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(MQ=39) ttCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGc > 1:614681/1‑96 (MQ=39) ttCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtgt > 2:1320596/1‑150 (MQ=35) ttCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtgt < 1:463477/150‑1 (MQ=35) tCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTggg < 2:323925/135‑1 (MQ=37) tCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTggg > 1:323925/1‑135 (MQ=37) tCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGAATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGTCGATTtgtg > 2:1279254/1‑150 (MQ=21) cTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATTCCTGTCGGATCTACGTCACTGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGc < 2:306128/150‑1 (MQ=25) tGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGcc < 2:1438535/150‑1 (MQ=25) cACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTAGGATCTACTTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCAc > 2:708038/1‑150 (MQ=255) cACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGCC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCAc < 2:1121336/150‑1 (MQ=255) gCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGc > 1:1353601/1‑88 (MQ=255) gCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGc < 2:1353601/88‑1 (MQ=255) tCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACCTCAc > 2:161238/1‑150 (MQ=34) | TTCTGCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGC‑AAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACCTCAC > NC_002947/4348633‑4348896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |