New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 596453 | 42 (0.700) | 8 (0.130) | 6/238 | NT | 15.0% | coding (414/711 nt) | PP_0507 | ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | = 596487 | 49 (0.830) | coding (380/711 nt) | PP_0507 | ABC transporter ATP‑binding protein |
TCCGCATCCAGTGCCGAGGTCGGTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGGCAGCAGGTTGAACTGCTGGAAGAT > NC_002947/596313‑596602 | tCCGCATCCAGTGCCGAGGTCGGTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTgg < 2:722837/150‑1 (MQ=255) ccGCATCCAGTGCCGAGGTCGGTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTggg < 2:1225607/150‑1 (MQ=255) cGCATCCAGTGCCGAGGTCGGTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGt < 2:116854/150‑1 (MQ=255) gCATCCAGTGCCGAGGTCGGTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGaccaggcggcca > 1:1107677‑M1/1‑138 (MQ=255) gCATCCAGTGCCGAGGTCGGTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTc > 2:496092/1‑150 (MQ=255) cAGTGCCGAGGTCGGTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTcagcag > 1:1480767/1‑150 (MQ=255) ggTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGgccgcc > 2:1359091/1‑150 (MQ=255) ggTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGAGGCGGCGAGCAGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGgccgcc < 2:184297/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGcccaggcggccagcacgctgctgacccacct > 1:999737‑M1/1‑119 (MQ=255) gTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGcccaggcggccagcacgctgctgacccacct > 1:999329‑M1/1‑119 (MQ=255) gTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCt < 1:302465/150‑1 (MQ=255) ttCGTCGGCGATCACCAGTTCCGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGTCGGGGTGGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGcccaggcggccagcacgctgctgacccacctg < 2:999329‑M1/150‑33 (MQ=255) ttCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGCCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGcccaggcggccagcacgctgctgacccacctg < 2:999737‑M1/150‑33 (MQ=255) tcgGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTgg < 1:1645553/139‑1 (MQ=255) tcgGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTgg > 2:1645553/1‑139 (MQ=255) tcgGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCa > 1:1230001/1‑150 (MQ=255) gCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGaccaggcggccagcacgctgctgacccacctgggcctgg < 2:1107677‑M1/150‑40 (MQ=255) aTCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTg < 2:241634/150‑1 (MQ=255) tCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGc > 1:1554557/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTTCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCAt < 1:1041018/150‑1 (MQ=255) cAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATg < 1:201044/150‑1 (MQ=255) gCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGGCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGgc > 1:1350933/1‑150 (MQ=255) gTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGaccaggcggccagcacgctgctgacccac > 1:462028‑M1/1‑83 (MQ=255) gTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGaccaggcggccagcacgctgctgacccac < 2:462028‑M1/112‑30 (MQ=255) gcgcGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTg < 2:529024/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGc < 2:963184/150‑1 (MQ=255) gcgggcggCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCg < 2:1230001/150‑1 (MQ=255) cgggcggCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCgg < 1:1359091/150‑1 (MQ=255) gACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCga > 2:897580/1‑147 (MQ=255) gACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCga < 1:897580/147‑1 (MQ=255) gACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGaa > 2:1510237/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCCGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCggcaggg < 2:862896/150‑1 (MQ=255) tgctgGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTgcg > 1:658287/1‑134 (MQ=255) tgctgGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTgcg < 2:658287/134‑1 (MQ=255) gctgGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCggcagggca < 2:1350933/150‑1 (MQ=255) gCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTc > 1:1515234/1‑150 (MQ=255) cGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGtt < 2:119310/150‑1 (MQ=255) aGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCa < 1:496092/150‑1 (MQ=255) aGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCa > 1:155036/1‑150 (MQ=255) gTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTAc < 1:581322/150‑1 (MQ=255) gcgcggcgGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCgag < 2:1480767/150‑1 (MQ=255) ggcgggcgAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGa > 2:1343085/1‑150 (MQ=255) gCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGc < 2:1135730/90‑1 (MQ=255) gCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGc > 1:1135730/1‑90 (MQ=255) gCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGgcagca > 2:1047294/1‑150 (MQ=255) ggCAGGGTCGCCCAGGCCCGGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGGCAGCAGGtt < 2:1408401/150‑1 (MQ=255) ggCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGGCAGCAGGtt < 1:1510237/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGGCAGCAGGTTg > 1:1027939/1‑150 (MQ=255) cAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCCGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGGCAGCAGGTTGa > 1:1032029/1‑150 (MQ=255) ggTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGGCAGCAGGTTGAAct > 2:684703/1‑150 (MQ=255) ccaggcccaggTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTcctgggcgaccctgccatgctcgcccgccgcgccgacagcctgtcgatcggccagcagcagcgggtcgccgccgcccgcgcactgatcggccagcctgaactggtgatcgc < 2:1107677‑M2/150‑112 (MQ=255) ccaggcccaggTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGGCAGCAGGTTGAACTGCTGGa > 2:865834/1‑150 (MQ=255) ccaggcccaggTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGGCAGCAGGTTGAACTGCTGGa > 1:1520333/1‑150 (MQ=255) caggcccaggTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGGCAGCAGGTTGAActgc > 2:258126/1‑145 (MQ=255) caggcccaggTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGGCAGCAGGTTGAActgc < 1:258126/145‑1 (MQ=255) gcccaggTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATg > 2:541654/1‑48 (MQ=255) gcccaggTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATg < 1:541654/48‑1 (MQ=255) gcccaggTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGGCAGCAGGTTGAACTGCTGGAAGat < 2:1520333/150‑1 (MQ=255) | TCCGCATCCAGTGCCGAGGTCGGTTCGTCGGCGATCACCAGTTCAGGCTGGCCGATCAGTGCGCGGGCGGCGGCGACCCGCTGCTGCTGGCCGATCGACAGGCTGTCGGCGCGGCGGGCGAGCATGGCAGGGTCGCCCAGGCCCAGGTGGGTCAGCAGCGTGCTGGCCGCCTGGTCAACACTGCCATGGCGCTGCTCGGCGCGTGCCTTGCGGCTGCGCGAGAAGCGGCAGGGCAGTTCGACGTTTTCACGTACCGAGAGGAACGGCAGCAGGTTGAACTGCTGGAAGAT > NC_002947/596313‑596602 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |