New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4876493 | 125 (1.420) | 9 (0.110) | 6/222 | NT | 6.8% | intergenic (+286/+151) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase |
? | NC_002947 | = 4876523 | 136 (1.720) | intergenic (+316/+121) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase |
CGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4876332‑4876493 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacccgctcctacGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTATCC < NC_002947/4876523‑4876376 CGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAA < 1:500719/150‑1 GTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAA > 1:2101452/1‑150 GTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATAAAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAA < 1:1750582/150‑1 TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCC > 2:579412/1‑150 CGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGC < 1:1260316/150‑1 CGCGGGCAAGCGCGCTCCTACAACGGGGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGC < 2:403998/150‑1 GCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCT > 1:1136293/1‑150 GCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCT > 1:2162873/1‑150 GCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCT < 1:1455890/150‑1 CGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTC < 2:2162873/150‑1 GGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCC < 1:280603/150‑1 GGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCC > 2:1399228/1‑150 GTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA < 2:2101452/150‑1 GTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTC < 1:180229/147‑1 GTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTC > 2:180229/1‑147 TAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < 1:1039366/150‑1 CGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTC > 2:197416/1‑140 CGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTC < 1:197416/140‑1 ATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAG < 1:2108431/150‑1 TACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGG > 1:1520611/1‑150 CCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAAC < 2:1142779/99‑1 CCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAAC > 1:1142779/1‑99 CGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA < 2:1520611/150‑1 GGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGC < 1:610091/113‑1 GGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGC > 2:610091/1‑113 TGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAG < 2:2062255/101‑1 TGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAG > 1:2062255/1‑101 GGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGC > 2:1948676/1‑60 GGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGC < 1:1948676/60‑1 CGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAA < 1:114058/68‑1 CGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAA > 2:114058/1‑68 AACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGCCTACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCACCAGGGACGGCCTCTTCTCGGGTGTACCCGTTCCTACGGC > 1:404203/1‑150 CCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGGCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGG > 1:214606/1‑150 CCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGG > 1:1933108/1‑150 CCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGG > 1:1867004/1‑150 CGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGC < 1:2252709/150‑1 CGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTGACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGC < 1:1787601/150‑1 GCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCT < 1:1555935/150‑1 TCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGT > 2:1295188/1‑150 TCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGAGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTTGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTGGCGGGTGAACTTGCTCCGACGGCGGGCTGT > 2:123347/1‑150 CCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCAGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTA < 1:2222573/150‑1 CTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTAT < 1:2246616/150‑1 CTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTAT > 2:1145289/1‑150 CTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTG < 1:1607660/147‑1 CTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTG > 2:1607660/1‑147 TACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTAcc > 2:2019313/1‑148 TACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTATC > 1:649940/1‑150 TACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGG < 1:348794/121‑1 TACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGG > 2:348794/1‑121 ACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTATCC < 2:1260615/150‑1 ACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCG > 2:1335906/1‑119 ACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCG < 1:1335906/119‑1 CGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCT > 1:527930/1‑143 CGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCT < 2:527930/143‑1 CGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4876332‑4876493 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacccgctcctacGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTATCC < NC_002947/4876523‑4876376 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |