150‑1 (MQ=255) aGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCt > 2:2174500/1‑150 (MQ=255) gCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGc > 2:489928/1‑129 (MQ=255) gCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGc < 1:489928/129‑1 (MQ=255) ttGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATTCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCAGTGGCGAACGCGCTTACGACa > 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gTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACAACCAGGCCGCCTGCGGCCTggat < 1:2256310/98‑3 (MQ=255) tATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGAACCGCGCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTc < 1:2463867/150‑1 (MQ=255) ttCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTcgc < 1:2174500/150‑1 (MQ=255) aaGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACCTCTACTTGCTcc > 1:2351095/1‑150 (MQ=255) aTGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTg < 1:2905795/84‑1 (MQ=255) aTGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTg > 2:458050/1‑150 (MQ=255) 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gAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAg > 2:107955/1‑141 (MQ=255) gAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAg < 1:107955/141‑1 (MQ=255) aGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGa < 2:2377069/150‑1 (MQ=255) tGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATc > 2:1516494/1‑150 (MQ=255) aGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCtt > 2:2370673/1‑150 (MQ=255) 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aCATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTg < 1:1185649/150‑1 (MQ=255) gTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGccc < 1:1516494/150‑1 (MQ=255) tCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGt > 2:2998242/1‑143 (MQ=255) tCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGt < 1:2998242/143‑1 (MQ=255) tCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCg < 1:1477816/150‑1 (MQ=255) tCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCCTGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCg > 1:806465/1‑150 (MQ=255) cccGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCgg < 2:2350533/150‑1 (MQ=255) ccGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACa < 1:2488027/101‑1 (MQ=255) ccGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTTCGATGGGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGt > 1:808019/1‑150 (MQ=255) ccGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGt > 2:312959/1‑150 (MQ=255) cGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTTACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGccc > 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ttCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATGGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATgg > 2:1806484/1‑150 (MQ=255) ttCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACa < 1:879967/87‑1 (MQ=255) ttCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCgtg < 2:1601816/114‑1 (MQ=255) ttCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCgtg > 1:1601816/1‑114 (MQ=255) ttCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATgg < 2:2549655/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGAGCCCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGc < 1:3058444/150‑1 (MQ=255) gcagAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCaa < 2:1767505/150‑1 (MQ=255) cagAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTagag < 2:2611744/135‑1 (MQ=255) cagAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTagag > 1:2611744/1‑135 (MQ=255) tcgggaccAGGCCGCCTGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTcgtcgt > 2:1755917/7‑150 (MQ=255) tGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTcgtcgt > 1:652605/1‑150 (MQ=255) aTCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTgcg > 1:828434/1‑150 (MQ=255) accAGGCCGCCTGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCgtg > 1:1369091/2‑96 (MQ=255) accAGGCCGCCTGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCgtg < 2:1369091/95‑1 (MQ=255) ccAGGCCGCCTGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCa > 1:2562304/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTAGCCCGGTAGAGGACTACATTGCCAACCTCGTCGTTGCGCa > 2:2464317/1‑150 (MQ=255) cAGGCCCCCTGCGGCCTGGTCCCTAGGGTTCCCGAGCAGTGGGCGCGGGGCTAACTGGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGCGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCaa > 2:507219/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCAAc > 2:2681664/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCAAc > 2:1924143/1‑150 (MQ=255) gCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCAActg < 2:2605983/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCAActgctg > 1:1757990/1‑150 (MQ=255) gCAGGCGGACTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGAAActgctg < 1:1518280/150‑1 (MQ=255) | CTGCTGAGTAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCAACTGCTG > NC_002947/2628280‑2628576 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |