| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 468,467 | A→G | 5.3% | C831C (TGT→TGC) | PP_0386 ← | sensory box protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 468,467 | 0 | A | G | 5.3% | 231.5 / 2.0 | 75 | C831C (TGT→TGC) | PP_0386 | sensory box protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/32); new base G (2/2); total (41/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.45e-01 | |||||||||||
AACGTCGCGTACCTGCTCTTTCAGGCGCTGGGCGATGCCCTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTC > NC_002947/468323‑468616 | aaCGTCGCGTACCTGCTCTTTCAGGCGCTGGGCGATGCCCTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGt < 1:20614/150‑1 (MQ=255)aaCGTCGCGTAACTGCTGTTTTAGGCGCTGGGGGATTCCCTGGAGCAGCAGGGCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGt > 2:838066/1‑150 (MQ=255) cGTCGCGTACCTGCTCTTTCAGGCGCTGGGCGATGCCCTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGa < 2:366828/150‑1 (MQ=255) tGCTCTTTCAGGCGCTGGGCGATGCCCTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTgg > 2:335894/1‑150 (MQ=255) gCTCTTTCAGGCGCTGGGCGATGCCCTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGa > 2:501983/1‑150 (MQ=255) tttCAGGCGCTGGGCGATGCCCTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCg < 2:1428833/150‑1 (MQ=255) tttCAGGCGCTGGGCGATGCCCTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCg > 2:690709/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGGCGATGCCCTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCg < 2:210606/144‑1 (MQ=255) gcgcTGGGCGATGCCCTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCg > 1:210606/1‑144 (MQ=255) gcgcTGGGCGATGCCCTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTc < 1:1547476/150‑1 (MQ=255) ccTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGa > 2:1278772/1‑114 (MQ=255) ccTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGa < 1:1278772/114‑1 (MQ=255) ccTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGtt > 1:109617/1‑133 (MQ=255) ccTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGtt < 2:109617/133‑1 (MQ=255) ccTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGAt > 1:1619585/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCg < 1:492507/129‑1 (MQ=255) cTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCg > 2:492507/1‑129 (MQ=255) cTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGAtt > 2:855860/1‑150 (MQ=255) gcagcaGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCa < 1:1347255/150‑1 (MQ=255) gACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCgg > 1:413663/1‑150 (MQ=255) ggTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGa > 1:903464/1‑125 (MQ=255) ggTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGa < 2:903464/125‑1 (MQ=255) ccAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACaa > 2:458949/1‑113 (MQ=255) ccAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACaa < 1:458949/113‑1 (MQ=255) ccAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACACGGTGCGATTGTTCAGGCCGGTCAGCGGGTCGtggtgg < 1:855860/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAg > 2:1547437/1‑128 (MQ=255) ccAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAg < 1:1547437/128‑1 (MQ=255) ccAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAAAAAATTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGtggtgg > 2:1621455/1‑150 (MQ=255) cAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGcaca < 1:656716/79‑1 (MQ=255) cAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGcaca > 2:656716/1‑79 (MQ=255) cGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCAATGTTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGt < 1:690709/150‑1 (MQ=255) gTTGATGTTCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTc > 1:1273057/1‑150 (MQ=255) gTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGAt < 1:1078220/146‑1 (MQ=255) gTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTc < 2:413663/150‑1 (MQ=255) gTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGGCGTGGTGGGCTTGAt > 2:1078220/1‑146 (MQ=255) ttGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGc > 2:860242/1‑118 (MQ=255) ttGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGc < 1:860242/118‑1 (MQ=255) gAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGTTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTg > 2:677840/1‑150 (MQ=255) ggTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTgg > 1:296035/1‑141 (MQ=255) ggTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGGGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTgg < 2:296035/141‑1 (MQ=255) gAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCtt > 1:809218/1‑150 (MQ=255) ggTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGa < 1:335894/150‑1 (MQ=255) gTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGa < 1:900079/149‑1 (MQ=255) gTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGa > 2:900079/1‑149 (MQ=255) tCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATg < 2:1273057/150‑1 (MQ=255) cAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCt > 1:1052824/1‑150 (MQ=255) aGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACATCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTg > 2:373310/1‑150 (MQ=255) aGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTg > 1:600517/1‑150 (MQ=255) ggAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTgg > 2:905476/1‑150 (MQ=255) ggAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTgg > 2:905974/1‑150 (MQ=255) aCAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGgaga > 2:25374/1‑150 (MQ=255) cACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGGCGTGGTGGGCTTGATTGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGcagagacc > 1:15809/1‑146 (MQ=255) aCTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCt < 1:25374/150‑1 (MQ=255) aCTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAAGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGAGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCt < 1:1179934/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCTg > 2:1061226/1‑150 (MQ=255) cccTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCt < 2:340298/144‑1 (MQ=255) cccTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCt > 1:340298/1‑144 (MQ=255) ccTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCTGCaaaaa > 1:362352/1‑150 (MQ=255) cGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTACGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGcc < 1:838066/150‑1 (MQ=255) ggTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCa > 1:533182/1‑150 (MQ=255) ttGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCTTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCt > 1:365511/1‑135 (MQ=255) ttGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCt < 2:365511/135‑1 (MQ=255) ggACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTc > 2:476784/1‑96 (MQ=255) ggACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTc < 1:476784/96‑1 (MQ=255) ggACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGGGTGATTGATGCGTGTGATTTCTGCAAAAACCGCCACGaa > 2:1087785/1‑150 (MQ=255) ctcacCTGTGCGCAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCgg < 2:253667/72‑1 (MQ=255) ctcacCTGTGCGCAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCgg > 1:253667/3‑74 (MQ=255) tcacCTGTGCGCAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCgt > 1:493843/2‑78 (MQ=255) tcacCTGTGCGCAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCgt < 2:493843/77‑1 (MQ=255) ccTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTggg < 1:1061226/150‑1 (MQ=255) cTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCt > 2:85041/1‑82 (MQ=255) cTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCt < 1:85041/82‑1 (MQ=255) cTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCTGCaa > 2:1116547/1‑131 (MQ=255) cTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCTGCaa < 1:1116547/131‑1 (MQ=255) cTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGc > 2:1116766/1‑138 (MQ=255) cTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGc < 1:1116766/138‑1 (MQ=255) cTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGt < 2:1619585/150‑1 (MQ=255) acaGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGGTGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGAtctc > 1:254359/1‑150 (MQ=255) | AACGTCGCGTACCTGCTCTTTCAGGCGCTGGGCGATGCCCTTGAGCAGCAGGTCGCCGACCGGGTGGCCAAGGCTGTCGTTGATGTGCTTGAAGCGGTCGAGGTCCAGGAACAGCACTGCGCCCTGGCGGTTGGACACCTGCGCACAGGTGAGTACGCCCTGGAGCCGGTTTTCGAACAAGGTGCGATTGGGCAGGCCGGTCAGCGGGTCGTGGTGGGCTTGATAGTCGAGTTTGGCCTGGGCGTGCTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTC > NC_002947/468323‑468616 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |