New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3419393 = | 59 (0.990) | 3 (0.060) | 3/216 | NT | 5.9% | intergenic (‑5/+103) | PP_5553/PP_3033 | hypothetical protein/CI/C2 family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 3419425 = | 43 (0.800) | intergenic (‑37/+71) | PP_5553/PP_3033 | hypothetical protein/CI/C2 family transcriptional regulator |
GCGTGCAGGTTGAAGCGGGGGACGACGTAGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCGGGGATGAAGGAGCCCACGACCTTACCGCAGATGTGGGT > NC_002947/3419244‑3419540 | gCGTGCAGGTTGAAGCGGGGGACGACGTAGGGCGGTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTAt > 1:1066815/1‑150 (MQ=255) ctcagtatccaatcatagacatcacggaagagacccacatctgcggtaaggtcgtgggctccttcatccccgagtgatcaacccatcgacccacggccctcttaagaaatcaattttcagttgacataaaacaacaacaagttgatattt < 1:594731‑M1/2‑1 (MQ=255) tGCAGGTTGAAGCGGGGGACGACGTAGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGc > 1:1157825/1‑150 (MQ=255) ggTTGAAGCGGGGGACGACGTAGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCa < 2:1477754/150‑1 (MQ=255) atccaatcatagacatcacggaagagacccacatctgcggtaaggtcgtgggctccttcatccccgagtgatcaacccatcgacccacggccctcttaagaaatcaattttcagttgacataaaacaaccacaagttgatatTTGCCTCa > 1:1420016‑M1/143‑150 (MQ=255) gTTGAAGCGGGGGACGACGTAGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCAc > 2:137276/1‑150 (MQ=255) ttGAAGCGGGGGACGACGTAGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCAct > 1:797558/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGGGGACGACGTAGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCActct > 1:683218/1‑150 (MQ=255) aatcatagacatcacggaagagacccacatctgcggtaaggtcgtgggctccttcatccccgagtgatcaacccatcgacccacggccctcttaagaaatcaattttcagttgacataaaacaaccacaagttgatatTTGCCTCActct < 1:236545‑M1/12‑1 (MQ=255) aaGCGGGGGACGACGTAGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGACCTCTGCAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCtg < 1:197556/150‑1 (MQ=255) aGCGGGGGACGACGTAGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCGGAAGGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCtgt > 1:1178325/1‑150 (MQ=255) gggggACGACGTAGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTgtggt < 2:1308485/150‑1 (MQ=255) gggACGACGTAGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGtggtgg > 2:672834/1‑150 (MQ=255) gggACGACGTAGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGAAATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCGCACTCTGtggtgg > 1:653042/1‑150 (MQ=255) acatcacggaagagacccacatctgcggtaaggtcgtgggctccttcatccccgagtgatcaacccatcgacccacggccctcttaagaaatcaattttcagttgacataaaacaaccacaagttgatatTTGCCTCActc < 2:316975‑M1/11‑1 (MQ=255) acatcacggaagagacccacatctgcggtaaggtcgtgggctccttcatccccgagtgatcaacccatcgacccacggccctcttaagaaatcaattttcagttgacataaaacaaccacaagttgatatTTGCCTCActc > 1:316975‑M1/131‑141 (MQ=255) aGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAgg < 1:1503548/150‑1 (MQ=255) gTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCtgtg > 2:1000259/1‑131 (MQ=255) gTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCtgtg < 1:1000259/131‑1 (MQ=255) gTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCaa < 2:692226/150‑1 (MQ=255) tAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAAc > 1:1508804/1‑150 (MQ=255) gTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACtt < 1:1272078/150‑1 (MQ=255) tGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTtg > 1:295421/1‑150 (MQ=255) cGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTgg < 2:1066815/150‑1 (MQ=255) gAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGgt > 1:891012/1‑150 (MQ=255) cgcAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGCATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGttt > 1:526018/1‑150 (MQ=255) gcAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGtttt < 2:1157825/150‑1 (MQ=255) ttGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTAt < 1:149456/139‑1 (MQ=255) ttGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTAt > 2:149456/1‑139 (MQ=255) tGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGaaaa < 1:1197447/150‑1 (MQ=255) gCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAAc > 2:1603144/1‑121 (MQ=255) gCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAAc < 1:1603144/121‑1 (MQ=255) gTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAaga > 1:534544/1‑100 (MQ=255) gTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAaga < 2:534544/100‑1 (MQ=255) gTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCaa > 1:592773/1‑137 (MQ=255) gTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCaa < 2:592773/137‑1 (MQ=255) tCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGaa < 2:704575/97‑1 (MQ=255) tCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGaa > 1:704575/1‑97 (MQ=255) ccGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTgtgg > 2:123077/1‑89 (MQ=255) ccGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTgtgg < 1:123077/89‑1 (MQ=255) cGGACGTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCTTCACTCTGTGGTGGAAGAGGGAGGCAAATATGAGCTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTTATTTCTTa > 2:570656/1‑150 (MQ=255) atcaacccatcgacccacggccctcttaagaaatcaattttcagttgacataaaacaaccacaagttgatatTTGCCTCActc > 2:1585559‑M1/73‑83 (MQ=255) atcaacccatcgacccacggccctcttaagaaatcaattttcagttgacataaaacaaccacaagttgatatTTGCCTCActc < 1:1585559‑M1/11‑1 (MQ=255) ggACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGGCGCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAg > 1:774055/1‑99 (MQ=255) ggACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAg < 2:774055/99‑1 (MQ=255) ggACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTaa > 2:475328/1‑150 (MQ=255) tttGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAgg < 2:295421/150‑1 (MQ=255) aGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGt > 1:1088989/1‑150 (MQ=255) tCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGAt < 1:177894/150‑1 (MQ=255) gtGGTTGCGGCTGCTGGAAGTACATGTAGTGATGGGGTGGGGTGCAGGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATggg < 2:653042/149‑1 (MQ=255) cctcttaagaaatcaattttcagttgacataaaacaaccacaagttgatatTTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAgg < 1:657142‑M1/29‑1 (MQ=255) cctcttaagaaatcaattttcagttgacataaaacaaccacaagttgatatTTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAgg > 2:657142‑M1/52‑80 (MQ=255) tGGTTGCGGCTGGTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCGTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACCTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGt < 2:1288949/150‑1 (MQ=255) ggTTGCGGCTGCTGGATGGACCTGCCGTGCTGCGGTGGCGTTCATGGTATTGGCTCACTCTGGGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGtt < 2:1088989/150‑1 (MQ=255) ttGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTgtggt > 2:426394/1‑64 (MQ=255) ttGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTgtggt < 1:426394/64‑1 (MQ=255) ggCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATg > 2:1046812/1‑99 (MQ=255) ggCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATg < 1:1046812/99‑1 (MQ=255) gctgGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCgg < 2:1508804/150‑1 (MQ=255) ggatggaCATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGt > 2:991778/1‑124 (MQ=255) ggatggaCATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGt < 1:991778/124‑1 (MQ=255) tggaCATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTtgtg < 1:1213689/78‑1 (MQ=255) tggaCATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTtgtg > 2:1213689/1‑78 (MQ=255) gaCATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCCCGGTATTGCTTCAGTTTGTGGTTGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCGGGGATGAAg < 1:1598601/150‑1 (MQ=255) gaCATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCGGGGATGAAg < 1:475328/150‑1 (MQ=255) tGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCgg < 2:663476/138‑1 (MQ=255) tGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCgg > 1:663476/1‑138 (MQ=255) gTAGCGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCACCTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCCTGGGTCGATGGGTTGATCACTCGGGGATGAAGGAGcc > 1:751670/1‑150 (MQ=255) tGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAGAATTGATTTCTTAAGAGTGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCGGTGATGAAGGAGCCCACGAcc > 1:1187664/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCGGGGATGAAGGAGCCCACGACCTTAcc < 2:797558/150‑1 (MQ=255) ccacaagttgatatTTGCCTCACTCTTCCACCACAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCGGGGATGAAGGAGCCCACGACCTTAcc < 1:664657‑M1/136‑1 (MQ=255) ggTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGt < 1:121400/96‑1 (MQ=255) ggTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGt > 2:121400/1‑96 (MQ=255) ggTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCGGGGATGAAGGAGCCCACGACCTTACCGCAGATGTgg < 1:672834/150‑1 (MQ=255) tATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCGGGGATGAAGGAGCCCACGACCTTACCGCAGATGTGCGt < 2:683218/150‑1 (MQ=255) TTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCGGGGGTGAAGGAGCCCACGACCTTACCGCAGAt < 2:1327978‑M1/142‑1 (MQ=255) TTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCGGGGATGAAGGAGCCCACGACCTTACCGCAGAt > 1:1327978‑M1/1‑142 (MQ=255) | GCGTGCAGGTTGAAGCGGGGGACGACGTAGGGCGTTTGGTAGTGACGAATGCGCAGCCGTGTTGCTTGGCCAGTCGCCGGACTTTGAAGGTTAGGTCGATGGTTGCGGCTGCTGGATGGACATGTAGTGATGCGGTGGCGTGCATGGTATTGCCTCACTCTGTGGTGGAAGAGTGAGGCAAATATCAACTTGTGGTTGTTTTATGTCAACTGAAAATTGATTTCTTAAGAGGGCCGTGGGTCGATGGGTTGATCACTCGGGGATGAAGGAGCCCACGACCTTACCGCAGATGTGGGT > NC_002947/3419244‑3419540 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |