New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1149945 | 64 (1.070) | 4 (0.070) | 4/224 | NT | 6.4% | intergenic (‑186/+71) | PP_1008/gapA | RNA polymerase subunit sigma‑24/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 2354586 | 58 (1.040) | intergenic (‑12/+46) | PP_2068/PP_2069 | multidrug MFS transporter membrane fusion protein/multidrug MFS transporter outer membrane protein |
ATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTC > NC_002947/2354441‑2354727 | aTGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCttcg < 1:1049261‑M2/150‑5 (MQ=255) aTGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCCGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCttcg > 1:189278‑M2/1‑146 (MQ=255) ggttTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTa < 1:1346507/150‑1 (MQ=255) aaTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTggg > 2:1307108/1‑150 (MQ=255) tctcGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCg > 1:245080/1‑150 (MQ=255) ctcGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCgg > 1:833613/1‑150 (MQ=255) tcGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCttcgcgg > 2:552034‑M2/1‑129 (MQ=255) tcGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCttcgcgg < 1:552034‑M2/136‑8 (MQ=255) tcGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGt > 2:634856/1‑150 (MQ=255) tttggCTTGCGGGCTGTCGGTGGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCg < 2:997872/147‑1 (MQ=255) ccTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCgctgct > 2:673679/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGctgctg < 2:245080/150‑1 (MQ=255) gctggctgTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTCGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGt < 1:1090055/150‑1 (MQ=255) gctgTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTg < 1:673679/150‑1 (MQ=255) tgTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGcc > 2:1066820/1‑150 (MQ=255) tCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCctc > 2:529200/1‑150 (MQ=255) tgGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCtt > 2:1610403/1‑138 (MQ=255) tgGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCtt < 1:1610403/138‑1 (MQ=255) tgGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTac > 1:535331/1‑150 (MQ=255) tgGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTac < 1:1579168/150‑1 (MQ=255) gggAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTacc > 1:1538548/1‑150 (MQ=255) gAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTaccac > 2:1431468/1‑150 (MQ=255) ccACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCAccgc > 2:1576799/1‑150 (MQ=255) aCTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCAccgccc > 2:1558921/1‑150 (MQ=255) gTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGc < 1:971072/129‑1 (MQ=255) gTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGc > 2:971072/1‑129 (MQ=255) cTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCgctg < 1:487618/113‑1 (MQ=255) cTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCgctg > 2:487618/1‑113 (MQ=255) cTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTGCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAgcgc < 1:275942/150‑1 (MQ=255) tCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAgcgcg > 2:1349349/1‑150 (MQ=255) aaaaGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAgg > 1:883504/1‑150 (MQ=255) aaaaGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAgg > 1:131915/1‑150 (MQ=255) aaaGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGt < 1:1431468/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTCCAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTAc < 1:1349349/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTAcc > 1:1370704/1‑150 (MQ=255) cgcgTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTgc < 2:131915/150‑1 (MQ=255) ggCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGgcg < 2:883504/150‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGcc < 2:833613/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCt < 2:2683/131‑1 (MQ=255) ttGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCt > 1:2683/1‑131 (MQ=255) tGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCttcgcgggcaaggccgctcccacacgggtcgcgtcagcttttagaaattgagcaagacagttgctcccaaaaaaagcaaacggcatccagtgactacaatctt < 1:1366333‑M2/150‑104 (MQ=255) gCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTc < 1:1576799/150‑1 (MQ=255) ccGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCgg > 1:1150277/1‑150 (MQ=255) ccGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCttcgcgggcaagcccgctcccccagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaagacagttgctcccaaaaaaagcaaacggcatccagtgactacaatctttac < 1:1491928‑M2/150‑107 (MQ=255) gcgAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGc > 1:960482/1‑150 (MQ=255) gcgAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGc < 2:1150277/150‑1 (MQ=255) acacGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCt < 1:412843/150‑1 (MQ=255) cGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCtgtg < 2:960482/150‑1 (MQ=255) cGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCtgtg < 2:1370704/150‑1 (MQ=255) ggggGAAGTCCGTGCCATCCACCGGGGTGTATTCTTCGCGGGTACCGTGGGCGGTGCGCGCTGCTGGTCTTGCCTGTCGTTACTACCGACCGCCCACCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCCGGCTTCtctgt > 2:222998/1‑150 (MQ=255) gggCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCg > 2:467325/1‑79 (MQ=255) gggCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCg < 1:467325/79‑1 (MQ=255) gggCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCtgtgt > 2:1505687/1‑150 (MQ=255) gggCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCAATTCCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCtgtgt < 1:529200/150‑1 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCt > 1:1341027/1‑150 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGATGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCt > 1:1328321/1‑150 (MQ=255) aTCCACCACGGTGTTGGCttcgcgggcaaggccgctcccccagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaagacagttgctcccaaaaaaagcaaacggc < 2:827000‑M2/102‑85 (MQ=255) aTCCACCACGGTGTTGGCttcgcgggcaaggccgctcccccagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaagacagttgctcccaaaaaaagcaaacggc > 1:827000‑M2/1‑18 (MQ=255) cACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCa > 2:1176484/1‑77 (MQ=255) cACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCa < 1:1176484/77‑1 (MQ=255) ccGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTg < 2:149501/103‑1 (MQ=255) ccGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTg > 1:149501/1‑103 (MQ=255) cgcgGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGtt < 2:1573581/132‑1 (MQ=255) cgcgGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGtt > 1:1573581/1‑132 (MQ=255) ggTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTc < 1:634856/150‑1 (MQ=255) ggTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTc < 1:1505687/150‑1 (MQ=255) ggTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTc < 1:1066820/150‑1 (MQ=255) tATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCt < 2:1238831/117‑1 (MQ=255) tATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCt > 1:1238831/1‑117 (MQ=255) aTTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAgcgcgc > 2:1542194/1‑72 (MQ=255) aTTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAgcgcgc < 1:1542194/72‑1 (MQ=255) | ATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTC > NC_002947/2354441‑2354727 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |