| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5571471 | 59 (0.990) | 3 (0.060) | 3/212 | NT | 4.9% | intergenic (+42/+99) | queG/yicG | epoxyqueuosine reductase/inner membrane protein |
| ? | NC_002947 | = 5571528 | 64 (1.210) | intergenic (+99/+42) | queG/yicG | epoxyqueuosine reductase/inner membrane protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTG > NC_002947/5571380‑5571671 | tGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAc > 2:459172‑M2/1‑149 (MQ=255) ggcgcgGGCATGTGGAGTGGGCGCGGGCCCGTCACGGACCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCGATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACCCAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcc > 2:770676‑M2/2‑146 (MQ=255) cgAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcccgct < 1:1270050‑M2/150‑9 (MQ=255) gAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcccgctc < 1:1316537‑M2/150‑10 (MQ=255) gCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcccgctccc > 2:263935‑M2/1‑139 (MQ=255) aTGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATAGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcccgctcccac < 2:1120886‑M2/150‑14 (MQ=255) gtgGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAt > 1:681932/1‑150 (MQ=255) tGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCa > 1:559600/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATg < 1:406453/143‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATg > 2:406453/1‑143 (MQ=255) ggCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATg < 2:87070/150‑1 (MQ=255) cccGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCtt < 1:1215260/150‑1 (MQ=255) cccGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTAACCATGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCtt < 1:1365294/150‑1 (MQ=38) ccGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCNTCAGAGCATGCGNCATCCTNGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTg > 1:996454/1‑150 (MQ=255) ccGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTg > 1:1379941/1‑150 (MQ=255) cACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTaaa < 2:1379941/150‑1 (MQ=255) gCTCAATTGCGACCAGCCTCAGAGCATGTGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACATGGAACGCCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACACCCGCTCCCACATGGGCCATGGTGCGCTTGTAAATTGcat < 2:136075/150‑3 (MQ=37) gCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGt < 1:1245978/150‑1 (MQ=255) gCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGt > 1:1114042/1‑150 (MQ=255) gCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGAGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGt < 2:1316537/150‑1 (MQ=255) tAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCActgc > 2:1455985/1‑150 (MQ=255) gCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGCCACGCCAGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCActgctg < 2:230109/150‑1 (MQ=255) cGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTgg < 2:1270050/150‑1 (MQ=255) gACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcccgctccc < 1:416191‑M2/109‑12 (MQ=255) gACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcccgctccc > 2:416191‑M2/1‑98 (MQ=255) aCCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTc > 2:624528/1‑150 (MQ=255) ccTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGt < 2:479248/150‑1 (MQ=255) ccTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGt < 1:1455985/150‑1 (MQ=255) cTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTa < 1:1120886/150‑1 (MQ=255) tCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTa > 2:1303488/1‑149 (MQ=255) tCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTa < 1:1303488/149‑1 (MQ=255) agCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGa > 1:419221/1‑150 (MQ=255) gCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGaa < 2:309641/150‑1 (MQ=255) aTGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACt > 1:1528135/1‑150 (MQ=255) gcgcCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTg < 2:1528135/150‑1 (MQ=255) cgcCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGTTGGTCGTTGTAGTGGAACTTgg < 2:681932/150‑1 (MQ=255) cgcCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTgg > 1:1639074/1‑150 (MQ=255) gcCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTg < 2:1586772/111‑1 (MQ=255) gcCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTg > 1:1586772/1‑111 (MQ=255) gcCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGaa > 1:435969/1‑144 (MQ=255) gcCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGaa < 2:435969/144‑1 (MQ=255) cATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTa > 1:633794/1‑136 (MQ=255) cATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTa < 2:633794/136‑1 (MQ=255) cATCCTTGTGGGAGCGAGCGCGCCCGAGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACAGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGCGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCCTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTgggta > 2:106367/1‑148 (MQ=37) ccTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTg > 2:804840/1‑136 (MQ=255) ccTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTg < 1:804840/136‑1 (MQ=255) ttGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTcc > 2:812987/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAg < 2:858940/150‑1 (MQ=255) cgcgcCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGa < 2:1057821/150‑1 (MQ=255) cccccGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGAtt < 2:1114042/148‑1 (MQ=255) gcCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCGGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTg < 2:685827/150‑1 (MQ=255) gcCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcccgctcccacaaggatggcgcatgctctgaggctggtcgctattgagctccgtgacgggccagcgcccactccacatgctcgcgcaccaat < 2:1138843‑M2/150‑95 (MQ=255) ccGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcccgctcccacaaggatggcgcatgctctgaggctggtcgcta > 2:1150299‑M2/1‑54 (MQ=255) ccGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcccgctcccacaaggatggcgcatgctctgaggctggtcgcta < 1:1150299‑M2/99‑46 (MQ=255) gAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACa < 2:996454/150‑1 (MQ=255) aGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGAtt < 1:93433/138‑1 (MQ=255) aGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGAtt > 2:93433/1‑138 (MQ=255) ggCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTTGTCTCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTgg < 1:690763/114‑1 (MQ=255) ggCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTgg > 2:690763/1‑114 (MQ=255) gCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCAc > 1:1617651/1‑150 (MQ=255) aaCACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCTCGCCCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCa < 1:998598/150‑1 (MQ=255) aaCACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCaa > 2:1111564/1‑139 (MQ=255) aaCACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCaa < 1:1111564/139‑1 (MQ=255) cacaGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTc > 2:1009608/1‑82 (MQ=255) cacaGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTc < 1:1009608/82‑1 (MQ=255) acaGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCActgc > 1:1158421/1‑86 (MQ=255) acaGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCActgc < 2:1158421/86‑1 (MQ=255) caGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGaa < 1:152218/150‑1 (MQ=255) ggAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGCAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCCGGCAgcc > 2:661491/1‑150 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgaagccggtgTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTgcg < 2:1562246‑M2/38‑1 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgaagccggtgTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTgcg > 1:1562246‑M2/25‑62 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgaagccggtgTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTgg > 1:1575935‑M2/25‑85 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgaagccggtgTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTgg < 2:1575935‑M2/61‑1 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgaagccggtgCTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCa < 1:435590‑M2/90‑1 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgaagccggtgCTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCa > 2:435590‑M2/25‑114 (MQ=255) tGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCa > 1:1391410/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAg > 2:1304445/1‑85 (MQ=255) ccGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAg < 1:1304445/85‑1 (MQ=255) ccGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAg > 1:1182655/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCActgctg < 2:1345085/70‑1 (MQ=255) ttCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCActgctg > 1:1345085/1‑70 (MQ=255) ttCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGa < 2:559600/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAg < 2:1391410/150‑1 (MQ=255) gTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTATTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCg > 1:271793‑M2/2‑150 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTg > 2:447044/1‑150 (MQ=255) | TGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTG > NC_002947/5571380‑5571671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |