| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,066,228 | G→T | 6.5% | R99L (CGG→CTG) | phoR → | two‑component system sensor histidine kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,066,228 | 0 | G | T | 6.5% | 233.4 / 2.8 | 73 | R99L (CGG→CTG) | phoR | two‑component system sensor histidine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/37); new base T (3/2); total (34/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
CTGCGCTTGCACGACTGGCTGCGCAATCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGACCCCACAGGACGGCGGCCAGCAAGTGACCAATCT > NC_002947/6066080‑6066369 | ctgcGCTTGCACGACTGGCTGCGCAATCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCgg < 1:1329220/150‑1 (MQ=255) ttGCACGACTGGCTGCGCAATCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAg < 1:665120/150‑1 (MQ=255) gCACGACTGGCTGCGCAATCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGa > 1:236650/1‑150 (MQ=255) cACGACTGGCTGCGCAATCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCTGGTGCAGGAg > 2:576378/1‑150 (MQ=255) cACGACTGGCTGCGCAATCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCTGGTGCAGGAg > 2:576374/1‑150 (MQ=255) tGGCTGCGCAATCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCAcc > 2:376240/1‑150 (MQ=255) gCTGCGCAATCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACcgc > 2:867267/1‑150 (MQ=255) tGCGCAATCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCTGGTGCAGGAGTCCACcgctg < 1:576378/150‑1 (MQ=255) tGCGCAATCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCTGGTGCAGGAGTCCACcgctg < 1:576374/150‑1 (MQ=255) gcAATCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTCTTCGATAGCATCTACCACCGCCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCCGTGATCGACCGCGTGCAGGAGTCCACcgctgcgc > 1:1018957/1‑150 (MQ=255) tCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCATGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTcc > 1:206691/1‑136 (MQ=255) tCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCATGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTcc < 2:206691/136‑1 (MQ=255) cACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGt < 1:782629/150‑1 (MQ=255) cACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGt < 2:550683/150‑1 (MQ=255) aCCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCgg < 1:30770/122‑1 (MQ=255) aCCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCgg > 2:30770/1‑122 (MQ=255) aCCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTg > 1:1043834/1‑150 (MQ=255) cAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGAc > 2:157330/1‑150 (MQ=255) aCCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGAcgc > 1:591929/1‑150 (MQ=255) cccGACGCAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCAACAACAACGCCGCGACTAAAGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGAcgcg < 1:115436/150‑1 (MQ=255) cccGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGATGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCCACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGAcgcg > 1:528790/1‑150 (MQ=255) cccGACGAAGAACCGACCGATGGCTACTGCCGGGGGGGCGAGTTATTCGATAGCATCGACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTCCGGGGCCGACTGCAGGCAGCGATCGACCTGGTGCAGGAGGCCACCGCTGCGCTGCGTGAcgcg > 2:1177493/1‑150 (MQ=255) ccGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGGGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCgg < 2:224439/150‑1 (MQ=255) cgaCGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGAt < 1:70321/150‑1 (MQ=255) cgaAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCggg < 1:754775/113‑1 (MQ=255) cgaAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCggg > 2:754775/1‑113 (MQ=255) cACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGc < 2:1043834/150‑1 (MQ=255) aCCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCt > 2:620868/1‑150 (MQ=255) aCCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCt > 2:927971/1‑150 (MQ=255) ccGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTc < 2:1406173/150‑1 (MQ=255) cccGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGGGACGCGGTGATCATGGTCggc > 2:761250/1‑148 (MQ=255) gATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGc > 2:706041/1‑150 (MQ=255) ctatggCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACgg < 1:1381325/146‑1 (MQ=255) tACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGc > 2:133527/1‑150 (MQ=255) cgacgtgtgGGGCGAGGGATTCGATATCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGTCCAGCTGGAGGCAGGGATGCACCGGGGGCAGGAGTGCACCGCTGGGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCaa < 2:264954/145‑1 (MQ=255) ggCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAAc < 1:96497/150‑1 (MQ=255) cTGTGGGGCGATGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTg < 2:528790/150‑1 (MQ=255) cTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTg < 2:591929/150‑1 (MQ=255) cTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTg > 1:1554525/1‑150 (MQ=255) gCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAAtggt > 1:1633531/1‑150 (MQ=255) gCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAAtggt < 1:157330/150‑1 (MQ=255) gCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCACCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGCGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTTATCATGCTTGACAGCGACGGCAACCTGGAAtggt < 2:598010/150‑1 (MQ=255) aGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGa < 2:1633531/150‑1 (MQ=255) ggTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGaa > 2:821591/1‑150 (MQ=255) ggTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGaa < 2:1018957/150‑1 (MQ=255) gTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAAc < 2:1343641/150‑1 (MQ=255) ttCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGGTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTAGAATGGTGGAACcgc > 1:1252291/1‑150 (MQ=255) ttCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCTGTGATCATGCTCGACAGCGACTGCAACCTGGAATGGTGGAACcgc < 2:236650/150‑1 (MQ=255) ttCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACcgc < 1:71489/150‑1 (MQ=255) gCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAAc > 1:234858/1‑140 (MQ=255) gCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAAc < 2:234858/140‑1 (MQ=255) cATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCga < 1:867267/150‑1 (MQ=255) caccTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTctg > 1:1284798/1‑150 (MQ=255) gCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACcgc > 2:1454613/1‑130 (MQ=255) gCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACcgc < 1:1454613/130‑1 (MQ=255) gCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTggg < 1:133527/150‑1 (MQ=255) gccgcGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCa > 2:487896/1‑150 (MQ=255) gcgACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGa > 2:1049720/1‑150 (MQ=255) aCCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGTCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGAccc < 2:1554525/150‑1 (MQ=255) aCCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGAccc < 2:1284798/150‑1 (MQ=255) cAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGACCCca > 1:209224/1‑150 (MQ=255) 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gccTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGAc > 1:55279/1‑77 (MQ=255) gccTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGACCCCACAGGACGGCGGCCAGc < 1:1049720/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGAccc < 1:1448015/130‑1 (MQ=255) cTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGAccc > 2:1448015/1‑130 (MQ=255) atctgtaaTCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTTCGCTGCGTAACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGCTGGAATCACGCCGCGGCGACTCCGCTGGGCTTCAAGACCCCACAGGACGTCGCCCAGCAAGTGAc < 2:83922/143‑1 (MQ=255) tGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGAc < 1:561375/118‑1 (MQ=255) tGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGAc > 2:561375/1‑118 (MQ=255) tGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGAACCAACAGGAGCGTGGCCAGCAAGTGACCagat > 1:83922/1‑147 (MQ=255) gATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGACCCCACAGGACGGCGGCCAGCAAGTGACCAATCt < 1:476118/150‑1 (MQ=255) aCCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGACCCCACAGGACGGCGGCCAGCaa > 1:988346/1‑134 (MQ=255) aCCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGACCCCACAGGACGGCGGCCAGCaa < 2:988346/134‑1 (MQ=255) | CTGCGCTTGCACGACTGGCTGCGCAATCACCAACCCGACGAAGCACCGCCCGATGGCTACGGCCTGTGGGGCGAGGTATTCGATAGCATCTACCACCTGCAACGCCGCGACCAGCGCGTACGGGGCCGCCTGCAGGCAGTGATCGACCGGGTGCAGGAGTCCACCGCTGCGCTGCGTGACGCGGTGATCATGCTCGACAGCGACGGCAACCTGGAATGGTGGAACCGCGCCGCCGAGACTCTGCTGGGCTTCAAGACCCCACAGGACGGCGGCCAGCAAGTGACCAATCT > NC_002947/6066080‑6066369 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |