| New junction evidence | |||||||||||
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tcaggtcaggCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGa < 2:1051297/150‑1 (MQ=255) caggtcaggCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAg < 2:1255233/150‑1 (MQ=255) gtcaggCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGaa > 2:53798/1‑150 (MQ=255) aggCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTc < 1:518168/150‑1 (MQ=255) ccgcgccgcATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCAc < 1:353201/150‑1 (MQ=255) 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ccGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCGTGTAGTCGCCATGGCGCGTGGTGTTCGCCg > 1:226700/1‑150 (MQ=255) cGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCGTGTAGTCGCCATGGCGCGTGGTGTTCGCCgg < 1:1610872/150‑1 (MQ=255) gCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCGTGTAGTCGCCATGGCGCGTGGTGTTCGCCGGt > 2:367528/1‑150 (MQ=255) gCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCGTGTAGTCGCCATGGCGCGTGGTGTTCGCCGGt > 2:1233718/1‑150 (MQ=255) cA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCGTGTAGTCGCCATGGCGCGTGGTGTTCGCCGGTGc < 2:1144892/150‑1 (MQ=255) a‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGa > 1:817322/1‑72 (MQ=255) a‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGa < 2:817322/72‑1 (MQ=255) a‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCGTGTAGTCGCCATGGCGCGTGGTGTTCGCCGGTGcc > 1:769700/1‑150 (MQ=255) ggTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGTTCACGGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCGTGTAGTCGCCATGGCGCGTGGTGTTCGCCGGTGCCGCt < 1:197100/150‑1 (MQ=255) tACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTtgt < 1:1628158/92‑1 (MQ=255) tACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTtgt > 2:1628158/1‑92 (MQ=255) gcccaaCTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTgtgg < 2:1491215‑M2/71‑1 (MQ=255) gcccaaCTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTgtgg > 1:1491215‑M2/7‑77 (MQ=255) gcccaaCTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCGTGTAGTCGCCATGGCGCGTGGTGTTCGCCGGTGCCGCTGTGGc > 2:984627‑M2/7‑150 (MQ=255) ccaaCTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCgt > 1:552069‑M2/5‑106 (MQ=255) ccaaCTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCgt < 2:552069‑M2/102‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCGTGTAGTCGCCATGGCGCGTGGTGTTCGCCGGTGCCGCTGTGGCTGcc > 2:424922‑M2/3‑150 (MQ=255) | TCAGGATCAGGTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCGTGTAGTCGCCATGGCGCGTGGTGTTCGCCGGTGCCGCTGTGGCTGCC > NC_002947/2961882‑2962177 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |