New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1622527 = | 53 (0.890) | 16 (0.310) | 13/204 | NT | 28.6% | intergenic (+7/+59) | PP_1421/PP_1422 | sensor histidine kinase TctE/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1622577 = | 35 (0.690) | intergenic (+57/+9) | PP_1421/PP_1422 | sensor histidine kinase TctE/hypothetical protein |
GTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGG > NC_002947/1622379‑1622669 | gcagatcgcccgctgcatcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGc > 1:1473261‑M1/149‑150 (MQ=255) ttCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGcc > 2:1367721/1‑150 (MQ=255) agatcgcccgctgcatcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCt > 1:1449725‑M1/147‑150 (MQ=255) tACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCtgt > 1:1252732/1‑150 (MQ=255) tcgcccgctgcatcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgccgagctgtaccaGCCtgtg > 1:213500‑M1/144‑150 (MQ=255) ggCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCtgt < 1:1064333/146‑1 (MQ=255) ggCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCtgt > 2:1064333/1‑146 (MQ=255) ggCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCg > 1:869660/1‑150 (MQ=255) gCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGc < 1:396321/150‑1 (MQ=255) ccgctgcatcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGc < 2:1628373‑M1/11‑1 (MQ=255) gctgcatcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGccc > 1:980137‑M1/138‑150 (MQ=255) gcatcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCtt > 2:94083‑M1/135‑150 (MQ=255) catcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCttt > 2:715921‑M1/134‑150 (MQ=255) gcAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCAt > 1:1212242/1‑150 (MQ=255) gcAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCAt < 1:203900/150‑1 (MQ=255) gtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtctatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATgg < 2:1368441‑M1/22‑1 (MQ=255) ggCGGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGc < 2:191928/150‑1 (MQ=255) gggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtctatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCAccc > 1:1368441‑M1/121‑150 (MQ=255) gcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCcgc > 2:1119139‑M1/119‑150 (MQ=255) ttAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCcgcg > 2:146263/1‑150 (MQ=255) gtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGc < 2:403756‑M1/11‑1 (MQ=255) gtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGc > 1:403756‑M1/117‑127 (MQ=255) ccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAgg > 1:92070‑M1/113‑150 (MQ=255) tGGCGATCGTTGGCGACATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACGCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGCGTTGCGGGTGCGGGGGAGCTTTATCCCGGATTGATGGGTTGCATGTGTCGCGCCTTTGATGGGCTCACTCGCGAAAgggg < 2:24223/150‑1 (MQ=255) ggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAgggg > 1:65200‑M1/111‑150 (MQ=255) cGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGa < 2:869660/150‑1 (MQ=255) gATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGcc > 2:786868/1‑118 (MQ=255) gATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGcc < 1:786868/118‑1 (MQ=255) gATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGac > 2:250835/1‑150 (MQ=255) ttggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAgggg > 2:1083059‑M1/106‑145 (MQ=255) ttggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAgggg < 1:1083059‑M1/40‑1 (MQ=255) cGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGAca‑ca < 1:847373/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCGCGGGTGAGCCCATGAAAGGGGCGACA‑CAg < 1:684165/150‑1 (MQ=37) gTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGCGTCAATGTCATCTTTATCGCGTATTGGGGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCGCGGGTGAGCCCATGAAAGGGGCGACA‑CAg < 1:609877/150‑1 (MQ=16) cGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTCGCCTGGGTAGCCCCTTTCATGGGCTCCCCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTgg < 1:376219/150‑1 (MQ=255) gagaTCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATgg > 1:726536/1‑118 (MQ=255) gagaTCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATgg < 2:726536/118‑1 (MQ=255) gagaTCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGt > 1:1628373/1‑150 (MQ=255) agaTCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTa < 2:1212242/150‑1 (MQ=255) aTCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACa < 1:1367721/150‑1 (MQ=255) tCTGTCGGGCGCACCTGGCCCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAg < 1:146263/150‑1 (MQ=255) gTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTc > 1:717423/1‑150 (MQ=255) tCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCa < 2:717423/150‑1 (MQ=255) gcACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCaa > 1:151873/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATAGGCTCACCCGGAAAAGGGGCGACA‑CAGGCTTGGACAGCTCATCGCAACa < 2:1252732/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACAt > 2:1422366/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGc > 2:1103640/1‑80 (MQ=255) cTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCcgc < 1:25152/110‑1 (MQ=255) cTGGCGCAAGTGACACTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCcgc > 2:25152/1‑110 (MQ=255) cTGCCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGc < 1:1103640/80‑1 (MQ=255) ccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAgggg > 1:1246966‑M1/70‑109 (MQ=255) ccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTCTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAgggg < 2:1246966‑M1/40‑1 (MQ=255) cgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCtgt < 2:858142‑M1/6‑1 (MQ=255) cgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCtgt > 1:858142‑M1/69‑74 (MQ=255) gtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGc > 1:952442‑M1/68‑108 (MQ=255) gtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGc < 2:952442‑M1/41‑1 (MQ=255) aCCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTcc > 1:437277/1‑150 (MQ=255) ccTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCcag > 2:446367/1‑150 (MQ=255) gaAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGTGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTc > 1:111694/1‑150 (MQ=255) gatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGc > 1:941926‑M1/46‑86 (MQ=255) gatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGc < 2:941926‑M1/41‑1 (MQ=255) gggTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCGGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCg > 1:539237/1‑150 (MQ=255) gggTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCg < 1:1607397/150‑1 (MQ=255) gTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCt > 1:964275/1‑114 (MQ=255) gTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTCCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCt < 2:964275/114‑1 (MQ=255) gtgcgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAAc > 1:1326887/1‑150 (MQ=255) tgcgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCATGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACg < 1:678146/150‑1 (MQ=255) cgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGATCGGTGCAACACGGc < 2:437277/150‑1 (MQ=255) gagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAg < 2:189343‑M1/37‑1 (MQ=255) gagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAg > 1:189343‑M1/26‑62 (MQ=255) aGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAAcccc > 1:1243312/1‑150 (MQ=255) cTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCG‑CCCTTTCATTGGCTCCCCCGCGAAAAGGGCGACACCAGGC‑GGGAAAGCTCAACGCAACATGCTTCGCGCCTCCAGCAGTTTCACGACCTCCCGCTCGGGGCCCAACCGCAAACCCaaa > 2:1625669/1‑148 (MQ=255) ttATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGTCAACCCCAGAt > 2:1590627/1‑150 (MQ=255) tCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTc < 2:314913/92‑1 (MQ=255) tCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTc > 1:314913/1‑92 (MQ=255) tCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGc > 1:874873/1‑150 (MQ=255) gcgGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCgg > 2:818933/1‑150 (MQ=255) gctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc < 2:1428781‑M1/95‑1 (MQ=255) gctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc > 1:1428781‑M1/15‑109 (MQ=255) aTTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc > 2:888871/1‑106 (MQ=255) aTTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc < 1:888871/106‑1 (MQ=255) aTGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGcc < 1:1614256/148‑1 (MQ=255) aTGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGcc > 2:1614256/1‑148 (MQ=255) aTGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCgg > 1:1228162/1‑150 (MQ=255) | GTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGG > NC_002947/1622379‑1622669 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |