New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 2296108 = | 83 (1.390) | 4 (0.070) | 4/230 | NT | 5.2% | coding (422/600 nt) | PP_2023 | glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | 2296172 = | 67 (1.170) | coding (358/600 nt) | PP_2023 | glutathione S‑transferase family protein |
CGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCCTGCTGGCGGTAATGCTCGCGGGAATGCTCCGGGTAACGTTCGGCATACTTGTACAGGTTCACGTGCGCCTTGAACGTGGTGTCATTGCGCGCAATCAGCGTTT > NC_002947/2295960‑2296252 | cGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAgcccgccc < 1:1581575/150‑1 (MQ=255) agccaCCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCATGGTGCTGGCGCAGCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGc > 1:1350048/1‑150 (MQ=255) aCCCCTCCAGCCAGCGCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGc > 2:1095682/1‑150 (MQ=255) cTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTc > 1:1603021/1‑150 (MQ=255) cTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGCCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCCTCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTc < 2:1214520/150‑1 (MQ=255) ccagccagCTCGGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTGCGACCCCGGCAAACGGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGa < 2:165295/150‑1 (MQ=255) agccagcTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGc > 2:65545/1‑150 (MQ=255) agcTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCg > 2:1299628/1‑150 (MQ=255) gcgGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCTCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCt > 1:1108747/1‑150 (MQ=255) gcgGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCt > 1:930713/1‑150 (MQ=255) gcgGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCt > 2:1232689/1‑150 (MQ=255) gcgGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCt > 2:1615845/1‑150 (MQ=255) cgGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTc < 2:866267/150‑1 (MQ=255) ggATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCg < 2:539212/150‑1 (MQ=255) aTAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGc < 2:361981/150‑1 (MQ=255) tAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCaa < 2:1493317/119‑1 (MQ=255) tAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCaa > 1:1493317/1‑119 (MQ=255) gccgccTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCTCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCctgc < 2:1108747/150‑1 (MQ=255) gccgccTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAGCAACGCGGCATCGGCCATGCTCGGGTGGTCGGCCAGCAGGTAAGCCCGCCCCGCCAGCAAGCCTTCGAGCTCCGCCAGCCAGGCCTCGGCctgc > 1:816944/1‑150 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |