| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2753962 = | 72 (1.200) | 6 (0.100) | 6/232 | NT | 8.0% | coding (245/3147 nt) | czcA‑II | cation efflux system protein |
| ? | NC_002947 | 2753984 = | 68 (1.170) | coding (267/3147 nt) | czcA‑II | cation efflux system protein | |||||
CCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCGGGCATGGGGCCGATCTCCACCGGGCTGG > NC_002947/2753835‑2754126 | ccGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGc < 1:374021/150‑1 (MQ=255)ccGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGc > 1:727397/1‑150 (MQ=255) cGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGcc > 2:938697/1‑150 (MQ=255) gACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCGGTCGCGCTCGGGCCTg > 1:1396007/1‑150 (MQ=255) aCATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACCCCGCCGCCCACCAATGCTCTCAGGCTGATACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGt < 2:861691/150‑1 (MQ=255) cATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTc < 1:1495550/150‑1 (MQ=255) gcccgcctcgatgccctcaggcaattgctcgcgggccacctgcaggcgctcgttgaccagttggcgggcgaagaagatatcggtgccatcatcgaaaatgaccgtgacttgcgacaggCCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGt > 1:1123409‑M1/119‑145 (MQ=255) gcccgcctcgatgccctcaggcaattgctcgcgggccacctgcaggcgctcgttgaccagttggcgggcgaagaagatatcggtgccatcatcgaaaatgaccgtgacgtgcgacaggCCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGt < 2:1123409‑M1/27‑1 (MQ=255) aCTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCaa > 2:468738/1‑150 (MQ=255) cTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAg > 2:1208799/1‑150 (MQ=255) tAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCTCCTCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGt > 1:856407/1‑150 (MQ=255) tAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCTTCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGt > 2:1460985/1‑150 (MQ=255) tAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGt > 2:1537646/1‑150 (MQ=255) tAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGt > 1:218507/1‑150 (MQ=255) tcttCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGGCCGAGCAGCGCATCATCTTTTTCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCa < 2:794266/147‑1 (MQ=255) gTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACg > 2:122522/1‑150 (MQ=255) tCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCACTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACgg > 1:1462939/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCAGGTCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCAcaga > 1:794266/1‑147 (MQ=255) cAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTc > 1:184787/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCa > 2:1033206/1‑150 (MQ=255) cAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGCGCTTGGCATTTCCTTGGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTc < 2:1277435/150‑1 (MQ=255) gATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGCCCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTGGCCCTCGGGCCTGTCGTAAGTCACGGTCATTTTCgt > 2:529135/1‑149 (MQ=255) gATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCga < 2:1396007/150‑1 (MQ=255) aTCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATAGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCgat < 1:1902/150‑1 (MQ=255) aaCACCGCCGCCCCCGTCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGTTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCgatgat < 1:468738/150‑1 (MQ=255) acCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATgg < 1:1623013/149‑1 (MQ=255) acCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATgg > 2:1623013/1‑149 (MQ=255) ccgccCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCg > 2:1602086/1‑150 (MQ=255) tccagcGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGat > 1:600705/6‑150 (MQ=255) gccCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGat < 1:1537646/150‑1 (MQ=255) cccGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATAtc < 2:856407/150‑1 (MQ=255) cccGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATAtc < 1:27391/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACg < 1:1132711/115‑1 (MQ=255) ttCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACg > 2:1132711/1‑115 (MQ=255) cgcTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTcgcccgcc > 2:59160/1‑150 (MQ=255) cTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGAAGCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGGTCTCTTCTTggcccgccga > 1:1126299/1‑148 (MQ=255) ggAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACt < 1:938697/150‑1 (MQ=255) gagaCCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTg < 1:229218/150‑1 (MQ=255) aCCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCGGCCAACTGGTc > 1:39912/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCaa > 1:1068587/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCaa < 2:1068587/150‑1 (MQ=255) tcagcGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGa < 1:589326/149‑1 (MQ=255) agcGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAgc < 2:600705/150‑1 (MQ=255) cgcATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAgcgc < 1:1208799/150‑1 (MQ=255) cATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCt > 1:981396/1‑150 (MQ=255) aTCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCGTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTg > 2:769631/1‑150 (MQ=255) cTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGt < 1:122522/150‑1 (MQ=255) tttGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGatgatg < 1:604230/100‑1 (MQ=255) tttGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGatgatg > 2:604230/1‑100 (MQ=255) tttGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTg > 2:1149946/1‑150 (MQ=255) ttGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTgg < 1:59160/150‑1 (MQ=255) aagatatcggtgccatcatcgaaaatgaccgtgacttgcgacaggCCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCt < 2:309852‑M1/25‑1 (MQ=255) aagatatcggtgccatcatcgaaaatgaccgtgacttgcgacaggCCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCt > 1:309852‑M1/46‑70 (MQ=255) cGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCTCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGa < 2:884650/150‑1 (MQ=255) aCCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCaa < 2:218507/150‑1 (MQ=255) cgcgATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAAtt > 2:1309479/1‑150 (MQ=255) gctggcCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCACTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAg < 2:1462939/150‑1 (MQ=255) gaaaatgaccgtgacttgcgacaggCCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGc > 2:701507‑M1/26‑48 (MQ=255) gaaaatgaccgtgacttgcgacaggCCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGc < 1:701507‑M1/23‑1 (MQ=255) tggcCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAggg > 1:1424127/1‑150 (MQ=255) tggcCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAggg > 2:806419/1‑150 (MQ=255) tggcCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAggg > 2:806242/1‑150 (MQ=255) tggcCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGACCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGAAGGGGCACCGGTCGACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGgggg > 2:457132/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCAACGAg > 2:168822/1‑150 (MQ=255) cAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAgg > 1:785773/1‑150 (MQ=255) aGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGc > 2:324786/1‑150 (MQ=255) ggCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTTGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCgg < 1:1251475/150‑1 (MQ=255) ggCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCgg < 2:981396/150‑1 (MQ=255) ggCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCgg < 1:806242/150‑1 (MQ=255) ggCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCgg < 1:806419/150‑1 (MQ=255) ggCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGACCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCAACAAGCAATTGCCTGGGGGCATCGAGGCgg < 1:457132/150‑1 (MQ=255) cAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCGGGCAt < 1:1460985/150‑1 (MQ=255) aaGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACGGGTCAACGCGCGCCTGCAGGTGGCCTGGGCGCAATAGACTGGGGGAAGAGAGGCGGGCaga > 1:489787/1‑148 (MQ=255) aGCAGACCCGCTCGCTGTCACGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGGCATTTGCGATGAGGGCACGGAGATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAGCGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCGGGCATgg > 2:513021/1‑150 (MQ=255) gCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTAACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCGGGCATggg > 2:8747/1‑150 (MQ=255) acaggcccgagcgcgacagcgagcgggCCTGTCGCACGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCGGGc < 2:1123409‑M2/118‑1 (MQ=255) acaggcccgagcgcgacagcgagcgggCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCGGGc > 1:1123409‑M2/28‑145 (MQ=255) aggcccgagcgcgacagcgagcgggCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATAtctt < 2:309852‑M2/45‑1 (MQ=255) aggcccgagcgcgacagcgagcgggCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATAtctt > 1:309852‑M2/26‑70 (MQ=255) aGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCAACGAGGCGGGCATGGGGc < 1:168822/150‑1 (MQ=255) gcccgagcgcgacagcgagcgggCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTc < 1:701507‑M2/25‑1 (MQ=255) gcccgagcgcgacagcgagcgggCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTc > 2:701507‑M2/24‑48 (MQ=255) CCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAgcgc < 1:736825‑M1/95‑1 (MQ=255) CCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAgcgc > 2:736825‑M1/1‑95 (MQ=255) CCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCGGGCATGGGGCCGAt < 2:1481093‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCGGGCATGGGGCCGAt > 2:727397‑M1/1‑150 (MQ=255) tcgctGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGa > 2:39926/1‑107 (MQ=255) tcgctGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGa < 1:39926/107‑1 (MQ=255) tCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCGGGCATGGGGCCGATCTCCACCggg > 2:1008126/1‑150 (MQ=255) cgcTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCGGGCATGGGGCCGATCTCCACCGGGCTg < 1:194871/150‑1 (MQ=255) gcTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCgg > 1:163598/1‑123 (MQ=255) gcTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCgg < 2:163598/123‑1 (MQ=255) gcTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCAACACAACCGCTCAACGAGCGCCTTCAGGTTTCCCGCGAGCAATTGCCTGAGTGCATCGAGGCGGGCATGGGGCCGATCTCCACCGGGCTgg < 2:184787/150‑1 (MQ=255) cTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAg > 2:1272563/1‑76 (MQ=255) cTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAg < 1:1272563/76‑1 (MQ=255) | CCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATTGCCTGAGGGCATCGAGGCGGGCATGGGGCCGATCTCCACCGGGCTGG > NC_002947/2753835‑2754126 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |