Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 898,208 | C→A | 5.9% | P30Q (CCA→CAA) | PP_0781 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 898,208 | 0 | C | A | 5.9% | 213.4 / 2.1 | 68 | P30Q (CCA→CAA) | PP_0781 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/29); new base A (2/2); total (37/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 |
CTACAACTGACTCAGAAACCTCCGATCCGAATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAATGGCAGACGGCGCACATGCTACGCCAGCGCTTCGTCGACCTCGAC > NC_002947/898061‑898356 | cTACAACTGACTCAGAAACCTCCGATCCGAATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCaa > 1:1317214/1‑150 (MQ=255) aCAACTGACTCAGAAACCTCCGATCCGAATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGc < 2:475823/150‑1 (MQ=40) aaCTGACTCAGAAACCTCCGATCCGAATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCgg < 1:500496/150‑1 (MQ=255) tCAGAAACCTCCGATCCGAATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAg < 1:1183628/150‑1 (MQ=35) tCAGAAACCTCCGATCCGAATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAg > 1:853419/1‑150 (MQ=35) aGAAACCTCCGATCCGAATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGtt > 2:404050/1‑150 (MQ=35) aaaCCTCCGATCCGAATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTcc < 1:404050/150‑1 (MQ=35) aaaCCTCCGATCCGAATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTcc > 1:158704/1‑150 (MQ=35) tccgatccgaATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCg < 1:893380/146‑1 (MQ=34) tccgatccgaATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCg > 2:893380/1‑146 (MQ=35) tccgatccgaATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCAcc > 2:1245362/1‑150 (MQ=35) tccgatccgaATCCATGATGGGATTTCCCCCTGAACACGTTGTGAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCAcc > 2:747235/1‑150 (MQ=25) ccgatccgaATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCa < 2:1153844/150‑1 (MQ=35) tccgaATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCTCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCt < 1:378381/150‑1 (MQ=25) tCCATGATGGGTTGTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATga > 2:1096331/1‑150 (MQ=25) tgatgGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATgaagaa < 1:96655/150‑1 (MQ=37) gatgGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGaagaag < 2:610925/150‑1 (MQ=37) atgGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGt > 1:1413873/1‑150 (MQ=38) tgGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGCGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTCCCGCAGCAGCCTCAATGAAGAAGtg > 1:346328/1‑149 (MQ=255) ggATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGc > 1:547038/1‑150 (MQ=39) gATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCCACACCTCCTGGCACGAGATGGATTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGcc > 1:610182/1‑150 (MQ=11) aTTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCt < 1:281210/150‑1 (MQ=39) tttCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTc > 2:1132770/1‑150 (MQ=39) cccTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTgg < 2:1317214/150‑1 (MQ=255) cTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCGATCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGc < 1:41522/150‑1 (MQ=255) acGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAAc > 1:1199819/1‑150 (MQ=255) gTTGACAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCGAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCt > 1:1439895/1‑150 (MQ=255) tCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTgcgc < 2:547038/150‑1 (MQ=255) gggAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAAt < 2:1474351/114‑1 (MQ=38) gggAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAAt > 1:1474351/1‑114 (MQ=38) agaCACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATc < 1:1245362/150‑1 (MQ=255) acCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATgaa > 2:953148/1‑110 (MQ=38) acCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATgaa < 1:953148/110‑1 (MQ=38) tCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCtg > 1:566324/1‑150 (MQ=255) gTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCACCCTGCGCCGGATCGACGCTGTgcg > 1:508732/1‑150 (MQ=255) ttACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCtt > 1:883448/1‑150 (MQ=255) ttACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCt > 2:72138/1‑149 (MQ=255) ttACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCt < 1:72138/149‑1 (MQ=255) atctcgtgccaggagggcacgaggtCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCt > 1:65338‑M2/26‑150 (MQ=255) atctcgtgccaggagggcacgaggtCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCAAAGc > 2:999761‑M2/26‑62 (MQ=255) atctcgtgccaggagggcacgaggtCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCAAAGc < 1:999761‑M2/37‑1 (MQ=255) atctcgtgccaggagggcacgagatCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCt > 1:231039‑M2/26‑150 (MQ=255) ACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCt > 1:747235‑M1/1‑150 (MQ=255) tctcgtgccaggagggcacgaggtCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCAAAGCGGTGGc > 2:654438‑M2/25‑67 (MQ=255) tctcgtgccaggagggcacgaggtCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCAAAGCGGTGGc < 1:654438‑M2/43‑1 (MQ=255) tctcgtgccaggagggcacgagatTGAGTCACGTTTCATCGCCATGGTGAGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTa > 2:60652‑M2/25‑150 (MQ=255) ctcgtgccaggagggcacgagatCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTgcgc > 1:592450‑M2/24‑120 (MQ=255) ctcgtgccaggagggcacgagatCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTgcgc < 2:592450‑M2/97‑1 (MQ=255) cTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTAc > 1:981438/1‑150 (MQ=255) cTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTAc > 2:1495631/1‑150 (MQ=255) cGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCa < 2:1199819/150‑1 (MQ=255) gccaggagggcacgagatCGAGTAACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGc < 2:231039‑M2/132‑1 (MQ=255) gCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGc < 2:1413873/150‑1 (MQ=255) cctcctGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCgg > 1:1329273/1‑55 (MQ=38) cctcctGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCgg < 2:1329273/55‑1 (MQ=38) cctGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAAt < 2:981438/150‑1 (MQ=255) gCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATgaag > 1:254183/1‑77 (MQ=255) gCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATgaag < 2:254183/77‑1 (MQ=255) gCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGc < 2:167742/129‑1 (MQ=255) gCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGc > 1:167742/1‑129 (MQ=255) aCGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCTCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAATGGCAGa > 2:884738/1‑150 (MQ=255) cGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAATGGCAGACGGCGca < 2:853419/150‑1 (MQ=255) aCGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAATGGCAGACGGCGCACATGCt > 2:643734/1‑150 (MQ=255) gtCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAATGGCAGACGGCGCACATGCTACGc < 2:1439895/150‑1 (MQ=255) tCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAATGGCAGACGGCGCACATGCTACGCCAgc > 2:581846/1‑150 (MQ=255) gtggGAGACCCAAGCGGTGGCCAGGTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTCAATGGCAGACGGCGCACATGCTACGCCAGCGCTtcgtc < 2:346328/150‑1 (MQ=255) gCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAATGGCAGACGGCGCACATGCTACGCCAGCGCTTCGTCGAcc < 1:643734/150‑1 (MQ=255) cTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAATGGCAGACGGCGCACATGCTACGCCAGCGCTTCGTCGACCt > 2:361707/1‑150 (MQ=255) ccAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAATGGCAGACGGCGCACATGCTACGCCAGCGCTtc < 2:236714/138‑1 (MQ=255) ccAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAATGGCAGACGGCGCACATGCTACGCCAGCGCTtc > 1:236714/1‑138 (MQ=255) ccAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAATGGCAGACGGCGCACATGCTACGCCAGCGCTTCGTCGACCTCGAc > 2:908863/1‑150 (MQ=255) | CTACAACTGACTCAGAAACCTCCGATCCGAATCCATGATGGGATTTCCCCCTGCACACGTTGTCAGGGAGACACCTCATGTACCTGGATTACCTCGTGCCCTCCTGGCACGAGATCGAGTCACGTGTCATCGCCATGGTGGGCTACCCAAGCGGTGGCCAGTTCCGCACCAGCCTCAATGAAGAAGTCGCCTCGCTGGGCCTCAACCTGCGCCGGATCGACGCTGTGCGCTCAGCCTTCTACCAGGCTGAATGGCAGACGGCGCACATGCTACGCCAGCGCTTCGTCGACCTCGAC > NC_002947/898061‑898356 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |