New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GCGAATGGCGGGTCGAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATATTTTCAGGTCAACCAGCGCAGTGGTGTGCGCTGGAATGCTTCCAAAGCTTTCCTGCGGCCGATCAAGGATCGCGCCAACCTCACTGTGCTGACCGGCGTGCAGGTTGACCAAGTACTGCTCGACAACACCCGCGCAAGGGCGGTGAAGGCGCTCTGGCAAGGGGCCTG > NC_002947/65382‑65676 | gCGAATGGCGGGTCGAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGGGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATATTTTCAGGTCAACCAGCGCAgtg < 2:1917566/150‑1 (MQ=255) gCGAATGGCGGGTCGAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATATTTTCAGGTCAACCAGCGCAgtg < 1:198578/150‑1 (MQ=255) aaaTGGCGGGTCGAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATATTTTCAGGTCAACCAGCGCAgtggt < 1:1602149/149‑1 (MQ=255) aaTGGCGGGTCGAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATATTTTCAGGTCAACCAGCGCAgtggtg < 2:1503742/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGTCGAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGAAATTTTCAGGGCAACCAGCGCAGTGGTGtg < 2:1886811‑M2/150‑3 (MQ=255) gCGGGTCGAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATATTTTCATGTCAACCAGCGCAGTGGGGtgcg < 2:274697‑M2/150‑5 (MQ=255) ggTCGAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATGTTTTCAGGTCAACCAGCGCAGTGGTGtgcgctg > 2:1406151‑M2/1‑143 (MQ=255) ggTCGAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATATTTTCAGGTCAACCAGCGCAGTGGTGtgcgctg > 2:1523958‑M2/1‑143 (MQ=255) tCGAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATATTTTCAGGTCAACCAGCGCAGTGGTGTGCGCTGGa > 2:818271/1‑150 (MQ=255) cGAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATATTTTCAGGTCAACCAGCGCAcaccactgcgctggtt < 2:128551‑M1/150‑17 (MQ=255) gAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTTGATATTTTCAGGTCAACCAGCGCAGTGGTGTGCGCTGGAAt < 1:2010842/150‑1 (MQ=255) aGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATATTTTCAGGTCAACCAGCGCAcaccactgcgctggttga < 2:1184103‑M1/150‑19 (MQ=255) aGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGACGCTTTCCGCGATCACACGGAACAAATCGGAATGGGCAGGTGCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATATTTTCAGGTCAACCAGCGCAGTGGTGTGCGCTGGaagg > 1:45182/1‑148 (MQ=255) 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aaCCAGCGCAGTGGTGtgcgctggttgacctgaaaatatccacaaccctggttgtcgccggtgttgaaatcgtcgaccttgccaataccgctctgctcggcggcatctcggaaagcatcaaggatcggccagctgtagcgttgccgctcg < 2:128551‑M2/150‑135 (MQ=255) aaCCAGCGCAGTGGTGTGCGCTGGAATGCTTCCAAAGCTTTCCTGCGGCCGATCAAGGATCGCGCCAACCTCACTGTGCTGACCGGCGTGCAGGTTGACCAAGTACTGCTCGACAACACCCGCGCAAGGGCGGTGAAGGCGCTCTGGCaa > 2:577923/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCAGTGGTGTGCGCTGGAATGCTTCCAAAGCTTTCCTGCGGCCGATCAAGGATCGCGCCAACCTCACTGTGCTGACCGGCGTGCAGGTTGACCAAGTACTGCTCGACTACACCCGCGCAAGGGCGGTGAAGGCGCTCTGGCAAgg < 1:1888231/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCAGTGGTGTGCGCTGGAATGCTTCCAAAGCTTTCCTGCGGCCGATCAAGGATCGCGCCAACCTCACTGTGCTGACCGGCGTGCAGGTTGACCAAGTACTGCTCGACAACACCCGCGCAAGGGCGGTGAAGGCGCTCTGGCAAgg < 1:480927/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCAGTGGTGTGCGCTGGAATGCTTCCAAAGCTTTCCTGCGGCCGATCAAGGATCGCGCCAACCTCACTGTGCTGACCGGCGTGCAGCTTGTTCGCCGGTCCCGCGACAACACCCGCGCAAGGGCGGTGAAGGCGCTCTGGCAAgg > 2:651641/1‑150 (MQ=255) cAGCGCAcaccactgcgctggttgacctgaaaatatccacaaccctggttgtcgccggtgttgaaatcgtcgaccttgccaataccgctctgctcggcggcatctcggaaagcatcaaggatcggccagctgtagcgttgccgctcgacc > 2:1523958‑M1/1‑7 (MQ=255) cAGCGCAcaccactgcgctggttgacctgaaaacatccacaaccctggttgtcgccggtgttgaaatcgtcgaccttgccaataccgctctgctcggcggcatctcggaaagcatcaaggatcggccagctgtagcgttgccgctcgacc > 2:1406151‑M1/1‑7 (MQ=255) cAGCGCAGTGGTGTGCGCTGGAATGCTTCCAAAGCTTTCCTGCGGCCGATCAAGGATCGCGCCAACCTCACTGTGCTGACCGGCGTGCAGGTTGACCAAGTACTGCTCGACAACACCCGCGCAAGGGCGGTGAAGGCGCTCTGGCAAggg > 1:1420777/1‑150 (MQ=255) cAGCGCAGTGGTGTGCGCTGGAATGCTTCCAAAGCTTTCCTGCGGCCGATCAAGGATCGCGCCAACCTCACTGTGCTGACCGGCGTGCAGGTTGACCAAGTACTGCTCGACAACACCCGCGCAAGGGCGGTGAAGGCGCTCTGGCAAggg > 2:656348/1‑150 (MQ=255) cgcAccccactgcgctggttgacatgaaaatatccacaaccctggttgtcgccggtgttgaaatcgtcgaccttgccaataccgctctgctcggcggcatctcggaaagcatcaaggatcggccagctgtagcgttgccgctcgacccgc < 2:274697‑M1/150‑147 (MQ=255) cacaccactgcgctggttgccctgaaaatttccacaaccctggttgtcgccggtgttgaaatcgtcgaccttgccaataccgctctgctcggcggcatctcggaaagcatcaaggatcggccagctgtagcgttgccgctcgacccgcca < 2:1886811‑M1/150‑149 (MQ=255) | GCGAATGGCGGGTCGAGCGGCAACGCTACAGCTGGCCGATCCTTGATGCTTTCCGAGATGCCGCCGAGCAGAGCGGTATTGGCAAGGTCGACGATTTCAACACCGGCGACAACCAGGGTTGTGGATATTTTCAGGTCAACCAGCGCAGTGGTGTGCGCTGGAATGCTTCCAAAGCTTTCCTGCGGCCGATCAAGGATCGCGCCAACCTCACTGTGCTGACCGGCGTGCAGGTTGACCAAGTACTGCTCGACAACACCCGCGCAAGGGCGGTGAAGGCGCTCTGGCAAGGGGCCTG > NC_002947/65382‑65676 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |