| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 6013891 | 21 (0.360) | 18 (0.390) | 16/210 | 2.1 | 46.9% | intergenic (+40/+70) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| ? | NC_002947 | = 6013919 | 24 (0.520) | intergenic (+68/+42) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein | |||||
AGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > NC_002947/6013742‑6014039 | agaAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTTATCGCATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGT < 2:649795‑M1/150‑1 (MQ=255) gaAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTg < 2:911007/150‑1 (MQ=255) gTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgcag < 1:299058/150‑1 (MQ=255) tCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAg < 2:1327582/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgca < 1:1206792/142‑1 (MQ=255) cAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgca > 2:1206792/1‑142 (MQ=255) aGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGtc > 2:1331202/1‑150 (MQ=255) aGGGCGGCCGTGCCGAACTGCAACGACCGGGATATCGCCTTGAAGCGCTGGCCCTGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGtc < 2:1112862/150‑1 (MQ=255) aGGGCGGCCGTGCACCACTGGCCAGCTAGTGGCCCGGCGTCTGATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGtc < 2:1113111/150‑1 (MQ=255) ggcggcCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGtctc < 2:331323/150‑1 (MQ=255) ccGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCtgtg < 1:1331202/150‑1 (MQ=255) cGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGc > 1:1381968/1‑150 (MQ=255) gatgcagttggggcagccgcaggggcttaaagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCg > 1:899305‑M1/97‑150 (MQ=255) tGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcac < 1:1359504‑M1/150‑31 (MQ=255) gcagttggggcagccgcaggggcttaaagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTAc > 2:1327757‑M1/94‑150 (MQ=255) gcagttggggcagccgcaggggcttaaagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTAc > 1:220633‑M1/94‑150 (MQ=255) agttggggcagccgcaggggcttaaagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCt > 2:638491‑M1/92‑150 (MQ=255) cAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgt < 1:685808‑M1/150‑35 (MQ=255) agcaggggttaccGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGATCAGTTGCGGCGAATAAACGCGAAACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgcagcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtg < 1:103305‑M1/145‑36 (MQ=255) aGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtg > 2:151921‑M1/1‑115 (MQ=255) gCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGt > 1:180556/1‑142 (MQ=255) gCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGt < 2:180556/142‑1 (MQ=255) gCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgg > 2:1373241‑M2/1‑142 (MQ=255) cAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtggga < 1:151921‑M1/150‑39 (MQ=255) gatctcgcgttgaaTCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCNANANGTacggcacagcgtnngagacctgtgctgcacctgtgggagcgg < 1:934502‑M1/145‑43 (MQ=255) cgcgTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagac > 2:1233504‑M1/1‑103 (MQ=255) cgcgTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagac < 1:1233504‑M1/122‑20 (MQ=255) gcgTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGTTCGAGACCTGTGCTGCacctgtgggagcgggagatc < 2:934502‑M2/150‑21 (MQ=255) tCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgcag > 1:957039/1‑98 (MQ=255) tCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgcag < 2:957039/98‑1 (MQ=255) tCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctg < 1:22822‑M2/127‑6 (MQ=255) tCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctg > 2:22822‑M2/1‑122 (MQ=255) aagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCtgt < 1:1032359‑M1/61‑1 (MQ=255) aagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCtgt > 2:1032359‑M1/68‑128 (MQ=255) ccGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCaa < 1:1212260/150‑1 (MQ=255) tttaccagcgcttgttgttggcggggcttgcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCtgtg > 2:565623‑M1/59‑120 (MQ=255) tttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCtgtg < 1:565623‑M1/62‑1 (MQ=255) cagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGc < 2:1161444‑M1/52‑1 (MQ=255) cagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGc > 1:1161444‑M1/54‑105 (MQ=255) gTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagc < 1:12443‑M2/117‑13 (MQ=255) gTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagc > 2:12443‑M2/1‑105 (MQ=255) gCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacct < 2:901692‑M1/106‑33 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gatctcccgctccCACAGGTgcagcacaggtctcgaacgctgtgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgc < 2:934502‑M1/145‑131 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCNNACGCTGTGCCGTacntntnggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcgagatc < 1:934502‑M2/150‑109 (MQ=255) gCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgac < 1:12443‑M1/117‑106 (MQ=255) gCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgac > 2:12443‑M1/1‑12 (MQ=255) GCTCCCACAGGTACGGCACAGCGTTCGAGACCTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTg < 2:957748‑M1/120‑1 (MQ=255) GCTCCCACAGGTACGGCACAGCGTTCGAGACCTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTg > 1:957748‑M1/1‑120 (MQ=255) 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2:225242‑M2/1‑36 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgttta < 1:225242‑M2/79‑44 (MQ=255) CCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc < 2:1266233‑M1/150‑1 (MQ=255) cacaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCTGCacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtttcgcgtttattcgccgcaactgatcacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaacccctgct < 1:103305‑M2/150‑116 (MQ=255) cacaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggct > 2:151921‑M2/1‑35 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctg < 1:685808‑M2/150‑117 (MQ=255) caGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcga < 1:22822‑M1/127‑123 (MQ=255) caGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcga > 2:22822‑M1/1‑5 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagc < 2:901692‑M2/106‑75 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagc > 1:901692‑M2/1‑32 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgat > 1:217772‑M2/1‑32 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgat < 2:217772‑M2/81‑50 (MQ=255) AGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt < 2:662915‑M1/150‑1 (MQ=255) AGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt < 1:949724‑M1/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtcca < 1:1359504‑M2/150‑121 (MQ=255) gTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagc > 2:426430‑M2/1‑30 (MQ=255) gTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagc < 1:426430‑M2/59‑30 (MQ=255) | AGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > NC_002947/6013742‑6014039 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |