| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,258,237 | T→A | 5.6% | D323V (GAC→GTC) | PP_4635 ← | trans‑2‑enoyl‑CoA reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,258,237 | 0 | T | A | 5.6% | 218.0 / 2.9 | 71 | D323V (GAC→GTC) | PP_4635 | trans‑2‑enoyl‑CoA reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/34); new base A (2/2); total (35/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
CGGCGTAGTCAGTCAGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACT > NC_002947/5258097‑5258384 | cGGCGTAGTCAGTCAGCTCGAACAGGTTCTCGGTAGTATGCGGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGt < 1:904287/150‑1 (MQ=255) ggCGTAGTCAGTCAGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCCCAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGACGGTGCgccg < 1:1333643/150‑4 (MQ=255) ggCGTAGTCAGTCAGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGACGGTGCgccg < 2:1589612/150‑4 (MQ=255) tAGTCAGTCAGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATa > 1:864110/1‑150 (MQ=255) gtcagtcaGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGAACCGTCGGTGCGGTACATACg > 1:902145/1‑150 (MQ=255) gtcagCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTcg < 1:1079899/150‑1 (MQ=255) tcagCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTcgc > 2:1343123/1‑150 (MQ=255) agCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCgg < 2:864110/150‑1 (MQ=255) cTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCGCCTTAGCCTTCAAAGCAAAGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCACAGTCGTACAGGCGCAGGCGCACCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCTCACCGTCGGGGCGGTACATACAGTCGCGGTa > 2:608786/1‑150 (MQ=255) tCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCGTAGGATACAAAAAAAAACAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCACAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTAc > 2:137263/1‑150 (MQ=255) gAACAGGTTCTCGGTGGTCGCCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTAACGGCGCACCGAGGGGGCGGGACTGACCGTcgctattttg > 2:1172960/1‑143 (MQ=255) aGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCgg < 2:492511/150‑1 (MQ=255) ggtggtCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTg < 1:1343123/150‑1 (MQ=255) gtCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTcc > 2:540699/1‑150 (MQ=255) aCCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTgg > 1:1636508/1‑150 (MQ=255) aCCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTgg < 2:1248028/150‑1 (MQ=255) cTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGt < 2:844806/150‑1 (MQ=255) ccACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTc > 2:1549275/1‑150 (MQ=255) gggCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTgg > 2:855040/1‑137 (MQ=255) gggCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGAACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTgg < 1:855040/137‑1 (MQ=255) ggCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAac < 1:1549275/150‑1 (MQ=255) cTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGt > 1:1608179/1‑143 (MQ=255) cTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGt < 2:1608179/143‑1 (MQ=255) aGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTtct > 1:1405398/1‑150 (MQ=255) gCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTcc > 1:108872/1‑150 (MQ=255) cGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCt < 2:251463/150‑1 (MQ=255) gTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTtctc < 2:1608604/147‑1 (MQ=255) gTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTtctc > 1:1608604/1‑147 (MQ=255) ttttGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGc < 2:108872/150‑1 (MQ=255) gtcgtcACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATc < 1:349009/148‑1 (MQ=255) gtcgtcACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATc > 2:349009/1‑148 (MQ=255) tcACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGt > 2:1194809/1‑121 (MQ=255) tcACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGt < 1:1194809/121‑1 (MQ=255) tcACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAg < 2:1467374/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGc > 2:866532/1‑98 (MQ=255) gCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGc < 1:866532/98‑1 (MQ=255) gTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGa > 2:223641/1‑141 (MQ=255) gTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGa < 1:223641/141‑1 (MQ=255) cccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCttt > 1:1302390/1‑121 (MQ=255) cccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCttt < 2:1302390/121‑1 (MQ=255) ccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAg > 1:1097858/1‑150 (MQ=255) ccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAg > 1:349376/1‑150 (MQ=255) cAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAgg < 1:546727/150‑1 (MQ=255) aGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGt < 1:540699/150‑1 (MQ=255) tcCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCa > 1:1132922/1‑136 (MQ=255) tcCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCa < 2:1132922/136‑1 (MQ=255) ccAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTg < 1:137263/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTg < 1:177633/150‑1 (MQ=255) caggcgcaggcgCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTgg < 2:756499/91‑1 (MQ=255) caggcgcaggcgCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTgg > 1:756499/1‑91 (MQ=255) caggcgcaggcgCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGt > 1:221170/1‑101 (MQ=255) caggcgcaggcgCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGt < 2:221170/101‑1 (MQ=255) caggcgcaggcgCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCATTCGTGACAAGCTTTACTCTGGTCTATCCTTAAAACCATCGACAGGCACAGTgg > 2:177633/1‑150 (MQ=255) ttCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGa > 2:1236483/1‑112 (MQ=255) ttCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGa < 1:1236483/112‑1 (MQ=255) tcgtcgACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACTGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGAGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAg < 1:608786/150‑1 (MQ=255) gtcgACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTg < 1:808353/63‑1 (MQ=255) gtcgACCTATGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTg > 2:808353/1‑63 (MQ=255) cccTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGcc < 1:574253/149‑1 (MQ=255) ctctGCCGGCGCACCTTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTg > 2:568848/1‑150 (MQ=255) ctctGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTg > 1:311768/1‑150 (MQ=255) ctctGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTg > 2:54102/1‑150 (MQ=255) tctGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACGGTGATGGGCTTGCTGGCCTgg < 2:1636508/150‑1 (MQ=255) ggCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTgg > 2:746429/1‑57 (MQ=255) ggCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTgg < 1:746429/57‑1 (MQ=255) accgcACCGACGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAacc > 2:468620/3‑150 (MQ=255) gcgcACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGt < 1:1549902/113‑1 (MQ=255) gcgcACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGt > 2:1549902/1‑113 (MQ=255) cACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGTGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCg > 1:976245/1‑150 (MQ=255) aCCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGa > 1:145417/1‑150 (MQ=255) cGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTCGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACt < 2:1097858/150‑1 (MQ=255) | CGGCGTAGTCAGTCAGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACT > NC_002947/5258097‑5258384 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |