| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,854,714 | A→G | 5.5% | V226V (GTA→GTG) | tcyP → | sodium/cystine symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,854,714 | 0 | A | G | 5.5% | 218.5 / 2.1 | 73 | V226V (GTA→GTG) | tcyP | sodium/cystine symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/40); new base G (2/2); total (31/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.32e-01 | |||||||||||
GCGACCTGGCGCGGGCCAAGCCGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCGTGGTGGTGTCGTACCTGGGCCTGGGGTTGATG > NC_002947/5854566‑5854858 | gCGACCTGGCGCGGGCCAAGCCGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTaa > 2:1076669/1‑150 (MQ=255)gCGACCTGGCGCGGGCCAAGCCGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTaa > 2:1449514/1‑150 (MQ=255)gCGACCTGGAGCGGCCAGCGCCGACCTCGATGACCATCGTGGTTATTTTTGTCGGGGGCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTaa > 2:837741/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGCGGGCCAAGCCGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATgcg > 2:198008/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCGGGCCAAGCCGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATgcgc > 2:1522339/1‑150 (MQ=255) gcgGGCCAAGCCGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGt > 1:1001812/1‑150 (MQ=255) gcgGGCCAAGCCGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGt > 1:1172735/1‑150 (MQ=255) gCCAAGCCGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCgg < 1:272041/150‑1 (MQ=255) gCCAAGCCGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCgg < 1:789399/150‑1 (MQ=255) cGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGtga < 2:1409614/150‑1 (MQ=255) cGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGtga < 2:1443462/150‑1 (MQ=255) cGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGtga < 2:148838/150‑1 (MQ=255) gACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTCTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGtgat > 2:1543270/1‑150 (MQ=255) tCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAg > 1:437770/1‑150 (MQ=255) gATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGaa > 1:301292/1‑147 (MQ=255) gATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGaa < 2:301292/147‑1 (MQ=255) gATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCt < 2:1280430/150‑1 (MQ=255) catcaGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGAc < 1:542142/150‑1 (MQ=255) atcaGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGAcc > 1:643739/1‑150 (MQ=255) tcaGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTCGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGAccc < 1:981451/150‑1 (MQ=255) gCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGCAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGAGTAATGCGGCTGCTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCt > 2:263264/1‑150 (MQ=255) tggtgATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATg < 1:1598351/150‑1 (MQ=255) tgATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCGCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCg > 1:1399100/1‑150 (MQ=255) tttGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCt > 2:584049/1‑149 (MQ=255) tttGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCt < 1:584049/149‑1 (MQ=255) ccGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGt < 1:1522339/150‑1 (MQ=255) ccGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGt > 2:1539569/1‑150 (MQ=255) cGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGtt > 2:2591/1‑150 (MQ=255) gtgtTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCCGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTtg > 1:1159360/1‑150 (MQ=255) gtTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGATGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTtgat < 1:1076669/150‑1 (MQ=255) ttCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGGGCGCGGCCTGTCGGCCATCCACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCAGGTGCGGGTCGTGATGAAGCGGACGCCCTCTGGCATGCTGGCGTtgacg > 2:237351/1‑148 (MQ=255) ttCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTtgatg < 2:729661/150‑1 (MQ=255) tCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCCTTGGCCGCCTGCAGGCCTGGGTAAGGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTtgatga < 1:198008/150‑1 (MQ=255) tCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTtgatga < 1:1288883/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAag > 2:1101719/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAag > 2:1101779/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAag > 2:1129754/1‑150 (MQ=255) ggCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAagtagt < 1:263264/150‑1 (MQ=255) cgcgCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAg > 2:7094/1‑106 (MQ=255) cgcgCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAg < 1:7094/106‑1 (MQ=255) cgcTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCa < 2:503435/150‑1 (MQ=255) cgcTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCa < 1:2591/150‑1 (MQ=255) cTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGt < 2:437770/150‑1 (MQ=255) cACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGGGCCCTGTCCTCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTACTGCGCCTGGTGTGGGTCGTGATGAAGATGACCCCCTATGGCCTGCCGGCGTTGATGACCAAAGGAGGGGCCAGTTcc > 2:364593/1‑150 (MQ=255) cACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTcc < 1:1449514/150‑1 (MQ=255) aCTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGTCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGGCAGTTGCa > 1:229486/1‑150 (MQ=255) aCTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCggg < 1:1045361/87‑1 (MQ=255) aCTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCggg > 2:1045361/1‑87 (MQ=255) cAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACgga < 2:1001812/150‑1 (MQ=255) aaGGACGACGCCGCGAAGGGCGAGCGCGCCCTGCCGGCCATCGCCACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCGGACCCCATATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACggag < 2:229486/150‑1 (MQ=255) aaGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACggag > 2:1130585/1‑150 (MQ=255) aGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACggagg > 2:168261/1‑150 (MQ=255) cGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCaa < 1:708897/150‑1 (MQ=255) acaGGGCGCGCTCGCCCTGTCGGCCCTCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTtgat < 1:772851/103‑1 (MQ=255) acaGGGCGCGCTCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTtgat > 2:772851/3‑105 (MQ=255) aGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTgg < 1:168261/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCgtggtg < 1:754190/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCgtggtg < 1:1171170/150‑1 (MQ=255) cGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCGTGGTGgtgt < 1:1101719/150‑1 (MQ=255) cGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCGTGGTGgtgt < 1:1101779/150‑1 (MQ=255) ggCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTg > 2:1263325/1‑76 (MQ=255) ggCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTg < 1:1263325/76‑1 (MQ=255) gacATCGACACCCTGTAGGCCGGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCGTGGTGGTGTCg > 2:1179107/3‑150 (MQ=255) aTCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACggag > 1:274353/1‑111 (MQ=255) aTCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACggag < 2:274353/111‑1 (MQ=255) acCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCGTGGTGGTGTCGTAcctgggc < 1:1539569/150‑1 (MQ=255) ccTGCAGGCCTGGGTGATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTtgat < 2:341691/72‑1 (MQ=255) ccTGCAGGCCTGGGTGATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTtgat < 2:342049/72‑1 (MQ=255) ccTGCAGGCCTGGGTGATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTtgat > 1:341691/1‑72 (MQ=255) ccTGCAGGCCTGGGTGATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTtgat > 1:342049/1‑72 (MQ=255) ccTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCGTGGTGGTGTCGTAcctgggcct > 1:1353689/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCGTGGTGGTGTCGTAcctgggcctggg < 1:1370953/150‑1 (MQ=255) gCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCGTGGTGGTGTCGTACCTGGGCCTGGGGTTg < 2:1159360/150‑1 (MQ=255) ccTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCTTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCGTGGTGGTGTCGTACCTGGGCCTGGGGTTGa < 1:837741/150‑1 (MQ=255) cTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCGTGGTGGTGTCGTACCTGGGCCTGGGGTTGAt < 1:1543270/150‑1 (MQ=255) tGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCGTGGTGGTGTCGTACCTGGGCCTGGGGTTGATg < 1:276112/150‑1 (MQ=255) | GCGACCTGGCGCGGGCCAAGCCGACCTCGATCATCAGCGTGGTGATCTTTGCCGTGTTCCTCGGCCTGGCCGCGCTCCACTTGATCAAGGACGACGCCGAGAAGGGCGAGCGCGCCCTGTCGGCCATCGACACCCTGCAGGCCTGGGTAATGCGCCTGGTGCGGGTCGTGATGAAGCTGACCCCCTATGGCGTGCTGGCGTTGATGACCAAAGTAGTGGCCAGTTCCAACACGGAGGACATCCTCAAGCTGGGCAGCTTCGTGGTGGTGTCGTACCTGGGCCTGGGGTTGATG > NC_002947/5854566‑5854858 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |