| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,062,795 | T→A | 5.1% | I556N (ATT→AAT) | PP_1838 → | membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,062,795 | 0 | T | A | 5.1% | 246.7 / 3.1 | 78 | I556N (ATT→AAT) | PP_1838 | membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/37); new base A (2/2); total (39/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
AGTTCTTCGAGAAGGCGCGTAAGGAGCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCA > NC_002947/2062648‑2062944 | aGTTCTTCGAGAAGGCGCGTAAGGAGCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTc > 1:1036112/1‑150 (MQ=255) ttcttcGAGAAGGCGCGTAAGGAGCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAg < 2:1516239/150‑1 (MQ=255) cttcGAGAAGGCGCGTAAGGAGCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAg > 1:815059/1‑148 (MQ=255) cttcGAGAAGGCGCGTAAGGAGCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAg < 2:815059/148‑1 (MQ=255) gagaAGGCGCGTAAGGAGCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAg > 2:1112160/1‑150 (MQ=255) gcgcGTAAGGAGCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTcggt < 1:1112160/150‑1 (MQ=255) gTAAGGAGCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTcggtgcgg > 2:150243/1‑150 (MQ=255) gTAAGGAGCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTcggtgcgg > 2:693320/1‑150 (MQ=255) aGGAGCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGa < 1:585919/150‑1 (MQ=255) ggAGCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGaa < 1:26388/150‑1 (MQ=255) gCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTATCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATca > 2:1615784/1‑150 (MQ=255) ttACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCacac > 1:71821/1‑150 (MQ=255) ttCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTc < 2:461256/118‑1 (MQ=255) ttCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTc > 1:461256/1‑118 (MQ=255) ttCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTcggtgcgg < 2:511854/136‑1 (MQ=255) ttCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTcggtgcgg > 1:511854/1‑136 (MQ=255) ttCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTg < 2:307868/150‑1 (MQ=255) ttCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTg < 2:307923/150‑1 (MQ=255) ggACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGga > 1:811299/1‑117 (MQ=255) ggACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGga < 2:811299/117‑1 (MQ=255) acCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAg > 1:1401630/1‑150 (MQ=255) acCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGAATGCCCGGGGCAATCAg > 2:1294924/1‑111 (MQ=255) acCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGAATGCCCGGGGCAATCAg < 1:1294924/111‑1 (MQ=255) ccTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGt > 1:143371/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGa < 2:71821/150‑1 (MQ=255) gTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGCGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATc > 2:623115/1‑150 (MQ=255) gTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTGCGTTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATc > 1:370216/1‑150 (MQ=255) tCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCg > 2:86262/1‑150 (MQ=255) cATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGt > 1:526587/1‑150 (MQ=255) aTCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGAGCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGGGCGGTGAATCACACCGTGGGTATCGAGGTCGACATCGTg > 2:621310/1‑150 (MQ=255) aTCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGaa > 1:475121/1‑104 (MQ=255) aTCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGaa < 2:475121/104‑1 (MQ=255) tcgtcgGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGc > 2:993712/1‑150 (MQ=255) tcgGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGAATGCCCGGGGCAATCa < 2:40699/94‑1 (MQ=255) tcgGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGAATGCCCGGGGCAATCa > 1:40699/1‑94 (MQ=255) cgGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGAc < 1:704823/150‑1 (MQ=255) tGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGACTCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACcat > 1:681601/1‑150 (MQ=255) tGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACcat > 1:1395760/1‑150 (MQ=255) gACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACcatc < 2:1092444/150‑1 (MQ=255) cATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATg > 1:741292/1‑150 (MQ=255) cATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATg > 2:1146975/1‑150 (MQ=255) ggCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGgc < 1:966425/150‑1 (MQ=255) cTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGgccg > 1:1423473/1‑150 (MQ=255) tttGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTc > 1:1248784/1‑79 (MQ=255) tttGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTc < 2:1248784/79‑1 (MQ=255) aaCCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTcg > 1:786609/1‑85 (MQ=255) aaCCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTcg < 2:786609/85‑1 (MQ=255) aaCCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGa > 2:73383/1‑94 (MQ=255) aaCCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGa < 1:73383/94‑1 (MQ=255) ccaccaGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTgg > 1:1554003/1‑150 (MQ=255) cagcagGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAg > 1:805698/1‑150 (MQ=255) agcagGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAgg < 2:1395760/150‑1 (MQ=255) aCCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGccac < 1:993712/150‑1 (MQ=255) cTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGc > 2:879974/1‑150 (MQ=255) gACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTgg < 1:879974/150‑1 (MQ=255) aCCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCCCCAgcactggt < 2:347462/150‑8 (MQ=255) ggCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGAGTACCTCACTCATTGTCTTATCTACCTTCATGGGTCGCCTGACTCCCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGgcgc > 1:849164/1‑150 (MQ=255) cTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCt < 2:454782/150‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGccac < 1:1343080/123‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGccac > 2:1343080/1‑123 (MQ=255) gTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAAc < 2:741292/150‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAAc < 2:1554003/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGa < 2:1580890/137‑1 (MQ=255) ccGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGa > 1:1580890/1‑137 (MQ=255) ctgATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGt < 2:143371/150‑1 (MQ=255) ctgATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTAGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGt < 1:291767/150‑1 (MQ=255) tgATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTg < 2:972528/150‑1 (MQ=255) tGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGAAAAGCTCGCGACCAGGGTGGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCa < 1:693320/150‑1 (MQ=255) gCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAg < 2:1401630/150‑1 (MQ=255) ccccGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAgg < 2:526587/150‑1 (MQ=255) cccGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAggg > 2:497029/1‑150 (MQ=255) cccGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAggg > 1:1478442/1‑150 (MQ=255) ccGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGc < 1:1615784/150‑1 (MQ=255) ccGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTCGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCCACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGc < 1:621310/150‑1 (MQ=255) cGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATgg < 1:1628393/75‑1 (MQ=255) cGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATgg > 2:1628393/1‑75 (MQ=255) cGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGc < 1:247275/132‑1 (MQ=255) cGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGc > 2:247275/1‑132 (MQ=255) ttCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCCGGGCGTAGGCa > 1:889679/1‑150 (MQ=255) | AGTTCTTCGAGAAGGCGCGTAAGGAGCCTTACTTCAAGGACACCCTGTTCGTCATCGTCGGTGACCATGGCTTTGGCAACCACCAGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCA > NC_002947/2062648‑2062944 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |