| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,202,860 | A→C | 6.2% | Q228P (CAG→CCG) | xcpY → | type II secretion pathway protein XcpY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,202,860 | 0 | A | C | 6.2% | 188.8 / 4.7 | 65 | Q228P (CAG→CCG) | xcpY | type II secretion pathway protein XcpY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (25/36); new base C (2/2); total (27/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.97e-01 | |||||||||||
GCGTGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCT > NC_002947/1202713‑1203007 | gCGTGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCagcagcagc > 2:799423/1‑150 (MQ=255)gCGTGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCagcagcagc < 2:756107/150‑1 (MQ=255) cGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGgctgc < 1:1347934/150‑1 (MQ=255) ccACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGgct > 2:1322590/1‑143 (MQ=255) ccACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGgct < 1:1322590/143‑1 (MQ=255) cACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCCGCTGCTGCTGGcgg < 2:1133013/150‑3 (MQ=255) ccGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCt > 2:1027079/1‑150 (MQ=255) gctaGTGCGGCACAGGACGTCCCTGAGCGGCAAGTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGGCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCTCTCGTTGCCCGCCGCCTCCCGCCATCAGCATCGGCTGCTGGCAGCTTGCCt < 1:1446199/147‑1 (MQ=255) aGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGt < 2:906540/150‑1 (MQ=255) ctgcACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTg < 1:1177247/150‑1 (MQ=255) ctgcACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTg > 2:910405/1‑150 (MQ=255) ggACGTCCCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGgctgc > 2:487378/1‑123 (MQ=255) ggACGTCCCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGgctgc < 1:487378/123‑1 (MQ=255) gTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCCAccccaaa > 1:1075604/1‑145 (MQ=255) tCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTgg < 1:448286/150‑1 (MQ=255) cGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTggg < 2:1059919/150‑1 (MQ=255) gCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTgggg < 1:1392901/150‑1 (MQ=255) gCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTgggg > 2:1324320/1‑150 (MQ=255) gCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTgggg < 1:230123/150‑1 (MQ=255) aaTTGGCCAACCGTATGTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTgg < 2:141638/150‑1 (MQ=255) 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aaCCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACAGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCa > 1:3920/1‑150 (MQ=255) aCCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAg > 1:19668/1‑150 (MQ=255) cGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCa > 1:286614/1‑150 (MQ=255) gcTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGgc < 1:512341/150‑1 (MQ=255) cTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGttt < 2:238555/112‑1 (MQ=255) cTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGttt > 1:238555/1‑112 (MQ=255) acacacTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAAc > 1:1141289/1‑150 (MQ=255) acTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTg > 2:600133/1‑150 (MQ=255) cTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTgg < 2:1141289/150‑1 (MQ=255) tGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACTGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGgc > 2:1122854/1‑150 (MQ=255) tGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGgc < 2:953193/150‑1 (MQ=255) tGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGgc < 1:1639652/150‑1 (MQ=255) tGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGgc > 2:740378/1‑150 (MQ=255) cccGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGgcgc > 2:900013/1‑150 (MQ=255) cGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCaa < 1:1505834/139‑1 (MQ=255) cGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCaa > 2:1505834/1‑139 (MQ=255) ggCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGACGCAAGGCTGGCGCAGc > 2:298505/1‑150 (MQ=255) tGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGttt > 2:854770/1‑93 (MQ=255) tGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGttt < 1:854770/93‑1 (MQ=255) tGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACAGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAgg < 2:3920/150‑1 (MQ=255) tCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCa < 1:1324320/150‑1 (MQ=255) cGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCAt < 1:900013/150‑1 (MQ=255) cgcCCGCAAGGTGCTCTCGTTGCCGGGGGCCTCGCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGt < 2:1244837/150‑1 (MQ=255) cgcCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTCCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTCGCGCAGCCAGGTCATTGCCGt < 2:560288/150‑1 (MQ=255) ccGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGAc > 1:1269907/1‑150 (MQ=255) cGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGAcc < 1:740378/150‑1 (MQ=255) gCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCg < 2:286614/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGa > 1:754657/1‑150 (MQ=255) ggcTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAg < 2:251338/149‑1 (MQ=255) cGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCCACCCTGGCGTCCGGCGCTGCTCTGGCGCAGCCAGCTGATGGCCTGGACCGGTGAGCAGGCCa < 2:430897/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCa < 1:591307/150‑1 (MQ=255) ggccgCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCg < 2:1009709/150‑1 (MQ=255) gccgccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCgg < 1:910405/150‑1 (MQ=255) gccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCAc < 1:600133/150‑1 (MQ=255) ccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCAcg > 2:648691/1‑150 (MQ=255) cccGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCgg > 2:138731/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGc > 1:1347383/1‑150 (MQ=255) tgCCAGCAGCCGCTGCTGCTGGCGGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAAt < 2:985526/75‑1 (MQ=37) tgCCAGCAGCCGCTGCTGCTGGCGGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAAt > 1:985526/2‑76 (MQ=37) tgCCAGCAGCCGCTGCTGCTGGCGGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGca > 1:1071128/2‑150 (MQ=255) ccAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTgg > 1:911519/1‑49 (MQ=255) ccAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTgg < 2:911519/49‑1 (MQ=255) agcagcGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGCCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGccc < 1:298505/150‑1 (MQ=255) gcagcGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCt > 2:1497618/1‑150 (MQ=255) | GCGTGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCT > NC_002947/1202713‑1203007 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |