| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,351,640 | C→G | 9.1% | V33V (GTG→GTC) | PP_2066 ← | GntR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,351,640 | 0 | C | G | 9.1% | 238.0 / 14.2 | 77 | V33V (GTG→GTC) | PP_2066 | GntR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/35); new base G (5/2); total (40/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.57e-01 | |||||||||||
CGCGGGCTGCTGGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCGGCCGCCCACA > NC_002947/2351491‑2351788 | cgcgGGCTGCTGGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGccc > 1:1488482/1‑150 (MQ=255) gggCTGCTGGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCAcc < 2:176746/150‑1 (MQ=255) tgGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGCGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCCGGCTGCCCACCGGGTAGc > 2:1242727/1‑150 (MQ=255) gCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCgg > 2:931411/1‑150 (MQ=255) ccTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGc < 2:1488482/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGAGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGc < 2:1118946/150‑1 (MQ=255) gggTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCaa > 1:127336/1‑150 (MQ=255) ccACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGTAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCtt < 2:1278809/150‑1 (MQ=255) cACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTg > 1:700554/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGc > 2:312374/1‑150 (MQ=255) cgcTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATc < 1:312374/150‑1 (MQ=255) cgccgcGAGACCAGCCCGTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTcc < 2:121681/150‑1 (MQ=255) ccgcGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCtt < 1:931411/150‑1 (MQ=255) gcgACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGGCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTg > 2:89982/1‑150 (MQ=255) acacCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCa > 2:1256743/1‑150 (MQ=255) acacCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGAACGAGGTACAGCAAGGTG‑ACTGGCGTTCAGTGTAAAGGTCGCACAGCTGGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCa < 1:1600161/150‑1 (MQ=255) cacCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCAc > 2:1624774/1‑150 (MQ=255) acCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACg > 2:76543/1‑150 (MQ=255) cAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTgg < 2:1342353/119‑1 (MQ=255) cAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTgg > 1:1342353/1‑119 (MQ=255) cAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCCCggg > 2:366271/1‑149 (MQ=255) cccGTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGGGGGTCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGa < 2:624013/150‑1 (MQ=255) ttGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTa < 2:564202/150‑1 (MQ=255) gCAACTGGTCGATAGCGGCTC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTg < 2:1083723/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTggg < 2:938679/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTggg < 2:938644/150‑1 (MQ=255) aCTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGt < 2:240402/150‑1 (MQ=255) gTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCaa > 1:684634/1‑114 (MQ=255) gTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCaa < 2:684634/114‑1 (MQ=255) gTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAgc > 1:1044823/1‑137 (MQ=255) gTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAgc < 2:1044823/137‑1 (MQ=255) gTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCAt > 2:1001457/1‑150 (MQ=255) gTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCAt > 2:495724/1‑150 (MQ=255) tCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATa > 1:1507733/1‑150 (MQ=255) aTAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCg > 1:800028/1‑86 (MQ=255) aTAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCg < 2:800028/86‑1 (MQ=255) ac‑gcacCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCgg < 2:700554/150‑1 (MQ=255) gcacCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAACGTCTCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGc > 1:1278212/1‑150 (MQ=255) cacCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGtt > 2:595591/1‑127 (MQ=255) cacCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGtt < 1:595591/127‑1 (MQ=255) acCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTc < 2:718770/150‑1 (MQ=255) cGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTgg > 2:728753/1‑80 (MQ=255) cGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTgg < 1:728753/80‑1 (MQ=255) gCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAAtt < 1:1256743/150‑1 (MQ=255) ccGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGc < 1:75945/68‑1 (MQ=255) ccGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGc > 2:75945/1‑68 (MQ=255) gCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCAt > 2:97218/1‑150 (MQ=255) tCACATTGTAATGTTTGCATGGCTCGAAGACGATCGGGAGCTGGATGCCCACCGACACGCGTTCCCTACCAATAGCTTTCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCg < 2:716616/150‑1 (MQ=255) tCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCg > 1:1088379/1‑150 (MQ=255) acaTTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGt > 2:72682/1‑150 (MQ=255) ttGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCgg < 2:915870/50‑1 (MQ=255) ttGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCgg > 1:915870/1‑50 (MQ=255) tAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGc < 2:1439514/68‑1 (MQ=255) tAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGc > 1:1439514/1‑68 (MQ=255) aGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAgtgt < 2:1437651/150‑1 (MQ=255) gCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTg > 2:383809/1‑85 (MQ=255) gCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTg < 1:383809/85‑1 (MQ=255) gcaGCGCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCg > 2:1056732/2‑150 (MQ=255) acaGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCg > 1:190180/1‑150 (MQ=255) gCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGcc < 1:319379/150‑1 (MQ=255) cTCGACCTCGGTCGGCACCCGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCTCCGACAATCTCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTCGCGCGTTGCGTTCATACCTTTGCTCGAGCTCGCCAATTTCATCGGTTGTCCGTGTAACAGCggacc > 2:227080/1‑147 (MQ=255) gctacccggtgggCAGCCTGCTGCCGACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGATTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGaa > 1:116659/7‑150 (MQ=255) gAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAAt > 2:744055/1‑150 (MQ=255) aCTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCttt > 2:606865/1‑65 (MQ=255) aCTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCttt < 1:606865/65‑1 (MQ=255) cccggtgggCAGCCTGCTGCCGACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGt < 1:377001/122‑1 (MQ=255) cccggtgggCAGCCTGCTGCCGACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGt > 2:377001/3‑124 (MQ=255) tcggtcggCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTgg < 1:1087345/86‑1 (MQ=255) tcggtcggCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTgg > 2:1087345/1‑86 (MQ=255) ccggtgggCAGCCTGCTGCCGACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCg > 2:1392954/2‑150 (MQ=255) ccggtgggCAGCCTGCTGCCGACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACATTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCg > 1:924870/2‑150 (MQ=255) cggtgggCAGCCTGCTGCCGACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGc > 1:5866/1‑109 (MQ=255) cggtgggCAGCCTGCTGCCGACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGc < 2:5866/109‑1 (MQ=255) ggtcggCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAgc > 1:1259994/1‑77 (MQ=255) ggtcggCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAgc < 2:1259994/77‑1 (MQ=255) gCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGt > 1:161846/1‑74 (MQ=255) gCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGt < 2:161846/74‑1 (MQ=255) cTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCGgccgcc < 1:1624774/150‑1 (MQ=255) ccACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCCTCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCGGCCGCCaaca > 1:1621199/1‑150 (MQ=255) ccACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCGGCCGCCcaca > 1:1410220/1‑150 (MQ=255) ccACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCGGCCGCCcaca > 1:136392/1‑150 (MQ=255) cACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACgggg > 1:456508/1‑50 (MQ=255) cACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTg < 2:456508/52‑1 (MQ=255) | CGCGGGCTGCTGGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCAC‑GCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACTCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCGGCCGCCCACA > NC_002947/2351491‑2351788 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |