Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,451,660 | A→G | 5.6% | E48G (GAG→GGG) | lnt → | apolipoprotein N‑acyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,451,660 | 0 | A | G | 5.6% | 462.6 / 10.2 | 155 | E48G (GAG→GGG) | lnt | apolipoprotein N‑acyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (72/73); new base G (4/5); total (77/78) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.14e-01 |
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
GACAAACATGCGTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCG > NC_002947/5451511‑5451809 | gACAAACATGCGTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGa > 2:311263/1‑150 (MQ=255) aCAAACATGCGTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATTTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAg < 2:382284/150‑1 (MQ=255) cAAACATGCGTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGc < 1:2132020/150‑1 (MQ=255) aaaCATGCGTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCt > 2:914165/1‑150 (MQ=255) aCATGCGTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCa > 1:1016886/1‑150 (MQ=255) aTGCGTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGc < 2:3262/150‑1 (MQ=255) tGCGTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGcc > 2:1538543/1‑150 (MQ=255) gCGTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGccc > 2:470541/1‑150 (MQ=255) gTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCcgc > 2:2407728/1‑150 (MQ=255) ggATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGcc > 1:2733830/1‑150 (MQ=255) gATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCa > 1:1982993/1‑150 (MQ=255) gATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCAAGGTGCTCGGAGCCTTCACCCTGGTGGCCCTGGCTCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCa > 1:1597732/1‑150 (MQ=255) aTCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAg < 2:48888/150‑1 (MQ=255) tCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAgg < 2:59173/150‑1 (MQ=255) cACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGc < 1:2407728/150‑1 (MQ=255) cccGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCa > 1:543723/1‑150 (MQ=255) cccGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCa > 2:2744248/1‑150 (MQ=255) cccGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCa > 2:1020367/1‑150 (MQ=255) ccGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCAt > 1:2605839/1‑150 (MQ=255) gCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCAtgt > 2:2750023/1‑150 (MQ=255) gCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCCCAGCCCGCGCCAGGCCAtgg > 1:2247046/1‑149 (MQ=255) ccccGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCAtgtg > 1:1240392/1‑150 (MQ=255) ccGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATgtggc < 1:576366/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATgtggcg > 2:1915659/1‑150 (MQ=255) ggCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATgtggcgt < 1:1538502/150‑1 (MQ=255) gCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACACCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTAGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCtg > 2:2209538/1‑150 (MQ=255) cccGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCtgg < 2:1597732/150‑1 (MQ=255) ccGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCtggt > 2:805126/1‑150 (MQ=255) ccGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCtggt > 1:940379/1‑150 (MQ=255) cGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCAtgtg > 1:1051332/1‑138 (MQ=255) ggTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGGCATGTGGCGTGGCtggtgg < 1:96212/150‑1 (MQ=255) aaCCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggttt < 2:3058647/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttg < 2:735896/150‑1 (MQ=255) ctgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgggttt < 2:940379/150‑1 (MQ=255) tgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGTCT‑GCGCGAGTTCATCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgggtttg < 1:470541/150‑1 (MQ=255) tgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgggtttg > 2:2223100/1‑150 (MQ=255) cccccTTGCCGCCGGTTCTTCCACCCTCCTGGCCCTGCCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGgtttgggtttgg < 2:1470064/148‑1 (MQ=255) ccTGGCGGCCGGCCCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCt < 1:1400177/150‑1 (MQ=255) gcggcCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTa > 1:731214/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCt < 1:2257904/93‑1 (MQ=255) cGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCt > 2:2257904/1‑93 (MQ=255) cGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGgcgc > 1:2348548/1‑150 (MQ=255) ggTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCATGGCCTGGCGCGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCaaggt > 1:3070600/1‑109 (MQ=25) gTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGc < 1:1446250/106‑1 (MQ=255) tGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCgg < 1:2223100/150‑1 (MQ=255) ttCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtt < 2:1381929/123‑1 (MQ=255) tCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCATGGCCTGGCGCGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCaaggta > 1:1053377/1‑103 (MQ=21) tCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCATGGCCTGGCGCGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCaaggta < 2:1053377/108‑6 (MQ=21) cACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCtg > 2:2666279/1‑150 (MQ=255) aCCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATgtggcgtgg > 2:3025174/1‑110 (MQ=255) aCCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATgtggcgtgg < 1:3025174/110‑1 (MQ=255) cccTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGGGCGCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCtggt < 2:741328/150‑1 (MQ=255) cccTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCATGGCCTGGCGCGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCaaggta < 1:2523555/104‑6 (MQ=21) cccTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCATGGCCTGGCGCGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCaaggta > 2:2523555/1‑99 (MQ=21) tcctGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGa < 2:2307439/150‑1 (MQ=255) tggccctggcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggttt > 1:1783583/1‑113 (MQ=255) 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(MQ=255) ttGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTTGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGcc < 2:1471103/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggttt > 2:117777/1‑84 (MQ=255) ttGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggttt < 1:117777/84‑1 (MQ=255) ggTGTTGTCCATCGCGGTACTCAAACTAGGCCT‑GCGAGAGCTTAGCCCGCGCCAGGCTATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGTATGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACCTCAGCATCAACAACTACGGCTGCGCCTcgcc > 2:72354/1‑150 (MQ=255) tgttgtCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGTGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTcgccgc > 2:696234/1‑150 (MQ=255) tgttgtCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGa > 1:682412/1‑111 (MQ=255) tgttgtCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGa < 2:682412/111‑1 (MQ=255) tgttgtCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTGTGGGTTTGGCCTGTAGGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTcgccgc < 1:1907954/150‑1 (MQ=255) gtCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGAGGCAGGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCgctgct > 1:1754302/1‑150 (MQ=255) tCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGctgctg > 2:1773396/1‑150 (MQ=255) ccATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTgg < 1:2666279/150‑1 (MQ=255) cATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGc > 2:2302006/1‑150 (MQ=255) aTCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATg < 1:394503/85‑1 (MQ=255) tCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgggttt < 1:455418/74‑1 (MQ=255) gCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGtt < 1:831220/150‑1 (MQ=255) ctctACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCtgg > 1:6402/1‑54 (MQ=255) ctctACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTtg > 1:2847270/1‑150 (MQ=255) tctACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCa > 2:2292337/1‑102 (MQ=255) tACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATc > 2:864197/1‑141 (MQ=255) tACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATc < 1:864197/141‑1 (MQ=255) aCCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTtgctgc > 1:901584/1‑150 (MQ=255) ttGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgg < 1:2946380/55‑1 (MQ=255) ttGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgg > 2:2946380/1‑55 (MQ=255) ttGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAac < 2:369947/104‑1 (MQ=255) ttGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTgg < 1:2302006/150‑1 (MQ=255) gCCT‑GCGCGAGCTCGGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCGGCATGAacac < 2:811341/103‑1 (MQ=255) gCCT‑GCGCGAGCTCGGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCGGCATGAacac > 1:811341/1‑103 (MQ=255) ccT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGtt > 1:1703187/1‑150 (MQ=255) ctggcgcGGGCTGAGCTCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGcc > 2:2393647/4‑115 (MQ=255) ctggcgcGGGCTGAGCTCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGcc < 1:2393647/112‑1 (MQ=255) cT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGcc < 2:2798968/69‑1 (MQ=255) cT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGttc < 2:2288981/150‑1 (MQ=255) aGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTcgccg < 2:2004850/150‑1 (MQ=255) | GACAAACATGCGTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCG > NC_002947/5451511‑5451809 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |