Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,608,967 | A→T | 5.6% | L447Q (CTG→CAG) | PP_1411 ← | GGDEF domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,608,967 | 0 | A | T | 5.6% | 212.6 / 3.2 | 71 | L447Q (CTG→CAG) | PP_1411 | GGDEF domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/31); new base T (2/2); total (38/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.50e-01 |
TTGTCATTCATGGCGGGTTTCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTCCTCACCGCCCCACCGGCACAGTATATCTGACTGACGCAG > NC_002947/1608822‑1609115 | ttGTCATTCATGGCGGGTTTCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCGTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCgg > 2:640097/1‑150 (MQ=255) attcatGGCGGGTTTCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGt > 2:1055142/1‑150 (MQ=255) atGGCGGGTTTCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTgg > 2:1467183/1‑145 (MQ=255) atGGCGGGTTTCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTgg < 1:1467183/145‑1 (MQ=255) atGGCGGGTTTCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTc < 2:905903/150‑1 (MQ=255) atGGCGGGTTTCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTc < 2:1603861/150‑1 (MQ=255) atGGCGGGTTTCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTc > 1:4609/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTTCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCTTGTAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTa > 1:197691/1‑150 (MQ=255) cGGGTTTCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTaa < 1:721022/150‑1 (MQ=255) gggTTTCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAAc < 1:640097/150‑1 (MQ=255) tttCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGa > 2:1608597/1‑150 (MQ=255) tCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAg > 2:77788/1‑150 (MQ=255) cACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAgg > 2:432315/1‑150 (MQ=255) cACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAgg < 1:1355008/150‑1 (MQ=255) cACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTGGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAgg < 1:252010/150‑1 (MQ=255) cTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTc < 2:306330/150‑1 (MQ=255) tGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCa > 1:404076/1‑150 (MQ=255) tGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCa > 2:646891/1‑150 (MQ=255) gCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAg < 1:1608597/150‑1 (MQ=255) acacGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAgctgc > 1:477722/1‑150 (MQ=255) cacGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAgctgct < 2:477722/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTc > 1:1461372/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCTGCg < 1:1369140/109‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCTGCg > 2:1369140/1‑109 (MQ=255) ccTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGa > 1:532262/1‑150 (MQ=255) cTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGAt > 2:86252/1‑150 (MQ=255) tGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAgg < 2:1449529/124‑1 (MQ=255) tGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAgg > 1:1449529/1‑124 (MQ=255) ttGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGAttttt > 1:461918/1‑150 (MQ=255) ttGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGAttttt > 2:1401644/1‑150 (MQ=255) cGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGcc > 1:883369/1‑150 (MQ=255) aTAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCAc > 1:817299/1‑150 (MQ=255) tAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCAcc > 1:1357404/1‑150 (MQ=255) tAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCAcc > 1:775627/1‑150 (MQ=255) aaaGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCt < 1:1401644/150‑1 (MQ=255) aaaGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCCGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCt < 1:239041/150‑1 (MQ=255) gcgcgGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATg < 2:883369/150‑1 (MQ=255) ggTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCg > 2:587590/1‑92 (MQ=255) ggTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCg < 1:587590/92‑1 (MQ=255) gcgGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGcc < 2:461918/150‑1 (MQ=255) cagGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTc < 2:1318367/150‑1 (MQ=255) aGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTc > 2:661665/1‑65 (MQ=255) aGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTc < 1:661665/65‑1 (MQ=255) gggTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCgcagcagca > 1:452155/1‑150 (MQ=255) cccccGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGa < 1:646891/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTCCTc < 2:775627/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTCCTCa < 2:404076/150‑1 (MQ=255) aGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAAtt < 2:1577432/142‑1 (MQ=255) aGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAAtt > 1:1577432/1‑142 (MQ=255) gctgctCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTgg < 2:129977/106‑1 (MQ=255) gctgctCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTgg > 1:129977/1‑106 (MQ=255) tCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGc < 1:1240857/85‑1 (MQ=255) tCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGc > 2:1240857/1‑85 (MQ=255) tCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTc < 2:202001/136‑1 (MQ=255) tCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTc > 1:202001/1‑136 (MQ=255) aGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCTGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTCCTCACCGCCCCACCgg > 1:934301/1‑150 (MQ=255) gCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTc < 2:494659/132‑1 (MQ=255) gCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTc > 1:494659/1‑132 (MQ=255) gCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTCCTCACCGCCCCACCGGcc > 2:445597/1‑149 (MQ=255) gCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTCCTCACCGCCCCACCGGca > 1:1489213/1‑150 (MQ=255) gCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATCTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTCCTCACCGCCCCACCGGca > 1:242692/1‑150 (MQ=255) ggtggtCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTCCTCACCGCCCCACCGGCACAGTATATc < 2:242692/150‑1 (MQ=255) gacaaccAGCCGCTGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCACAGCAGCACGATGAATTCCTCACCGCCCCACCGGca < 1:1002481/135‑1 (MQ=255) gacaaccAGCCGCTGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCACAGCAGCACGATGAATTCCTCACCGCCCCACCGGca > 2:1002481/7‑141 (MQ=255) tggtCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTc > 2:1318963/1‑94 (MQ=255) tggtCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTc < 1:1318963/94‑1 (MQ=255) ggtCAGCCGCAGCGGATGGTTGTCGTAACTGAACGTCAGCTGATCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCGCCTCAATGGCCTGGCGCCCTTCAGCTTCGCGCAGTAGCACGTTGAATTCCTCACCGCCACACCGGCACAGTATATctga < 2:666091/150‑1 (MQ=255) tCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTCCTCACCGCCCCACCGGCACAGTATATctgact > 2:577635/1‑150 (MQ=255) cGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTcc < 1:276386/114‑1 (MQ=255) cGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTcc > 2:276386/1‑114 (MQ=255) cAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTCCTCACCGCCCCACCGGCACAGTATATCTGACTGACGCAg < 2:4609/150‑1 (MQ=255) | TTGTCATTCATGGCGGGTTTCACTGCAGACACGGTTGCGGCCAGCCTGCTTGGCACGATAAAGCGCGCGGTCGGCGCGGGTCAGCAGGGCGTGCAGGGTATCCCCCGGTTGCAGGCTGCTCAGGCCGATGCTGGTGGTCAGCCGCAGCGGCTGGTTGTCGTAACTGAAGGTCAGCTGCTCGGTGCGTCGGCGGATTTTTTCTGCCACCTCGATGGCCTGGCGGCCTTCAGCTTCGCGCAGCAGCACGATGAATTCCTCACCGCCCCACCGGCACAGTATATCTGACTGACGCAG > NC_002947/1608822‑1609115 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |