New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 423331 = | 72 (1.200) | 4 (0.070) | 4/230 | NT | 5.6% | coding (620/2787 nt) | PP_0348 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 423368 = | 66 (1.150) | coding (583/2787 nt) | PP_0348 | hypothetical protein |
GGTCGGGTGAGGCGTTGCTCCACAAGCCGGTGTCACTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCTGCACAGCAAGGCAGCGCCTGCGGCATCCTGAG > NC_002947/423221‑423514 | ggTCGGGTGAGGCGTTGCTCCCCAAGCAGGTGTCCCTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCTCACTGTCGGTCCGGGCCTCCAGCAGGTTCTCGGCGTACCAGTCCTAGGGCAGACACTGTGACCGGCGAGCGCGGTGCGCCTGCgtgt > 1:90046/1‑150 (MQ=255) ggTCGGGTGAGGCGTTGCTCCACAAGCCGGTGTCACTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCgtgt < 1:32365/150‑1 (MQ=255) ggTCGGGTGAGGCGTTGCTCCACAAGCCGGTGTCACTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCgtgt < 1:1632409/150‑1 (MQ=255) gTTGCTCCACAAGCCGGTGTCACTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATg > 2:814132/1‑150 (MQ=255) tCCACAAGCCGGTGTCACTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTAc > 2:17802/1‑140 (MQ=255) tCCACAAGCCGGTGTCACTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTAc < 1:17802/140‑1 (MQ=255) gCCGGTGTCACTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCt > 2:434415/1‑150 (MQ=255) tCACTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTgg > 2:282189/1‑150 (MQ=255) cACTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTg > 1:718063/1‑148 (MQ=255) cACTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTg < 2:718063/148‑1 (MQ=255) cTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTggcgg < 1:1291649/150‑4 (MQ=255) cTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTCCGTGTAAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGt < 1:1270159/150‑1 (MQ=255) ccaGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGCCCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTgg < 2:90046/148‑1 (MQ=255) cAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTgg < 2:1261272/150‑1 (MQ=255) cAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTgg < 1:227142/150‑1 (MQ=255) aaGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTgg < 1:555395/149‑1 (MQ=255) aaGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTgg > 2:555395/1‑149 (MQ=255) aaGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGAGCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTggg > 2:72915/1‑150 (MQ=255) aaGCGTTGGCGGTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTggg > 2:407885/1‑150 (MQ=255) aGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGt < 1:1355742/150‑1 (MQ=255) gttggcgttggGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCtt < 1:1225074/150‑1 (MQ=255) gttggcgttggGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCtt > 2:1225074/1‑150 (MQ=255) ttggcgttggGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTc < 1:814132/150‑1 (MQ=255) atctcgttggGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCATGGTTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTc < 1:1042032/146‑1 (MQ=255) gcgttggGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAg < 2:1284393/150‑1 (MQ=255) gcgttggGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAg < 2:1444343/150‑1 (MQ=255) gttggGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCGGCCCGTGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAgat > 2:1042032/1‑148 (MQ=255) gaacgcctggaagacccactccagagcagaccgctgctgcatctgtacactgacaCGCAGACGCTTTGACCGGAGAGCGCGGTCCGCCTGCgt > 2:604327‑M1/56‑93 (MQ=255) gaacgcctggaagacccactccagagcagaccgctgctgcatctgtacactgacaCGCAGACGCTTTGACCGGAGAGCGCGGTCCGCCTGCgt < 1:604327‑M1/38‑1 (MQ=255) aTCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGc > 2:1047865/1‑150 (MQ=255) tGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGc < 1:1513154/132‑1 (MQ=255) tGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGc > 2:1513154/1‑132 (MQ=255) gATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAg > 1:369643/1‑150 (MQ=255) aTCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTgg < 2:1342181/116‑1 (MQ=255) aTCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTgg > 1:1342181/1‑116 (MQ=255) aTCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGt < 2:369643/150‑1 (MQ=255) aTCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGt < 1:1202708/150‑1 (MQ=255) gggCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTgcgc > 1:1498444/1‑150 (MQ=255) catagcagaccgctgctgcatctgtacactgacaCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCa < 1:645212‑M1/42‑1 (MQ=255) cagagcagaccgctgctgcatctgtacactgacaCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCa > 2:645212‑M1/35‑76 (MQ=255) ccTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCCCTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCa > 1:21977/1‑150 (MQ=255) cTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTggg > 2:37812/1‑109 (MQ=255) cTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTggg < 1:37812/109‑1 (MQ=255) cTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAg > 2:635227/1‑150 (MQ=255) tCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGt < 1:407885/150‑1 (MQ=255) tCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGt < 2:21977/150‑1 (MQ=255) cagcagGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGct > 1:1163644/1‑96 (MQ=255) cagcagGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGct < 2:1163644/96‑1 (MQ=255) agcagGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAg > 2:603042/1‑150 (MQ=255) cagGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTc < 2:241133/150‑1 (MQ=255) gTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTg > 2:139117/1‑93 (MQ=255) gTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTg < 1:139117/93‑1 (MQ=255) tATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCCGTGCGCCCACTGCGCCGCAAg > 2:505503/1‑150 (MQ=255) cGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCt < 1:79515/150‑1 (MQ=255) gCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCgt < 1:902483/53‑1 (MQ=255) gCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCgt > 2:902483/1‑53 (MQ=255) aGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCTAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCt < 2:1647960/149‑1 (MQ=255) aGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCTAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCt > 1:1647960/1‑149 (MQ=255) aGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCtt > 1:584277/1‑150 (MQ=255) aGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCtt > 1:298239/1‑150 (MQ=255) tCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTtgt > 2:404674/1‑150 (MQ=255) tgacacgcaggcggaccgcgctcgccggtcaaagcgtctgcgTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTg > 2:645212‑M2/43‑76 (MQ=255) tgacacgcaggcggaccgcgctcgccggtcaaagcgtctgcgTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTATg < 1:645212‑M2/34‑1 (MQ=255) aTAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAACTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGa > 2:218773/1‑150 (MQ=255) aTAGCGCAGACGCCTTGAAAGCCGAGAGCAGTCCTCATGCGCGGGAGTTGACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTGGAAAGCCTCGATGCCTTGTGa > 2:677198/1‑150 (MQ=255) acgcaggcggaccgcgctctccggtcaaagcgtctgcgTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTc < 1:604327‑M2/55‑1 (MQ=255) acgcaggcggaccgcgctctccggtcaaagcgtctgcgTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTc > 2:604327‑M2/39‑93 (MQ=255) CAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCt > 2:584277‑M1/1‑150 (MQ=255) aCGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCTGca < 1:404674/150‑1 (MQ=255) gCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGa < 2:87768/139‑1 (MQ=255) gCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGa > 1:87768/1‑139 (MQ=255) tttGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTg < 1:924070/67‑1 (MQ=255) tttGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTg > 2:924070/1‑67 (MQ=255) tttGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCTGCACAGc > 2:956497/1‑150 (MQ=255) tGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCTGCAcaacaa < 2:1161952/150‑1 (MQ=255) cGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTgcgc > 1:161364/1‑100 (MQ=255) cGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTgcgc < 2:161364/100‑1 (MQ=255) cGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCTGCACAGCAAGGCa > 1:501680/1‑150 (MQ=255) gcgGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCTGCACAGCAAGGCAGCGCCTGc < 1:1418345/150‑1 (MQ=255) gcgGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCTGCACAGCAAGGCAGCGCCTGc < 1:9150/150‑1 (MQ=255) cGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCTGCACAGCAAGGCAGCGCCTGCGGCATc > 1:1394841/1‑150 (MQ=255) gCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCTGCACAGCAAGGCAGCGCCTGCg < 1:1240137/144‑1 (MQ=255) gCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCTGCACAGCAAGGCAGCGCCTGCg > 2:1240137/1‑144 (MQ=255) gcgTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCTGCACAGCAAGGCAGCGCCTGCGGCATCCTGAg < 2:1394841‑M2/147‑1 (MQ=255) | GGTCGGGTGAGGCGTTGCTCCACAAGCCGGTGTCACTCAAGCGTTGGCGTTGGGCTTCTATCGCACTGTCGATCTGGGCCTCCAGCAGGTTATCGGCGTACCAGTCATAGCGCAGACGCTTTGACCGGCGAGCGCGGTCCGCCTGCGTGTCAGTGTACAGATGCAGCAGCGGTCTGCTCTGGAGTGGGTCTTCCAGGCGTTCGCAAAGCTCCTGGTGCAGTGCGCCCAGTGAGTCGAAAGCCTCGATGCCTTGTGACAGGCTGCACAGCAAGGCAGCGCCTGCGGCATCCTGAG > NC_002947/423221‑423514 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |