| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 5537127 | 69 (1.490) | intergenic (+56/+47) | nadE/PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGG‑CCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTC > NC_002947/5536958‑5537254 | gcgcAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGG‑CCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAc > 1:194965/1‑150 (MQ=255) aGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGG‑CCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAgg < 1:389327/150‑1 (MQ=255) aGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGG‑CCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAgg < 2:1138861/150‑1 (MQ=255) aGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGGTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCTCGAACTGCCTTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCCCACAGGA‑CGGGACCACCCGCGAATACGAgg > 1:820059/1‑150 (MQ=255) aTCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGG‑CCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGt < 1:1473552/150‑1 (MQ=255) gATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGG‑CCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGaa < 2:493807/150‑1 (MQ=255) ttCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGG‑CCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATgcgtcggtgggttcacc > 2:142531‑M1/1‑133 (MQ=255) tCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGG‑CCTGCAGGAGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAAcccgctc < 2:1318502/150‑5 (MQ=38) 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gAATgcgtcggtgggttcaccctcgtattcgcgggtgaacccgctcctgcaggccacttatcaaggagc < 1:673337‑M1/69‑66 (MQ=255) gAATgcgtcggtgggttcaccctcgtattcgcgggtgaacccgctcctgcaggccacttatcaaggagc > 2:673337‑M1/1‑4 (MQ=255) aTgcgtcggtgggttcaccctcgtattcgcgggtgaacccgctcctgcaggccacttatcaaggagcgaacggcagttcgcgcttgtgctgggtcttgcggt > 1:814173‑M1/1‑2 (MQ=255) aTgcgtcggtgggttcaccctcgtattcgcgggtgaacccgctcctgcaggccacttatcaaggagcgaacggcagttcgcgcttgtgctgggtcttgcggt < 2:814173‑M1/102‑101 (MQ=255) tACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTc < 1:1023391/150‑1 (MQ=255) | GCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGG‑CCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTC > NC_002947/5536958‑5537254 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |