New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3559258 | 42 (0.700) | 4 (0.070) | 4/222 | NT | 8.4% | coding (885/942 nt) | PP_3143 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 3559277 | 48 (0.870) | coding (866/942 nt) | PP_3143 | LysR family transcriptional regulator |
CTGGTGCGCACGCTTAATGCCTTCACCGGTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCATTGAGCAGCGTGCGGCGGGCAATCG > NC_002947/3559122‑3559406 | cTGGTGCGCACGCTTAATGCCTTCACCGGTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCAccgccc > 1:163661/1‑150 (MQ=255) cACGCTTAATGCCTTCACCGGTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACct > 2:583777‑M2/1‑148 (MQ=255) cGCTTAATGCCTTCACCGGTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCTCACctgg > 1:1526838‑M2/1‑146 (MQ=255) gCTTAATGCCTTCACCGGTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACctggc > 1:1181093‑M2/1‑145 (MQ=255) gCTTAATGCCTTCACCGGTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACctggc < 2:1181093‑M2/150‑6 (MQ=255) ttAATGCCTTCACCGGTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACctggctg > 1:629437‑M2/1‑143 (MQ=255) cTTCACCGGTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACctggctggt < 1:1533969‑M2/145‑10 (MQ=255) cTTCACCGGTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACctggctggt > 2:1533969‑M2/1‑136 (MQ=255) aCCGGTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAgccgc < 2:1445557/150‑1 (MQ=255) gTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACACTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAgccgc > 1:193913/1‑146 (MQ=255) gTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACACTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAgccgc < 2:193913/146‑1 (MQ=255) aGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCgg < 2:974624/150‑1 (MQ=255) gCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAAt > 1:40155/1‑150 (MQ=255) ttATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCTGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTAGCGTGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGc < 1:298709/150‑1 (MQ=255) gcTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCtt < 1:1051239/150‑1 (MQ=255) tCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTtgt < 1:1181267/150‑1 (MQ=255) cTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGgtgcgcgggcggtgcatgactggctgg < 1:344392‑M1/108‑28 (MQ=255) cTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGgtgcgcgggcggtgcatgactggcggg > 2:344392‑M1/1‑81 (MQ=255) tGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGgtgcgcgggcggtgcatgactggctg > 2:212347‑M1/1‑80 (MQ=255) tGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGgtgcgcgggcggtgcatgactggctg < 1:212347‑M1/106‑27 (MQ=255) tGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGt < 2:163661/150‑1 (MQ=255) ttCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACTTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTgg > 1:679643/1‑150 (MQ=255) ttCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTgg < 1:483235/150‑1 (MQ=255) cgcgcCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCg < 2:137960/150‑1 (MQ=255) aGCTGGTTAATACTTGTTCAACGGATGCATCACCCTGCACCCCCGCGCAGCTGCCACCAGCCAGTCAGGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACAcc > 2:16802/1‑150 (MQ=255) ttCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGATCCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTGCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCAc < 1:719495/150‑1 (MQ=255) ttCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGt > 1:153653/1‑150 (MQ=255) aaCGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGcc > 2:1525580/1‑150 (MQ=255) aCGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCGCCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGccc > 1:28267/1‑150 (MQ=255) aCGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTAccc > 1:612752/1‑150 (MQ=255) cGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAAc > 1:630650/1‑133 (MQ=255) cGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAAc < 2:630650/133‑1 (MQ=255) gATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCa < 1:60087/135‑1 (MQ=255) gATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCa > 2:60087/1‑135 (MQ=255) aaCACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAAc < 2:1259849/126‑1 (MQ=255) aaCACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAAc > 1:1259849/1‑126 (MQ=255) acacCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCa > 2:852246/1‑150 (MQ=255) cccTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGcacca > 1:1424852/1‑87 (MQ=255) cccTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGcacca < 2:1424852/87‑1 (MQ=255) cTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCGAACGGCACGATCAGTACCCCGCGTTCCAGTtca > 1:739365/1‑150 (MQ=255) cccccGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTCCACCAAACGTCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCAtt < 2:679643/150‑1 (MQ=255) cccccGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCAtt < 2:788319/150‑1 (MQ=255) cccccGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGNACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCAtt < 1:1507430/150‑1 (MQ=255) cccGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGt < 1:1386758/104‑1 (MQ=255) cccGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGt > 2:1386758/1‑104 (MQ=255) cccGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCATTGa < 1:1067306/150‑1 (MQ=255) cccGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCATTGa < 1:844505/150‑1 (MQ=255) cccGCGCTTCTCCCCCCCGCCCGTCCTGCGCCGGCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAACCGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCATTGa < 2:739365/150‑1 (MQ=255) ccGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTacac < 2:871901/107‑1 (MQ=255) ccGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTacac > 1:871901/1‑107 (MQ=255) tcttcCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCATTGAGCAGCGTg > 1:171587/1‑150 (MQ=255) accaGCCAGgtgcgcgggcggtgcatgactggctggtggaagaagcgcgggggttcagggtgttgcatccgttgaacaaggaataaccagctgggcgcgcttgaagcaggagcgcttcgctcaataagcctgcttaccggtgaag < 1:1533969‑M1/145‑137 (MQ=255) accaGCCAGgtgcgcgggcggtgcatgactggctggtggaagaagcgcgggggttcagggtgttgcatccgttgaacaaggaataaccagctgggcgcgcttgaagcaggagcgcttcgctcaataagcctgcttaccggtgaag > 2:1533969‑M1/1‑9 (MQ=255) accaGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCATTGa < 1:339068/136‑1 (MQ=255) accaGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCATTGa > 2:339068/1‑136 (MQ=255) cccgccagTCATGCACCGCCCGCGCACctggctggtggaagaagcgcgggggttcagggtgttgcatccgttgaacaaggaataaccagctgggcgcgcttgaagcag > 2:344392‑M2/1‑27 (MQ=255) ccagccagTCATGCACCGCCCGCGCACctggctggtggaagaagcgcgggggttcagggtgttgcatccgttgaacaaggaataaccagctgggcgcgcttgaagcag < 1:344392‑M2/108‑82 (MQ=255) cagccaggtgcgcgggcggtgcatgactggctggtggaagaagcgcgggggttcagggtgttgcatccgttgaacaaggaataaccagctgggcgcgcttgaagcaggagcgcttcgctcaataagcctgcttaccggtgaaggcattaa > 1:629437‑M1/1‑7 (MQ=255) cagccagTCATGCACCGCCCGCGCACctggctggtggaagaagcgcgggggttcagggtgttgcatccgttgaacaaggaataaccagctgggcgcgcttgaagca > 2:212347‑M2/1‑26 (MQ=255) cagccagTCATGCACCGCCCGCGCACctggctggtggaagaagcgcgggggttcagggtgttgcatccgttgaacaaggaataaccagctgggcgcgcttgaagca < 1:212347‑M2/106‑81 (MQ=255) gccaggtgcgcgggcggtgcatgactggctggtggaagaagcgcgggggttcagggtgttgcatccgttgaacaaggaataaccagctgggcgcgcttgaagcaggagcgcttcgctcaataagcctgcttaccggtgaaggcattaagc > 1:1181093‑M1/1‑5 (MQ=255) gccaggtgcgcgggcggtgcatgactggctggtggaagaagcgcgggggttcagggtgttgcatccgttgaacaaggaataaccagctgggcgcgcttgaagcaggagcgcttcgctcaataagcctgcttaccggtgaaggcattaagc < 2:1181093‑M1/150‑146 (MQ=255) ccaggtgagcgggcggtgcatgactggctggtggaagaagcgcgggggttcagggtgttgcatccgttgaacaaggaataaccagctgggcgcgcttgaagcaggagcgcttcgctcaataagcctgcttaccggtgaaggcattaagcg > 1:1526838‑M1/1‑4 (MQ=255) cagTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCATTGAGCAGCGTGCGGCGGGCAATc < 1:852246/150‑1 (MQ=255) cagTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCATTGAGCAGCGTGCGGCGGGCAATc < 1:177334/150‑1 (MQ=255) aggtgcgcgggcggtgcatgactggctggtggaagaagcgcgggggttcagggtgttgcatccgttgaacaaggaataaccagctgggcgcgcttgaagcaggagcgcttcgctcaataagcctgcttaccggtgaaggcattaagcgtg > 2:583777‑M1/1‑2 (MQ=255) agTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTg > 1:1529731/1‑105 (MQ=255) agTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTg < 2:1529731/105‑1 (MQ=255) agTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCATTGAGCAGCGTGCGGCGGGCAATCg > 2:1122811/1‑150 (MQ=255) | CTGGTGCGCACGCTTAATGCCTTCACCGGTAAGCAGGCTTATTGAGCGAAGCGCTCCTGCTTCAAGCGCGCCCAGCTGGTTATTCCTTGTTCAACGGATGCAACACCCTGAACCCCCGCGCTTCTTCCACCAGCCAGTCATGCACCGCCCGCGCACCTGGCTGGTTCAAGCCGCCTGGCGGGTAATGCACCACATAACGCTTGTGGTTGGCGATCGGTACACCAAACGGCACGATCAGTGCCCCGCGTTCCAGTTCATCATTGAGCAGCGTGCGGCGGGCAATCG > NC_002947/3559122‑3559406 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |