Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,362,658 | C→G | 5.7% | intergenic (‑135/‑301) | PP_5634 ← / → adhP | hypothetical protein/alcohol dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,362,658 | 0 | C | G | 5.7% | 338.8 / 7.2 | 106 | intergenic (‑135/‑301) | PP_5634/adhP | hypothetical protein/alcohol dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (48/51); new base G (2/4); total (50/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TCTTCGTCGCGCATGCTGGCTCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCCCGCCGCATCCTTGCCGCGGG > NC_002947/4362510‑4362802 | tcTTCGTCGCGCATGCTGGCTCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCa > 1:123025/1‑150 (MQ=255) tcTTCGTCGCGCATGCTGGCTCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCa > 1:2028905/1‑150 (MQ=255) tcTTCGTCGCGCATGCTGGCTCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAAAGTCTTTTGCCCGCCTTCCa > 2:231746/1‑150 (MQ=255) cgtcgCGCATGCTGGCTCCTGGGATAATGGCAGTCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTTCCCGCCTTCCATGGc < 2:1093695/150‑1 (MQ=255) cgtcgCGCATGCTGGCTCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGc < 1:231746/150‑1 (MQ=255) gcATGCTGGCTCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCtt > 1:800609/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGCTCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCtttt > 1:1210929/1‑150 (MQ=255) gCTGGCTCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCtttttt < 1:1690735/150‑1 (MQ=255) tGGCTCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTAGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTAt < 1:1664153/150‑1 (MQ=255) cTCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑Ac < 1:2803813/150‑1 (MQ=255) tCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑Acc > 2:2370929/1‑150 (MQ=255) tCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑Acc < 1:1488460/150‑1 (MQ=255) cTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCt > 1:331274/1‑150 (MQ=255) gggATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTgc < 1:1174089/150‑1 (MQ=255) ggATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTgcg > 1:1493028/1‑150 (MQ=255) aaTGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCCGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACt > 2:403294/1‑150 (MQ=255) aTGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATgg > 2:786873/1‑123 (MQ=255) aTGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATgg < 1:786873/123‑1 (MQ=255) aGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTg > 1:2406267/1‑150 (MQ=255) ggCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGc > 1:275849/1‑150 (MQ=255) tGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTg > 1:1658965/1‑145 (MQ=255) tGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTg < 2:1658965/145‑1 (MQ=255) tataGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCCCACTGAAGGCTCTCACCTACAACGTCTCTTGCCCGTGCTTGATGGCGGCGTTTTTTTGG‑ACCCTTCGCACTTCGTTGCAgatga < 2:2652755/150‑1 (MQ=255) tataGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAgatga < 2:2124501/150‑1 (MQ=255) taGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGACCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGatgatg > 1:803180/1‑150 (MQ=255) aGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTg > 1:406346/1‑140 (MQ=255) aGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTg < 2:406346/140‑1 (MQ=255) aGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGAtgatga < 2:1493028/150‑1 (MQ=255) gCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACa > 2:2664140/1‑150 (MQ=255) gCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCATGGAAGGCggg < 1:2956639/110‑1 (MQ=255) tGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCg > 1:832957/1‑133 (MQ=255) tGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCg < 2:832957/133‑1 (MQ=255) tCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTc > 1:1901377/1‑150 (MQ=255) tCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTc > 1:709388/1‑150 (MQ=255) tCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTc < 1:2776161/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTCATCCTGGGTTAACCGGACCGGTGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTGTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCAtgacc < 2:634083/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGGCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAAAGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCAtgacc > 1:2430447/1‑150 (MQ=255) ggTCAATGCGTGGTCGCTTAACCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCAtgacctgacc < 1:2766706/150‑1 (MQ=255) tCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCtt < 2:1321178/150‑1 (MQ=255) gTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGaaa < 2:2028905/150‑1 (MQ=255) tGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAAt < 2:2913836/150‑1 (MQ=255) tCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTc < 2:123025/150‑1 (MQ=255) gCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAGAtcggaa > 2:1465880/1‑145 (MQ=255) gCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGa < 1:1419541/150‑1 (MQ=255) cTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCAtgacctga > 1:68426/1‑132 (MQ=255) cTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCAtgacctga < 2:68426/132‑1 (MQ=255) cTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGAc > 1:1418088/1‑150 (MQ=255) aaTCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATc < 2:1901377/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGa > 2:1975452/1‑150 (MQ=255) cTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGa > 2:240894/1‑150 (MQ=255) tGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGAt < 2:73199/150‑1 (MQ=255) ggTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATgg < 2:1418088/150‑1 (MQ=255) gTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATggg > 2:365838/1‑150 (MQ=255) ttAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCtttt < 1:996425/71‑1 (MQ=255) tAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGca < 1:365838/150‑1 (MQ=255) accggaccggCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGcaca > 1:2458847/1‑150 (MQ=255) ccggaccggCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCacac < 1:2002025/150‑1 (MQ=255) gaccggCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACTTCTTTTGCACGCCTTAC‑TGGAGTTCAGATGTGTGCTCCTTGCGAACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTgg < 1:2664140/150‑1 (MQ=255) ccggCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGcc < 1:240894/150‑1 (MQ=255) gcgcAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAgat > 2:2708507/1‑87 (MQ=255) gcgcAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAgat < 1:2708507/87‑1 (MQ=255) gcgcAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTg > 2:387066/1‑150 (MQ=255) gcAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCt > 2:557051/1‑150 (MQ=255) aaCCTGCAGGCTCTCCCTTCAAAAGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTcc < 2:2430447/150‑1 (MQ=255) aCCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCg > 2:1307309/1‑150 (MQ=255) cTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTa > 1:709288/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTAt < 1:2370929/150‑1 (MQ=255) cAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGCTGATGCCCAACTGATGCCCGGTCGTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGt > 1:1136335/1‑150 (MQ=255) cAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGt > 1:1323721/1‑150 (MQ=255) ctctCCCTTCAAACGTCTTTTGACCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCtt < 2:803180/150‑1 (MQ=255) cgatctcTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGAGGGAAGGTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCtt < 1:1571055/144‑1 (MQ=255) tctcCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTg < 2:800609/150‑1 (MQ=255) ctcCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGc < 2:1210929/150‑1 (MQ=255) tcCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCa > 2:3001039/1‑150 (MQ=255) ccTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACtt < 2:637368/58‑1 (MQ=255) ccTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACtt > 1:637368/1‑58 (MQ=255) agggtcataaaaaaGCCCGCCATGGAAGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCAt > 1:1767448‑M1/15‑80 (MQ=255) agggtcataaaaaaGCCCGCCATGGAAGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCAt < 2:1767448‑M1/66‑1 (MQ=255) aattttCTGTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCccgcc < 2:331274/145‑1 (MQ=255) aaaCGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCtt < 1:1311413/140‑1 (MQ=255) aaaCGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCtt > 2:1311413/1‑140 (MQ=255) aaaCGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCccgcc > 1:2292933/1‑150 (MQ=255) aaaCGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCccgcc > 1:326450/1‑150 (MQ=255) aaaCGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCATGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACACCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCccgcg < 1:334098/150‑2 (MQ=255) aaCGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGa > 1:788776/1‑100 (MQ=255) aaCGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGa < 2:788776/100‑1 (MQ=255) aCGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGc < 2:2765686/70‑1 (MQ=255) aCGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGc > 1:2765686/1‑70 (MQ=255) aCGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCCcgccgc > 2:2987072/1‑150 (MQ=255) cGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTg < 2:2972222/55‑1 (MQ=255) cGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTg > 1:2972222/1‑55 (MQ=255) gTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCCCGCCGCAt > 2:1802461/1‑150 (MQ=255) aaaaaGCCCGCCATGGAAGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCAc > 1:2081884‑M1/6‑85 (MQ=255) tttGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCCCGCCGCATCCtt < 2:2458847/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCCCGCCGCATCCTTg < 2:2406267/150‑1 (MQ=255) CCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCCCGCCGCATCCTTGCcg < 2:851291‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGc < 1:156044‑M1/101‑1 (MQ=255) CCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGc > 2:156044‑M1/1‑101 (MQ=255) CCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCCCGCCGCATCCTTGCcgc < 2:2619014‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCCCGCCGCATCCTTGCCGCggg > 2:709388‑M1/1‑150 (MQ=255) | TCTTCGTCGCGCATGCTGGCTCCTGGGATAATGGCAGGCCTGTATAGGCTGATCAGGGTGCCGGGTCAATGCGTGGTCGCTTAATCCTGGGTTAACCGGACCGGCGCAACCTGCAGGCTCTCCCTTCAAACGTCTTTTGCCCGCCTTCCATGGCGGGCTTTTTTATG‑ACCCTGCGCACTTCGTTGCAGATGATGACAGCCTCATGACCTGACCTTCACGAAATGTCGACATCCGGATGGGCACACTGGCCCTGCTCCGTATGTTCTTGCAGCCCGCCGCATCCTTGCCGCGGG > NC_002947/4362510‑4362802 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |