New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2798676 = | 64 (1.070) | 5 (0.090) | 5/224 | NT | 8.3% | coding (105/693 nt) | endX | extracellular DNA endonuclease |
? | NC_002947 | 2798707 = | 51 (0.910) | coding (74/693 nt) | endX | extracellular DNA endonuclease |
GCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACACCGCCATCGTCGCGATGGGCGAGGGTGAC > NC_002947/2798573‑2798852 | ggacgataccgaaggaagattgactgcgcatgagagtttcgcttttcgcagcagcctgcctgttactgaccactccgcttgctcaagccgacgccccgcgcaccttccaggcgaccttcttggcctcctggaagGTGCGCGGGGCGTc < 2:787841‑M2/14‑1 (MQ=255) ggacgataccgaaggaagattgactgcgcatgagagtttcgcttttcgcagcagcctgcctgttactgaccactccgcttgctcaagccgacgccccgcgcaccttccaggcgaccttcttggcctcctggaagGTGCGCGGGGCGTc > 1:787841‑M2/135‑148 (MQ=255) tGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCt > 2:420457/1‑150 (MQ=255) gCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGa < 1:1282809/150‑1 (MQ=255) ttGCGTGGGGAATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGc < 2:1539084/150‑1 (MQ=255) tggCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCAGAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGc < 2:551892/148‑1 (MQ=255) gCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCgg > 1:303881/1‑150 (MQ=255) tGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGt < 1:1559163/150‑1 (MQ=255) ggggCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTg < 2:1557828/150‑1 (MQ=255) aTAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAg > 1:461391/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGa > 2:1374648/1‑129 (MQ=255) ccGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGa < 1:1374648/129‑1 (MQ=255) cAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGgctgc > 1:573769/1‑150 (MQ=255) gTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCtgctgc < 1:420457/150‑1 (MQ=255) gACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGt > 2:623242/1‑123 (MQ=255) gACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGt < 1:623242/123‑1 (MQ=255) cTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGt < 2:230779/120‑1 (MQ=255) cTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGt > 1:230779/1‑120 (MQ=255) ttgttgCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGc < 2:303881/150‑1 (MQ=255) ttgCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGaa < 2:573769/150‑1 (MQ=255) cccTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAg > 1:38622/1‑112 (MQ=255) cccTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAg < 2:38622/112‑1 (MQ=255) ccTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAActc > 1:306978/1‑150 (MQ=255) ccTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAActc > 1:1008694/1‑150 (MQ=255) cTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTTCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAAcaggcag > 2:426700/1‑127 (MQ=255) cTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAAcaggcag < 1:426700/127‑1 (MQ=255) ttGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCggg > 2:864359/1‑87 (MQ=255) ttGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCggg < 1:864359/87‑1 (MQ=255) ttGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAAca > 1:619281/1‑121 (MQ=255) ttGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAAca < 2:619281/121‑1 (MQ=255) ttGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACtctc < 2:306978/150‑1 (MQ=255) aGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCa < 2:943284/105‑1 (MQ=255) aGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCa > 1:943284/1‑105 (MQ=255) aGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTc > 1:907667/1‑150 (MQ=255) ccGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGc > 1:1035832/1‑129 (MQ=255) ccGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGc < 2:1035832/129‑1 (MQ=255) aaTAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGt > 1:326347/1‑97 (MQ=255) aaTAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGt < 2:326347/97‑1 (MQ=255) aaTAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATctt > 1:1395284/1‑150 (MQ=255) aTAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCg < 2:246488/125‑1 (MQ=255) aTAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCg > 1:246488/1‑125 (MQ=255) aaaCTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGt > 2:1085706/1‑93 (MQ=255) aaaCTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGt < 1:1085706/93‑1 (MQ=255) aaCTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATcttccttc > 2:245942/1‑150 (MQ=255) ggTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCtt > 2:1238074/1‑71 (MQ=255) ggTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCtt < 1:1238074/71‑1 (MQ=255) gacgccccgcgcacCTTCCAGGAGGCCAAGAAGGTCGCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTcc > 1:787841‑M1/15‑148 (MQ=255) gacgccccgcgcacCTTCCAGGAGGCCAAGAAGGTCGCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTcc < 2:787841‑M1/134‑1 (MQ=255) aTAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTg < 2:907667/150‑1 (MQ=255) agCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGcaca > 1:1333204/1‑150 (MQ=255) cttccaggaggccaagaaggtcgcctggaagGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCaa < 2:78512‑M2/84‑1 (MQ=255) cttccaggaggccaagaaggtcgcctggaagGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCaa > 1:78512‑M2/32‑115 (MQ=255) ttccaggaggccaagaaggtcgcctggaagGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACACCg > 2:18534‑M2/31‑150 (MQ=255) AGGCGACCTTCATGGCCTAGTGGAAGGGGCGCGGGGCGTCGGCGTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACACCGCCAt < 2:1334184‑M1/150‑1 (MQ=255) gACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACACCGCCAtcgtc > 1:550193/1‑150 (MQ=255) aCCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACACCGCCAtcgtcg < 2:1395284/150‑1 (MQ=255) cttcttGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAACAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAAGCTGCACACCGCCATCGTcgcg > 2:841640/1‑150 (MQ=255) ttcttGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACACCGCCATCGTCGCGa > 1:982982/1‑150 (MQ=255) ttGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACACCGCCATCGTCGCGATgg < 1:245942/150‑1 (MQ=255) tcctGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACACCGCCATCGTCGCGATGGGCGAgg > 1:704669/1‑150 (MQ=255) tcctGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACACCGCCATCGTCGCGATGGGCGAgg > 1:1588652/1‑150 (MQ=255) tcctGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACACCGCCATCGTCGCGATGGGCGAgg < 2:982982/150‑1 (MQ=255) gaagGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGaaa > 2:1621581‑M2/5‑71 (MQ=255) gaagGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGaaa < 1:1621581‑M2/67‑1 (MQ=255) gaagGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACACCGCCATCGTCGCGATGGGCGAGGGTGAc > 2:1363482‑M2/5‑150 (MQ=255) | GCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACACCGCCATCGTCGCGATGGGCGAGGGTGAC > NC_002947/2798573‑2798852 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |